RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.48□□□□□ -1.05
RBM39-240ENST00000495293 ZBBXA8MT70 800 aa8.47□□□□□ -1.05
RBM39-240ENST00000495293 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.47□□□□□ -1.05
RBM39-240ENST00000495293 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.47□□□□□ -1.05
RBM39-240ENST00000495293 BICRAQ9NZM4 1560 aa8.47□□□□□ -1.05
RBM39-240ENST00000495293 WHAMMQ8TF30 809 aa8.46□□□□□ -1.06
RBM39-240ENST00000495293 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.46□□□□□ -1.06
RBM39-240ENST00000495293 SCTRP47872 440 aa8.45□□□□□ -1.06
RBM39-240ENST00000495293 PNMA1Q8ND90 353 aa8.45□□□□□ -1.06
RBM39-240ENST00000495293 SEPT12Q8IYM1 358 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM39-240ENST00000495293 SNRKQ9NRH2 765 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM39-240ENST00000495293 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM39-240ENST00000495293 CDC14CA4D256 554 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM39-240ENST00000495293 RHOQP17081 205 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM39-240ENST00000495293 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RBM39-240ENST00000495293 ERVK-9P63128 1117 aa8.42□□□□□ -1.06
RBM39-240ENST00000495293 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.42□□□□□ -1.06
RBM39-240ENST00000495293 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RBM39-240ENST00000495293 GAS6Q14393 721 aa8.41□□□□□ -1.06
RBM39-240ENST00000495293 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.4□□□□□ -1.06
RBM39-240ENST00000495293 SLURP2P0DP57 97 aa8.4□□□□□ -1.06
RBM39-240ENST00000495293 NR1H3Q13133 447 aa8.4□□□□□ -1.06
RBM39-240ENST00000495293 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.4□□□□□ -1.06
RBM39-240ENST00000495293 A0A1W2PRU2 124 aa8.39□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 SV2AQ7L0J3 742 aa8.39□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.39□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.38□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 MEN1O00255 615 aa8.37□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.37□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.37□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 BANK1Q8NDB2 785 aa8.37□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 TRAK2O60296 914 aa8.36□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 ARHGEF15O94989 841 aa8.36□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.36□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 GPR25O00155 361 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 SOCS7O14512 581 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 GDF11O95390 407 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 RASSF7Q02833 373 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 DBN1Q16643 649 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.35□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 ADAMTS2O95450 1211 aa8.34□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 POU4F2Q12837 409 aa8.34□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.34□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 SVOPQ8N4V2 548 aa8.34□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.34□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.34□□□□□ -1.07
RBM39-240ENST00000495293 THBS1P07996 1170 aa8.33□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 CLN3Q13286 438 aa8.33□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 GPC1P35052 558 aa8.32□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 IRF5Q13568 498 aa8.32□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 IL2RAP01589 272 aa8.31□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 RNF20Q5VTR2 975 aa8.31□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.31□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.3□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.3□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 NBPF15Q8N660 670 aa8.3□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.3□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.29□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.29□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.28□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.28□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.28□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RBM39-240ENST00000495293 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 CCDC125Q86Z20 511 aa8.27□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa8.26□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 CNKSR1Q969H4 720 aa8.26□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 NLRP3Q96P20 1036 aa8.26□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 MBIPQ9NS73 344 aa8.26□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 IGF1RP08069 1367 aa8.25□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 IRS1P35568 1242 aa8.25□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 CENPCQ03188 943 aa8.25□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 XP32Q5T750 250 aa8.25□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.25□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 GNRH1P01148 92 aa8.24□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 PHKA2P46019 1235 aa8.24□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 ACDQ96AP0 544 aa8.24□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.24□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 VAC14Q08AM6 782 aa8.23□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.23□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.23□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 GMCL1Q96IK5 515 aa8.23□□□□□ -1.09
RBM39-240ENST00000495293 ETNK1Q9HBU6 452 aa8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms