RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491804.1

MFSD1-218, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene MFSD1, Length 312 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-218ENST00000491804 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.78■■□□□ 1.88
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MFSD1-218ENST00000491804 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.76■■□□□ 1.87
MFSD1-218ENST00000491804 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
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MFSD1-218ENST00000491804 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.75■■□□□ 1.87
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MFSD1-218ENST00000491804 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.74■■□□□ 1.87
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MFSD1-218ENST00000491804 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.43■■□□□ 1.82
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MFSD1-218ENST00000491804 C4BP0C0L5 1744 aa26.41■■□□□ 1.82
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MFSD1-218ENST00000491804 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.38■■□□□ 1.81
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MFSD1-218ENST00000491804 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.37■■□□□ 1.81
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MFSD1-218ENST00000491804 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.37■■□□□ 1.81
MFSD1-218ENST00000491804 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.34■■□□□ 1.81
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MFSD1-218ENST00000491804 PHF14O94880 888 aa26.33■■□□□ 1.81
MFSD1-218ENST00000491804 SMIM5Q71RC9 77 aa26.33■■□□□ 1.81
MFSD1-218ENST00000491804 MORC1Q86VD1 984 aa26.33■■□□□ 1.81
MFSD1-218ENST00000491804 ATG3Q9NT62 314 aa26.33■■□□□ 1.81
MFSD1-218ENST00000491804 GRIN3BO60391 1043 aa26.32■■□□□ 1.8
MFSD1-218ENST00000491804 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.32■■□□□ 1.85e-6■■■□□ 19.1
MFSD1-218ENST00000491804 SSFA2P28290 1259 aa26.32■■□□□ 1.8
MFSD1-218ENST00000491804 ATP6V1AP38606 617 aa26.32■■□□□ 1.8
MFSD1-218ENST00000491804 ITPK1Q13572 414 aa26.32■■□□□ 1.8
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