RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491261.1

GTPBP4-204, Transcript of GTP binding protein 4, human

TSL 2

Gene GTPBP4, Length 373 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP4-204	ENST00000491261	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		11.34	□□□□□ -0.59
GTPBP4-204	ENST00000491261	BCL9	O00512	1426 aa		11.34	□□□□□ -0.59
GTPBP4-204	ENST00000491261	ERBB3	P21860	1342 aa		11.34	□□□□□ -0.59
GTPBP4-204	ENST00000491261	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	EXOC5	O00471	708 aa		11.33	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		11.33	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	11.31	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	IP6K1	Q92551	441 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	PLSCR1	O15162	318 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	NBPF14	Q5TI25	921 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	CFAP53	Q96M91	514 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	LRRC37A3	O60309	1634 aa		11.29	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	IL2RB	P14784	551 aa		11.29	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	IL13	P35225	146 aa		11.29	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	INSR	P06213	1382 aa		11.28	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	TNS2	Q63HR2	1409 aa		11.28	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	AMPH	P49418	695 aa		11.28	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	11.28	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	RGPD5	Q99666	1765 aa		11.28	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	RTL1	A6NKG5	1358 aa		11.28	□□□□□ -0.6
GTPBP4-204	ENST00000491261	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	HMOX1	P09601	288 aa		11.27	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		11.27	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		11.27	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	LTN1	O94822	1766 aa		11.26	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	APAF1	O14727	1248 aa		11.26	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	HOXC9	P31274	260 aa		11.26	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		11.26	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	LRP5	O75197	1615 aa		11.25	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		11.24	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	FLT4	P35916	1363 aa		11.24	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	RREB1	Q92766	1687 aa		11.24	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	SBF2	Q86WG5	1849 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	PRKAR2B	P31323	418 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	NEUROD2	Q15784	382 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	NUDC	Q9Y266	331 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	RUNDC1	Q96C34	613 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	EYA1	Q99502	592 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
GTPBP4-204	ENST00000491261	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		11.21	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	NBPF4	Q96M43	638 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	KCNQ2	O43526	872 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	FCHSD2	O94868	740 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	TXNRD1	Q16881	649 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	PROM2	Q8N271	834 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	SPON1	Q9HCB6	807 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	NHS	Q6T4R5	1651 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	ZNF521	Q96K83	1311 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	STK32B	Q9NY57	414 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	SLC15A2	Q16348	729 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	MEGF6	O75095	1541 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GTPBP4-204	ENST00000491261	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		11.15	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.7 ms