RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
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NELFE-210ENST00000491139 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
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NELFE-210ENST00000491139 AMPHP49418 695 aa29.43■■■□□ 2.3
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NELFE-210ENST00000491139 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
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NELFE-210ENST00000491139 NBPF4Q96M43 638 aa29.32■■■□□ 2.28
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NELFE-210ENST00000491139 RTL1A6NKG5 1358 aa29.31■■■□□ 2.28
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NELFE-210ENST00000491139 CD2APQ9Y5K6 639 aa29.24■■■□□ 2.27
NELFE-210ENST00000491139 FYB1O15117 783 aa29.23■■■□□ 2.27
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NELFE-210ENST00000491139 INSRP06213 1382 aa29.17■■■□□ 2.26
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NELFE-210ENST00000491139 CYP27B1O15528 508 aa29.14■■■□□ 2.26
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NELFE-210ENST00000491139 NSD3Q9BZ95 1437 aa29.07■■■□□ 2.24
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NELFE-210ENST00000491139 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
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NELFE-210ENST00000491139 SMIM5Q71RC9 77 aa29.04■■■□□ 2.24
NELFE-210ENST00000491139 UBR3Q6ZT12 1888 aa29.04■■■□□ 2.24
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NELFE-210ENST00000491139 SPG7Q9UQ90 795 aa29.03■■■□□ 2.24
NELFE-210ENST00000491139 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa29.02■■■□□ 2.24
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NELFE-210ENST00000491139 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.02■■■□□ 2.24
NELFE-210ENST00000491139 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.01■■■□□ 2.23
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NELFE-210ENST00000491139 NCAPD2Q15021 1401 aa28.97■■■□□ 2.23
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NELFE-210ENST00000491139 GNPATO15228 680 aa28.96■■■□□ 2.23
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NELFE-210ENST00000491139 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.94■■■□□ 2.22
NELFE-210ENST00000491139 ITPK1Q13572 414 aa28.93■■■□□ 2.22
NELFE-210ENST00000491139 EYA1Q99502 592 aa28.93■■■□□ 2.22
NELFE-210ENST00000491139 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.91■■■□□ 2.22
NELFE-210ENST00000491139 MMP10P09238 476 aa28.9■■■□□ 2.22
NELFE-210ENST00000491139 KIF3CO14782 793 aa28.89■■■□□ 2.22
NELFE-210ENST00000491139 PHKG2P15735 406 aa28.89■■■□□ 2.22
NELFE-210ENST00000491139 ATG3Q9NT62 314 aa28.88■■■□□ 2.21
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