RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 TATP17735 454 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
NISCH-214ENST00000490425 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
NISCH-214ENST00000490425 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
NISCH-214ENST00000490425 EYA1Q99502 592 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-214ENST00000490425 PARD3Q8TEW0 1356 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-214ENST00000490425 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-214ENST00000490425 SHANK3Q9BYB0 1731 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-214ENST00000490425 NHSQ6T4R5 1651 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-214ENST00000490425 RREB1Q92766 1687 aa16.37■□□□□ 0.21
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NISCH-214ENST00000490425 PLSCR1O15162 318 aa16.36■□□□□ 0.21
NISCH-214ENST00000490425 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
NISCH-214ENST00000490425 NUP188Q5SRE5 1749 aa16.36■□□□□ 0.21
NISCH-214ENST00000490425 PROM2Q8N271 834 aa16.34■□□□□ 0.21
NISCH-214ENST00000490425 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
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NISCH-214ENST00000490425 MTHFSP49914 203 aa16.33■□□□□ 0.2
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NISCH-214ENST00000490425 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa16.33■□□□□ 0.2
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NISCH-214ENST00000490425 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa16.33■□□□□ 0.2
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NISCH-214ENST00000490425 CYP27B1O15528 508 aa16.32■□□□□ 0.2
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NISCH-214ENST00000490425 IGSF1Q8N6C5 1336 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-214ENST00000490425 DOT1LQ8TEK3 1739 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-214ENST00000490425 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-214ENST00000490425 NBPF14Q5TI25 921 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-214ENST00000490425 PKD1L3Q7Z443 1732 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-214ENST00000490425 IL13P35225 146 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-214ENST00000490425 AEBP1Q8IUX7 1158 aa16.3■□□□□ 0.2
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NISCH-214ENST00000490425 SPG7Q9UQ90 795 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-214ENST00000490425 SULT6B1Q6IMI4 303 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-214ENST00000490425 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP16.27■□□□□ 0.24e-6■□□□□ 8.9
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NISCH-214ENST00000490425 KCNQ4P56696 695 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-214ENST00000490425 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-214ENST00000490425 IFNL2Q8IZJ0 200 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-214ENST00000490425 LRRC4BQ9NT99 713 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-214ENST00000490425 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-214ENST00000490425 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
NISCH-214ENST00000490425 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
NISCH-214ENST00000490425 HMOX1P09601 288 aa16.23■□□□□ 0.19
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NISCH-214ENST00000490425 STK32BQ9NY57 414 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-214ENST00000490425 KDRP35968 1356 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-214ENST00000490425 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
NISCH-214ENST00000490425 SLC15A2Q16348 729 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-214ENST00000490425 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
NISCH-214ENST00000490425 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
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NISCH-214ENST00000490425 ITGB4P16144 1822 aa16.21■□□□□ 0.19
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NISCH-214ENST00000490425 PPP2R1AP30153 589 aa16.2■□□□□ 0.18
NISCH-214ENST00000490425 ZNF827Q17R98 1081 aa16.2■□□□□ 0.18
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NISCH-214ENST00000490425 SLC27A3Q5K4L6 730 aa16.2■□□□□ 0.18
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NISCH-214ENST00000490425 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
NISCH-214ENST00000490425 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
NISCH-214ENST00000490425 PALLDQ8WX93 1383 aa16.18■□□□□ 0.18
NISCH-214ENST00000490425 TMOD3Q9NYL9 352 aa16.18■□□□□ 0.18
NISCH-214ENST00000490425 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
NISCH-214ENST00000490425 C1orf141Q5JVX7 400 aa16.17■□□□□ 0.18
NISCH-214ENST00000490425 CFAP53Q96M91 514 aa16.17■□□□□ 0.18
NISCH-214ENST00000490425 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
NISCH-214ENST00000490425 CASZ1Q86V15 1759 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-214ENST00000490425 ZBTB7AO95365 584 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-214ENST00000490425 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
NISCH-214ENST00000490425 AKT1S1Q96B36 256 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-214ENST00000490425 DCAF5Q96JK2 942 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-214ENST00000490425 ASAP1Q9ULH1 1129 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-214ENST00000490425 ERVV-2B6SEH9 535 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-214ENST00000490425 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
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NISCH-214ENST00000490425 SPON1Q9HCB6 807 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 CABP4P57796 275 aa16.13■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 ATG3Q9NT62 314 aa16.13■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa16.13■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 AKAP4Q5JQC9 854 aa16.12■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa16.11■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 SIK1P57059 783 aa16.11■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 LGR6Q9HBX8 967 aa16.11■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 NUDCQ9Y266 331 aa16.11■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa16.11■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 C5P01031 1676 aa16.11■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 RSPH6AQ9H0K4 717 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 PRKAR2BP31323 418 aa16.09■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 ITPK1Q13572 414 aa16.09■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 PHACTR3Q96KR7 559 aa16.09■□□□□ 0.17
NISCH-214ENST00000490425 TAF1LQ8IZX4 1826 aa16.09■□□□□ 0.17
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