RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 MTFR1LQ9H019 292 aa31.23■■■□□ 2.59
POLR2F-211ENST00000488684 KIF20BQ96Q89 1820 aa31.23■■■□□ 2.59
POLR2F-211ENST00000488684 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
POLR2F-211ENST00000488684 SGIP1Q9BQI5 828 aa31.21■■■□□ 2.59
POLR2F-211ENST00000488684 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.21■■■□□ 2.59
POLR2F-211ENST00000488684 NSD2O96028 1365 aa31.19■■■□□ 2.58
POLR2F-211ENST00000488684 INSRP06213 1382 aa31.19■■■□□ 2.58
POLR2F-211ENST00000488684 DOT1LQ8TEK3 1739 aa31.19■■■□□ 2.58
POLR2F-211ENST00000488684 KCNQ4P56696 695 aa31.18■■■□□ 2.58
POLR2F-211ENST00000488684 SLC27A3Q5K4L6 730 aa31.18■■■□□ 2.58
POLR2F-211ENST00000488684 AKT1S1Q96B36 256 aa31.18■■■□□ 2.58
POLR2F-211ENST00000488684 NSD3Q9BZ95 1437 aa31.17■■■□□ 2.58
POLR2F-211ENST00000488684 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.17■■■□□ 2.58
POLR2F-211ENST00000488684 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
POLR2F-211ENST00000488684 YY1P25490 414 aa31.16■■■□□ 2.58
POLR2F-211ENST00000488684 FLT4P35916 1363 aa31.16■■■□□ 2.58
POLR2F-211ENST00000488684 DCAF8L1A6NGE4 600 aa31.15■■■□□ 2.58
POLR2F-211ENST00000488684 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa31.15■■■□□ 2.58
POLR2F-211ENST00000488684 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
POLR2F-211ENST00000488684 CGNL1Q0VF96 1302 aa31.15■■■□□ 2.58
POLR2F-211ENST00000488684 SYT17Q9BSW7 474 aa31.14■■■□□ 2.58
POLR2F-211ENST00000488684 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa31.14■■■□□ 2.58
POLR2F-211ENST00000488684 KIF24Q5T7B8 1368 aa31.14■■■□□ 2.58
POLR2F-211ENST00000488684 UTRNP46939 3433 aa31.13■■■□□ 2.57
POLR2F-211ENST00000488684 TATP17735 454 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
POLR2F-211ENST00000488684 LY75O60449 1722 aa31.11■■■□□ 2.57
POLR2F-211ENST00000488684 ARXQ96QS3 562 aa31.09■■■□□ 2.57
POLR2F-211ENST00000488684 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa31.08■■■□□ 2.57
POLR2F-211ENST00000488684 QSER1Q2KHR3 1735 aa31.07■■■□□ 2.56
POLR2F-211ENST00000488684 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa31.06■■■□□ 2.56
POLR2F-211ENST00000488684 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
POLR2F-211ENST00000488684 SLC16A10Q8TF71 515 aa31.05■■■□□ 2.56
POLR2F-211ENST00000488684 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
POLR2F-211ENST00000488684 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa31.05■■■□□ 2.56
POLR2F-211ENST00000488684 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa31.04■■■□□ 2.56
POLR2F-211ENST00000488684 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa31.04■■■□□ 2.56
POLR2F-211ENST00000488684 CYP27B1O15528 508 aa31.04■■■□□ 2.56
POLR2F-211ENST00000488684 POLR3GLQ9BT43 218 aa31.02■■■□□ 2.56
POLR2F-211ENST00000488684 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
POLR2F-211ENST00000488684 WASHC2AQ641Q2 1341 aa31.01■■■□□ 2.56
POLR2F-211ENST00000488684 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa31.01■■■□□ 2.55
POLR2F-211ENST00000488684 NCAPD2Q15021 1401 aa31■■■□□ 2.55
POLR2F-211ENST00000488684 POLKQ9UBT6 870 aa30.99■■■□□ 2.55
POLR2F-211ENST00000488684 MAP3K5Q99683 1374 aa30.99■■■□□ 2.55
POLR2F-211ENST00000488684 COL24A1Q17RW2 1714 aa30.98■■■□□ 2.55
POLR2F-211ENST00000488684 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa30.97■■■□□ 2.55
POLR2F-211ENST00000488684 EYA1Q99502 592 aa30.97■■■□□ 2.55
POLR2F-211ENST00000488684 PKD1L3Q7Z443 1732 aa30.96■■■□□ 2.55
POLR2F-211ENST00000488684 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
POLR2F-211ENST00000488684 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.95■■■□□ 2.55
POLR2F-211ENST00000488684 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa30.95■■■□□ 2.54
POLR2F-211ENST00000488684 POLD1P28340 1107 aa30.94■■■□□ 2.54
POLR2F-211ENST00000488684 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
POLR2F-211ENST00000488684 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
POLR2F-211ENST00000488684 ITGB4P16144 1822 aa30.93■■■□□ 2.54
POLR2F-211ENST00000488684 PALLDQ8WX93 1383 aa30.92■■■□□ 2.54
POLR2F-211ENST00000488684 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
POLR2F-211ENST00000488684 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
POLR2F-211ENST00000488684 PANK3Q9H999 370 aa30.9■■■□□ 2.54
POLR2F-211ENST00000488684 SPG7Q9UQ90 795 aa30.9■■■□□ 2.54
POLR2F-211ENST00000488684 MSH5O43196 834 aa30.89■■■□□ 2.54
POLR2F-211ENST00000488684 KLHL34Q8N239 644 aa30.89■■■□□ 2.54
POLR2F-211ENST00000488684 PIGBQ92521 554 aa30.89■■■□□ 2.54
POLR2F-211ENST00000488684 C5P01031 1676 aa30.89■■■□□ 2.54
POLR2F-211ENST00000488684 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
POLR2F-211ENST00000488684 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
POLR2F-211ENST00000488684 TAF1LQ8IZX4 1826 aa30.88■■■□□ 2.53
POLR2F-211ENST00000488684 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP30.87■■■□□ 2.53
POLR2F-211ENST00000488684 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
POLR2F-211ENST00000488684 CHD4Q14839 1912 aa30.84■■■□□ 2.53
POLR2F-211ENST00000488684 NLGN2Q8NFZ4 835 aa30.83■■■□□ 2.53
POLR2F-211ENST00000488684 GPR162Q16538 588 aa30.82■■■□□ 2.52
POLR2F-211ENST00000488684 MSL1Q68DK7 614 aa30.82■■■□□ 2.52
POLR2F-211ENST00000488684 PHKG2P15735 406 aa30.81■■■□□ 2.52
POLR2F-211ENST00000488684 AMIGO3Q86WK7 504 aa30.81■■■□□ 2.52
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
POLR2F-211ENST00000488684 IFNL2Q8IZJ0 200 aa30.8■■■□□ 2.52
POLR2F-211ENST00000488684 C4BP0C0L5 1744 aa30.79■■■□□ 2.52
POLR2F-211ENST00000488684 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
POLR2F-211ENST00000488684 FLAD1Q8NFF5 587 aa30.78■■■□□ 2.52
POLR2F-211ENST00000488684 TMOD3Q9NYL9 352 aa30.78■■■□□ 2.52
POLR2F-211ENST00000488684 IGSF1Q8N6C5 1336 aa30.77■■■□□ 2.52
POLR2F-211ENST00000488684 SMIM5Q71RC9 77 aa30.77■■■□□ 2.52
POLR2F-211ENST00000488684 ASAP1Q9ULH1 1129 aa30.77■■■□□ 2.52
POLR2F-211ENST00000488684 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa30.76■■■□□ 2.51
POLR2F-211ENST00000488684 SIK1P57059 783 aa30.76■■■□□ 2.51
POLR2F-211ENST00000488684 AK7Q96M32 723 aa30.75■■■□□ 2.51
POLR2F-211ENST00000488684 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
POLR2F-211ENST00000488684 LINC00116Q8NCU8 138 aa30.74■■■□□ 2.51
POLR2F-211ENST00000488684 UBR3Q6ZT12 1888 aa30.73■■■□□ 2.51
POLR2F-211ENST00000488684 MORC1Q86VD1 984 aa30.72■■■□□ 2.51
POLR2F-211ENST00000488684 ATG3Q9NT62 314 aa30.72■■■□□ 2.51
POLR2F-211ENST00000488684 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa30.71■■■□□ 2.51
POLR2F-211ENST00000488684 ITPK1Q13572 414 aa30.71■■■□□ 2.51
POLR2F-211ENST00000488684 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
POLR2F-211ENST00000488684 PHF14O94880 888 aa30.7■■■□□ 2.51
POLR2F-211ENST00000488684 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP30.68■■■□□ 2.53e-11■■■■□ 19.7
POLR2F-211ENST00000488684 ATP6V1AP38606 617 aa30.68■■■□□ 2.5
POLR2F-211ENST00000488684 KNSTRNQ9Y448 316 aa30.67■■■□□ 2.5
POLR2F-211ENST00000488684 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
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