RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 LMOD2Q6P5Q4 547 aa13.46□□□□□ -0.25
GTPBP1-211ENST00000487538 KDRP35968 1356 aa13.45□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 PLIN1O60240 522 aa13.45□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 PLEKHG5O94827 1062 aa13.44□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa13.44□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 IP6K1Q92551 441 aa13.44□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM83GA6ND36 823 aa13.43□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 VPS72Q15906 364 aa13.43□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 EXOC6Q8TAG9 804 aa13.43□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 EYA1Q99502 592 aa13.43□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 KIAA0232Q92628 1395 aa13.43□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 GCP02774 474 aa13.42□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 RARSP54136 660 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC136Q96JN2 1154 aa13.42□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 CRBNQ96SW2 442 aa13.42□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 IFT57Q9NWB7 429 aa13.42□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 DLG5Q8TDM6 1919 aa13.41□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 BCAR3O75815 825 aa13.41□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 GNAI1P63096 354 aa13.41□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 C20orf194Q5TEA3 1177 aa13.4□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGEF25Q86VW2 580 aa13.4□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 CPDO75976 1380 aa13.4□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa13.4□□□□□ -0.26
GTPBP1-211ENST00000487538 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa13.39□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB7CA1YPR0 619 aa13.39□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 CANXP27824 592 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 GAS2L2Q8NHY3 880 aa13.39□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 BTG4Q9NY30 223 aa13.39□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 COL18A1P39060 1754 aa13.39□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 WNK3Q9BYP7 1800 aa13.39□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF853P0CG23 659 aa13.38□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 PDE3AQ14432 1141 aa13.38□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 CFAP44Q96MT7 982 aa13.37□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa13.37□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa13.37□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 ABCC6O95255 1503 aa13.36□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF428Q96B54 188 aa13.36□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 PRDM11Q9NQV5 511 aa13.36□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 DCTN1Q14203 1278 aa13.35□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 CHRNA2Q15822 529 aa13.35□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 SEPT12Q8IYM1 358 aa13.35□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 MBIPQ9NS73 344 aa13.35□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 SMC4Q9NTJ3 1288 aa13.35□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 NCAPD2Q15021 1401 aa13.35□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 NBPF6Q5VWK0 638 aa13.34□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKRD24Q8TF21 1146 aa13.34□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 NBPF4Q96M43 638 aa13.34□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 BCL2L13Q9BXK5 485 aa13.34□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC37A3O60309 1634 aa13.34□□□□□ -0.27
GTPBP1-211ENST00000487538 CRB1P82279 1406 aa13.33□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 ALDH1L2Q3SY69 923 aa13.33□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa13.33□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 MCM10Q7L590 875 aa13.33□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 USHBP1Q8N6Y0 703 aa13.33□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 SSH1Q8WYL5 1049 aa13.33□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa13.33□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP3K5Q99683 1374 aa13.32□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 CHL1O00533 1208 aa13.32□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 MS4A1P11836 297 aa13.32□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF16BQ96L93 1317 aa13.32□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 RGPD5Q99666 1765 aa13.31□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 GNAT3A8MTJ3 354 aa13.31□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 PANK1Q8TE04 598 aa13.31□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 RGPD2P0DJD1 1756 aa13.3□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 VAMP4O75379 141 aa13.3□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 ERBB3P21860 1342 aa13.3□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 AAMPQ13685 434 aa13.29□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 KRT27Q7Z3Y8 459 aa13.29□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 AXIN2Q9Y2T1 843 aa13.29□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 COG6Q9Y2V7 657 aa13.29□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 AMOTQ4VCS5 1084 aa13.28□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 TSPYL6Q8N831 410 aa13.28□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 C8orf58Q8NAV2 365 aa13.28□□□□□ -0.28
GTPBP1-211ENST00000487538 STRN4Q9NRL3 753 aa13.28□□□□□ -0.28
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