RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486986.6

TDRKH-210, Transcript of tudor and KH domain containing, human

TSL 2

Gene TDRKH, Length 760 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TDRKH-210	ENST00000486986	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
TDRKH-210	ENST00000486986	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
TDRKH-210	ENST00000486986	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
TDRKH-210	ENST00000486986	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
TDRKH-210	ENST00000486986	NSD2	O96028	1365 aa		33.37	■■■□□ 2.93
TDRKH-210	ENST00000486986	NCAPD2	Q15021	1401 aa		33.36	■■■□□ 2.93
TDRKH-210	ENST00000486986	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		33.35	■■■□□ 2.93
TDRKH-210	ENST00000486986	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		33.33	■■■□□ 2.93
TDRKH-210	ENST00000486986	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		33.33	■■■□□ 2.93
TDRKH-210	ENST00000486986	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
TDRKH-210	ENST00000486986	LY75	O60449	1722 aa		33.33	■■■□□ 2.93
TDRKH-210	ENST00000486986	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TDRKH-210	ENST00000486986	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TDRKH-210	ENST00000486986	SLC15A2	Q16348	729 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TDRKH-210	ENST00000486986	SPON1	Q9HCB6	807 aa		33.27	■■■□□ 2.92
TDRKH-210	ENST00000486986	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		33.27	■■■□□ 2.92
TDRKH-210	ENST00000486986	STK32B	Q9NY57	414 aa		33.26	■■■□□ 2.91
TDRKH-210	ENST00000486986	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
TDRKH-210	ENST00000486986	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TDRKH-210	ENST00000486986	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TDRKH-210	ENST00000486986	ZNF827	Q17R98	1081 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TDRKH-210	ENST00000486986	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TDRKH-210	ENST00000486986	PANK3	Q9H999	370 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TDRKH-210	ENST00000486986	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TDRKH-210	ENST00000486986	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
TDRKH-210	ENST00000486986	ZBTB7A	O95365	584 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TDRKH-210	ENST00000486986	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
TDRKH-210	ENST00000486986	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
TDRKH-210	ENST00000486986	ITGB4	P16144	1822 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TDRKH-210	ENST00000486986	PTGER2	P43116	358 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TDRKH-210	ENST00000486986	CYP27B1	O15528	508 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TDRKH-210	ENST00000486986	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TDRKH-210	ENST00000486986	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TDRKH-210	ENST00000486986	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
TDRKH-210	ENST00000486986	KCNQ4	P56696	695 aa		33.16	■■■□□ 2.9
TDRKH-210	ENST00000486986	EYA1	Q99502	592 aa		33.16	■■■□□ 2.9
TDRKH-210	ENST00000486986	AKT1S1	Q96B36	256 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TDRKH-210	ENST00000486986	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		33.13	■■■□□ 2.89
TDRKH-210	ENST00000486986	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		33.13	■■■□□ 2.89
TDRKH-210	ENST00000486986	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		33.12	■■■□□ 2.89
TDRKH-210	ENST00000486986	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
TDRKH-210	ENST00000486986	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
TDRKH-210	ENST00000486986	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		33.11	■■■□□ 2.89
TDRKH-210	ENST00000486986	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
TDRKH-210	ENST00000486986	C5	P01031	1676 aa		33.1	■■■□□ 2.89
TDRKH-210	ENST00000486986	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TDRKH-210	ENST00000486986	MTFR1L	Q9H019	292 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TDRKH-210	ENST00000486986	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		33.05	■■■□□ 2.88
TDRKH-210	ENST00000486986	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TDRKH-210	ENST00000486986	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
TDRKH-210	ENST00000486986	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
TDRKH-210	ENST00000486986	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
TDRKH-210	ENST00000486986	PALLD	Q8WX93	1383 aa		33	■■■□□ 2.87
TDRKH-210	ENST00000486986	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.99	■■■□□ 2.87
TDRKH-210	ENST00000486986	UTRN	P46939	3433 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TDRKH-210	ENST00000486986	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TDRKH-210	ENST00000486986	MORC1	Q86VD1	984 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TDRKH-210	ENST00000486986	SPG7	Q9UQ90	795 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TDRKH-210	ENST00000486986	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TDRKH-210	ENST00000486986	PHKG2	P15735	406 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TDRKH-210	ENST00000486986	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TDRKH-210	ENST00000486986	C4B	P0C0L5	1744 aa		32.95	■■■□□ 2.87
TDRKH-210	ENST00000486986	PIGB	Q92521	554 aa		32.95	■■■□□ 2.87
TDRKH-210	ENST00000486986	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
TDRKH-210	ENST00000486986	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TDRKH-210	ENST00000486986	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
TDRKH-210	ENST00000486986	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.91	■■■□□ 2.86
TDRKH-210	ENST00000486986	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		32.91	■■■□□ 2.86
TDRKH-210	ENST00000486986	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		32.9	■■■□□ 2.86
TDRKH-210	ENST00000486986	MAP3K5	Q99683	1374 aa		32.89	■■■□□ 2.86
TDRKH-210	ENST00000486986	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.89	■■■□□ 2.86
TDRKH-210	ENST00000486986	ARX	Q96QS3	562 aa		32.89	■■■□□ 2.86
TDRKH-210	ENST00000486986	SYT17	Q9BSW7	474 aa		32.89	■■■□□ 2.86
TDRKH-210	ENST00000486986	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
TDRKH-210	ENST00000486986	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
TDRKH-210	ENST00000486986	KDR	P35968	1356 aa		32.86	■■■□□ 2.85
TDRKH-210	ENST00000486986	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		32.86	■■■□□ 2.85
TDRKH-210	ENST00000486986	IL13	P35225	146 aa		32.85	■■■□□ 2.85
TDRKH-210	ENST00000486986	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
TDRKH-210	ENST00000486986	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
TDRKH-210	ENST00000486986	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.83	■■■□□ 2.85
TDRKH-210	ENST00000486986	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.83	■■■□□ 2.85
TDRKH-210	ENST00000486986	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TDRKH-210	ENST00000486986	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TDRKH-210	ENST00000486986	SIK1	P57059	783 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TDRKH-210	ENST00000486986	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TDRKH-210	ENST00000486986	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TDRKH-210	ENST00000486986	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TDRKH-210	ENST00000486986	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
TDRKH-210	ENST00000486986	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
TDRKH-210	ENST00000486986	MTHFS	P49914	203 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TDRKH-210	ENST00000486986	ITPK1	Q13572	414 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TDRKH-210	ENST00000486986	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
TDRKH-210	ENST00000486986	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
TDRKH-210	ENST00000486986	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
TDRKH-210	ENST00000486986	SMIM5	Q71RC9	77 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TDRKH-210	ENST00000486986	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TDRKH-210	ENST00000486986	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		32.76	■■■□□ 2.83
TDRKH-210	ENST00000486986	POLD1	P28340	1107 aa		32.74	■■■□□ 2.83
TDRKH-210	ENST00000486986	MSL1	Q68DK7	614 aa		32.74	■■■□□ 2.83

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