RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486072.1

MIB2-212, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 3

Gene MIB2, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2-212ENST00000486072 LRRC4BQ9NT99 713 aa29.64■■■□□ 2.34
MIB2-212ENST00000486072 FYB1O15117 783 aa29.63■■■□□ 2.33
MIB2-212ENST00000486072 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
MIB2-212ENST00000486072 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.61■■■□□ 2.33
MIB2-212ENST00000486072 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
MIB2-212ENST00000486072 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
MIB2-212ENST00000486072 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
MIB2-212ENST00000486072 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
MIB2-212ENST00000486072 SGIP1Q9BQI5 828 aa29.58■■■□□ 2.33
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MIB2-212ENST00000486072 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.57■■■□□ 2.32
MIB2-212ENST00000486072 NBPF4Q96M43 638 aa29.57■■■□□ 2.32
MIB2-212ENST00000486072 KCNQ4P56696 695 aa29.56■■■□□ 2.32
MIB2-212ENST00000486072 CDCA8Q53HL2 280 aa29.56■■■□□ 2.32
MIB2-212ENST00000486072 SLC27A3Q5K4L6 730 aa29.56■■■□□ 2.32
MIB2-212ENST00000486072 AKT1S1Q96B36 256 aa29.55■■■□□ 2.32
MIB2-212ENST00000486072 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa29.55■■■□□ 2.32
MIB2-212ENST00000486072 SYT17Q9BSW7 474 aa29.54■■■□□ 2.32
MIB2-212ENST00000486072 LY75O60449 1722 aa29.54■■■□□ 2.32
MIB2-212ENST00000486072 QSER1Q2KHR3 1735 aa29.54■■■□□ 2.32
MIB2-212ENST00000486072 NSD3Q9BZ95 1437 aa29.54■■■□□ 2.32
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MIB2-212ENST00000486072 INSRP06213 1382 aa29.52■■■□□ 2.32
MIB2-212ENST00000486072 UTRNP46939 3433 aa29.5■■■□□ 2.31
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MIB2-212ENST00000486072 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.48■■■□□ 2.31
MIB2-212ENST00000486072 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
MIB2-212ENST00000486072 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa29.48■■■□□ 2.31
MIB2-212ENST00000486072 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
MIB2-212ENST00000486072 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.46■■■□□ 2.31
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MIB2-212ENST00000486072 MAP3K5Q99683 1374 aa29.44■■■□□ 2.3
MIB2-212ENST00000486072 KLHL34Q8N239 644 aa29.44■■■□□ 2.3
MIB2-212ENST00000486072 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa29.44■■■□□ 2.3
MIB2-212ENST00000486072 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.44■■■□□ 2.3
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MIB2-212ENST00000486072 POLD1P28340 1107 aa29.41■■■□□ 2.3
MIB2-212ENST00000486072 COL24A1Q17RW2 1714 aa29.41■■■□□ 2.3
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MIB2-212ENST00000486072 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.41■■■□□ 2.3
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MIB2-212ENST00000486072 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.39■■■□□ 2.3
MIB2-212ENST00000486072 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.39■■■□□ 2.3
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MIB2-212ENST00000486072 CYP27B1O15528 508 aa29.36■■■□□ 2.29
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MIB2-212ENST00000486072 PALLDQ8WX93 1383 aa29.36■■■□□ 2.29
MIB2-212ENST00000486072 CHD4Q14839 1912 aa29.35■■■□□ 2.29
MIB2-212ENST00000486072 NCAPD2Q15021 1401 aa29.35■■■□□ 2.29
MIB2-212ENST00000486072 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa29.34■■■□□ 2.29
MIB2-212ENST00000486072 ITGB4P16144 1822 aa29.34■■■□□ 2.29
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MIB2-212ENST00000486072 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
MIB2-212ENST00000486072 TAF1LQ8IZX4 1826 aa29.31■■■□□ 2.28
MIB2-212ENST00000486072 MSL1Q68DK7 614 aa29.3■■■□□ 2.28
MIB2-212ENST00000486072 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
MIB2-212ENST00000486072 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
MIB2-212ENST00000486072 NLGN2Q8NFZ4 835 aa29.28■■■□□ 2.28
MIB2-212ENST00000486072 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
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MIB2-212ENST00000486072 POLKQ9UBT6 870 aa29.26■■■□□ 2.27
MIB2-212ENST00000486072 SPG7Q9UQ90 795 aa29.26■■■□□ 2.27
MIB2-212ENST00000486072 C4BP0C0L5 1744 aa29.25■■■□□ 2.27
MIB2-212ENST00000486072 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
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MIB2-212ENST00000486072 AK7Q96M32 723 aa29.21■■■□□ 2.27
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MIB2-212ENST00000486072 PANK3Q9H999 370 aa29.19■■■□□ 2.26
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MIB2-212ENST00000486072 FLAD1Q8NFF5 587 aa29.18■■■□□ 2.26
MIB2-212ENST00000486072 UBR3Q6ZT12 1888 aa29.18■■■□□ 2.26
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MIB2-212ENST00000486072 TMOD3Q9NYL9 352 aa29.17■■■□□ 2.26
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MIB2-212ENST00000486072 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
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MIB2-212ENST00000486072 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa29.14■■■□□ 2.26
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MIB2-212ENST00000486072 IFNL2Q8IZJ0 200 aa29.14■■■□□ 2.26
MIB2-212ENST00000486072 LINC00116Q8NCU8 138 aa29.13■■■□□ 2.25
MIB2-212ENST00000486072 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
MIB2-212ENST00000486072 ASAP1Q9ULH1 1129 aa29.12■■■□□ 2.25
MIB2-212ENST00000486072 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.11■■■□□ 2.25
MIB2-212ENST00000486072 ITPK1Q13572 414 aa29.08■■■□□ 2.25
MIB2-212ENST00000486072 CD2APQ9Y5K6 639 aa29.07■■■□□ 2.24
MIB2-212ENST00000486072 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa29.06■■■□□ 2.24
MIB2-212ENST00000486072 GNPATO15228 680 aa29.06■■■□□ 2.24
MIB2-212ENST00000486072 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
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