RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483296.5

TIMM23B-204, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 23 homolog B, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM23B, Length 1,156 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23B-204ENST00000483296 ANP32CO43423 234 aa22.42■■□□□ 1.18
TIMM23B-204ENST00000483296 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.42■■□□□ 1.18
TIMM23B-204ENST00000483296 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TIMM23B-204ENST00000483296 KDRP35968 1356 aa22.41■■□□□ 1.18
TIMM23B-204ENST00000483296 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TIMM23B-204ENST00000483296 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.4■■□□□ 1.18
TIMM23B-204ENST00000483296 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.4■■□□□ 1.18
TIMM23B-204ENST00000483296 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TIMM23B-204ENST00000483296 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.4■■□□□ 1.18
TIMM23B-204ENST00000483296 BCL9O00512 1426 aa22.4■■□□□ 1.18
TIMM23B-204ENST00000483296 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TIMM23B-204ENST00000483296 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TIMM23B-204ENST00000483296 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TIMM23B-204ENST00000483296 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.37■■□□□ 1.17
TIMM23B-204ENST00000483296 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
TIMM23B-204ENST00000483296 FAM182BQ5T319 152 aa22.36■■□□□ 1.17
TIMM23B-204ENST00000483296 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TIMM23B-204ENST00000483296 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
TIMM23B-204ENST00000483296 HMOX1P09601 288 aa22.34■■□□□ 1.17
TIMM23B-204ENST00000483296 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.34■■□□□ 1.17
TIMM23B-204ENST00000483296 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TIMM23B-204ENST00000483296 FCHSD2O94868 740 aa22.32■■□□□ 1.16
TIMM23B-204ENST00000483296 NEFMP07197 916 aa22.32■■□□□ 1.16
TIMM23B-204ENST00000483296 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TIMM23B-204ENST00000483296 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.32■■□□□ 1.16
TIMM23B-204ENST00000483296 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.31■■□□□ 1.16
TIMM23B-204ENST00000483296 TRIM37O94972 964 aa22.3■■□□□ 1.16
TIMM23B-204ENST00000483296 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.3■■□□□ 1.16
TIMM23B-204ENST00000483296 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TIMM23B-204ENST00000483296 CYP27B1O15528 508 aa22.28■■□□□ 1.16
TIMM23B-204ENST00000483296 BAG6P46379 1132 aa22.28■■□□□ 1.16
TIMM23B-204ENST00000483296 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TIMM23B-204ENST00000483296 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TIMM23B-204ENST00000483296 PHKG2P15735 406 aa22.27■■□□□ 1.16
TIMM23B-204ENST00000483296 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.161e-7■■■■■ 47
TIMM23B-204ENST00000483296 EP400Q96L91 3159 aa22.26■■□□□ 1.15
TIMM23B-204ENST00000483296 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.26■■□□□ 1.15
TIMM23B-204ENST00000483296 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.26■■□□□ 1.15
TIMM23B-204ENST00000483296 PRKAR2BP31323 418 aa22.25■■□□□ 1.15
TIMM23B-204ENST00000483296 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.25■■□□□ 1.15
TIMM23B-204ENST00000483296 APBA3O96018 575 aa22.24■■□□□ 1.15
TIMM23B-204ENST00000483296 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.24■■□□□ 1.15
TIMM23B-204ENST00000483296 DCAF5Q96JK2 942 aa22.24■■□□□ 1.15
TIMM23B-204ENST00000483296 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TIMM23B-204ENST00000483296 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM23B-204ENST00000483296 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TIMM23B-204ENST00000483296 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM23B-204ENST00000483296 NHSQ6T4R5 1651 aa22.2■■□□□ 1.15
TIMM23B-204ENST00000483296 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TIMM23B-204ENST00000483296 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM23B-204ENST00000483296 PLSCR1O15162 318 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM23B-204ENST00000483296 SBF2Q86WG5 1849 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM23B-204ENST00000483296 KCNQ2O43526 872 aa22.18■■□□□ 1.14
TIMM23B-204ENST00000483296 MRS2Q9HD23 443 aa22.18■■□□□ 1.14
TIMM23B-204ENST00000483296 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TIMM23B-204ENST00000483296 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TIMM23B-204ENST00000483296 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.17■■□□□ 1.14
TIMM23B-204ENST00000483296 MAP3K5Q99683 1374 aa22.16■■□□□ 1.14
TIMM23B-204ENST00000483296 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.16■■□□□ 1.14
TIMM23B-204ENST00000483296 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TIMM23B-204ENST00000483296 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.16■■□□□ 1.14
TIMM23B-204ENST00000483296 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.16■■□□□ 1.14
TIMM23B-204ENST00000483296 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.15■■□□□ 1.14
TIMM23B-204ENST00000483296 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.15■■□□□ 1.14
TIMM23B-204ENST00000483296 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TIMM23B-204ENST00000483296 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.15■■□□□ 1.14
TIMM23B-204ENST00000483296 CABP4P57796 275 aa22.14■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.14■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 RUNDC1Q96C34 613 aa22.12■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.12■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.12■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.12■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.11■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 NFE2L2Q16236 605 aa22.1■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 PIGBQ92521 554 aa22.1■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 BTAF1O14981 1849 aa22.09■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.09■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.09■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 TEFQ10587 303 aa22.08■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.08■■□□□ 1.13
TIMM23B-204ENST00000483296 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.08■■□□□ 1.12
TIMM23B-204ENST00000483296 CCER2I3L3R5 266 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM23B-204ENST00000483296 TXNRD1Q16881 649 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM23B-204ENST00000483296 CCDC184Q52MB2 194 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM23B-204ENST00000483296 NBPF14Q5TI25 921 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM23B-204ENST00000483296 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM23B-204ENST00000483296 LGR6Q9HBX8 967 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM23B-204ENST00000483296 PALLDQ8WX93 1383 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM23B-204ENST00000483296 MRC1P22897 1456 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM23B-204ENST00000483296 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.04■■□□□ 1.12
TIMM23B-204ENST00000483296 ITGB4P16144 1822 aa22.04■■□□□ 1.12
TIMM23B-204ENST00000483296 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms