RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 VAMP4O75379 141 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 PKP1Q13835 747 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 PRR36Q9H6K5 1346 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 CHD1LQ86WJ1 897 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 SNX21Q969T3 373 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 GNAI1P63096 354 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 LTKP29376 864 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 DYNC1I1O14576 645 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA2012Q0VF49 1180 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 SASS6Q6UVJ0 657 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 USP32Q8NFA0 1604 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 ACEP12821 1306 aa19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 HDGFP51858 240 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC7Q96NW7 1537 aa19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 IL16Q14005 1332 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 NECTIN2Q92692 538 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC39Q9UFE4 941 aa19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 RBM25P49756 843 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 PNPLA6Q8IY17 1366 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 FOXO3O43524 673 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 NUCB2P80303 420 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 ROBO2Q9HCK4 1378 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 SLC4A10Q6U841 1118 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 TNRQ92752 1358 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 ALDH1L2Q3SY69 923 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 ADGRB2O60241 1585 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 CPS1P31327 1500 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 DIP2BQ9P265 1576 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 IFT57Q9NWB7 429 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-204ENST00000483092 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP44Q96MT7 982 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 GDPD2Q9HCC8 539 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 NUCB1Q02818 461 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 LMBRD1Q9NUN5 540 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 AMPHP49418 695 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 DDIT3P35638 169 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 EID1Q9Y6B2 187 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 LMOD3Q0VAK6 560 aa19.74■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 TERF1P54274 439 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM63CQ9P1W3 806 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 CDC45O75419 566 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF445P59923 1031 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 KIF2CQ99661 725 aa19.73■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 ST18O60284 1047 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 BMP2KLQ5H9B9 411 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP19.72■□□□□ 0.753e-6■■□□□ 12.1
CCSAP-204ENST00000483092 SIRT2Q8IXJ6 389 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 ATP7BP35670 1465 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 FGD1P98174 961 aa19.72■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 F6X3S4 739 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 GPT2Q8TD30 523 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 USP25Q9UHP3 1055 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 MED14O60244 1454 aa19.71■□□□□ 0.75
CCSAP-204ENST00000483092 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM2Q9UHN6 1383 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 SLC4A2P04920 1241 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 NLRP6P59044 892 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 RABEP1Q15276 862 aa19.7■□□□□ 0.74
CCSAP-204ENST00000483092 HS1BP3Q53T59 392 aa19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms