RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482429.1

LTB-212, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 2

Gene LTB, Length 1,388 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-212ENST00000482429 DOT1LQ8TEK3 1739 aa29.14■■■□□ 2.26
LTB-212ENST00000482429 KLHL34Q8N239 644 aa29.13■■■□□ 2.25
LTB-212ENST00000482429 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
LTB-212ENST00000482429 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
LTB-212ENST00000482429 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
LTB-212ENST00000482429 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.11■■■□□ 2.25
LTB-212ENST00000482429 NSD2O96028 1365 aa29.11■■■□□ 2.25
LTB-212ENST00000482429 TONSLQ96HA7 1378 aa29.11■■■□□ 2.25
LTB-212ENST00000482429 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
LTB-212ENST00000482429 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
LTB-212ENST00000482429 KCNQ4P56696 695 aa29.09■■■□□ 2.25
LTB-212ENST00000482429 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
LTB-212ENST00000482429 NLGN2Q8NFZ4 835 aa29.08■■■□□ 2.25
LTB-212ENST00000482429 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
LTB-212ENST00000482429 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.07■■■□□ 2.24
LTB-212ENST00000482429 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.07■■■□□ 2.24
LTB-212ENST00000482429 HOXC9P31274 260 aa29.07■■■□□ 2.24
LTB-212ENST00000482429 COG3Q96JB2 828 aa29.06■■■□□ 2.24
LTB-212ENST00000482429 AMPHP49418 695 aa29.04■■■□□ 2.24
LTB-212ENST00000482429 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
LTB-212ENST00000482429 MEGF6O75095 1541 aa29.04■■■□□ 2.24
LTB-212ENST00000482429 GRIN3BO60391 1043 aa29.03■■■□□ 2.24
LTB-212ENST00000482429 CEP350Q5VT06 3117 aa29.02■■■□□ 2.24
LTB-212ENST00000482429 RTL1A6NKG5 1358 aa29.01■■■□□ 2.23
LTB-212ENST00000482429 USP47Q96K76 1375 aa29.01■■■□□ 2.23
LTB-212ENST00000482429 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.01■■■□□ 2.23
LTB-212ENST00000482429 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
LTB-212ENST00000482429 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
LTB-212ENST00000482429 SLC24A1O60721 1099 aa28.98■■■□□ 2.23
LTB-212ENST00000482429 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
LTB-212ENST00000482429 TESK2Q96S53 571 aa28.98■■■□□ 2.23
LTB-212ENST00000482429 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.98■■■□□ 2.23
LTB-212ENST00000482429 MSH5O43196 834 aa28.97■■■□□ 2.23
LTB-212ENST00000482429 FBLN1P23142 703 aa28.97■■■□□ 2.23
LTB-212ENST00000482429 C5P01031 1676 aa28.95■■■□□ 2.23
LTB-212ENST00000482429 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.95■■■□□ 2.22
LTB-212ENST00000482429 NBPF4Q96M43 638 aa28.95■■■□□ 2.22
LTB-212ENST00000482429 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.93■■■□□ 2.22
LTB-212ENST00000482429 FLAD1Q8NFF5 587 aa28.92■■■□□ 2.22
LTB-212ENST00000482429 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.92■■■□□ 2.22
LTB-212ENST00000482429 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.92■■■□□ 2.22
LTB-212ENST00000482429 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
LTB-212ENST00000482429 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.9■■■□□ 2.22
LTB-212ENST00000482429 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
LTB-212ENST00000482429 MSL1Q68DK7 614 aa28.89■■■□□ 2.22
LTB-212ENST00000482429 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
LTB-212ENST00000482429 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.88■■■□□ 2.21
LTB-212ENST00000482429 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.87■■■□□ 2.21
LTB-212ENST00000482429 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.87■■■□□ 2.21
LTB-212ENST00000482429 ATP10DQ9P241 1426 aa28.87■■■□□ 2.21
LTB-212ENST00000482429 FYB1O15117 783 aa28.87■■■□□ 2.21
LTB-212ENST00000482429 IFFO2Q5TF58 517 aa28.87■■■□□ 2.21
LTB-212ENST00000482429 PALLDQ8WX93 1383 aa28.86■■■□□ 2.21
LTB-212ENST00000482429 INSRP06213 1382 aa28.85■■■□□ 2.21
LTB-212ENST00000482429 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.84■■■□□ 2.21
LTB-212ENST00000482429 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.83■■■□□ 2.21
LTB-212ENST00000482429 C4BP0C0L5 1744 aa28.83■■■□□ 2.21
LTB-212ENST00000482429 ITGB4P16144 1822 aa28.82■■■□□ 2.2
LTB-212ENST00000482429 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
LTB-212ENST00000482429 ADCY9O60503 1353 aa28.8■■■□□ 2.2
LTB-212ENST00000482429 FLT4P35916 1363 aa28.8■■■□□ 2.2
LTB-212ENST00000482429 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.8■■■□□ 2.2
LTB-212ENST00000482429 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.8■■■□□ 2.2
LTB-212ENST00000482429 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.79■■■□□ 2.2
LTB-212ENST00000482429 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
LTB-212ENST00000482429 UBR3Q6ZT12 1888 aa28.79■■■□□ 2.2
LTB-212ENST00000482429 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.78■■■□□ 2.2
LTB-212ENST00000482429 CYP27B1O15528 508 aa28.78■■■□□ 2.2
LTB-212ENST00000482429 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.78■■■□□ 2.2
LTB-212ENST00000482429 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.78■■■□□ 2.2
LTB-212ENST00000482429 AK7Q96M32 723 aa28.77■■■□□ 2.2
LTB-212ENST00000482429 TMF1P82094 1093 aa28.75■■■□□ 2.19
LTB-212ENST00000482429 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
LTB-212ENST00000482429 AMIGO3Q86WK7 504 aa28.73■■■□□ 2.19
LTB-212ENST00000482429 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
LTB-212ENST00000482429 NCAPD2Q15021 1401 aa28.71■■■□□ 2.19
LTB-212ENST00000482429 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.71■■■□□ 2.19
LTB-212ENST00000482429 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
LTB-212ENST00000482429 HSPA6P17066 643 aa28.71■■■□□ 2.19
LTB-212ENST00000482429 SSFA2P28290 1259 aa28.71■■■□□ 2.19
LTB-212ENST00000482429 PIGBQ92521 554 aa28.71■■■□□ 2.19
LTB-212ENST00000482429 PHF14O94880 888 aa28.68■■■□□ 2.18
LTB-212ENST00000482429 CDCA8Q53HL2 280 aa28.67■■■□□ 2.18
LTB-212ENST00000482429 SPG7Q9UQ90 795 aa28.67■■■□□ 2.18
LTB-212ENST00000482429 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.66■■■□□ 2.18
LTB-212ENST00000482429 SIK1P57059 783 aa28.66■■■□□ 2.18
LTB-212ENST00000482429 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
LTB-212ENST00000482429 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.66■■■□□ 2.18
LTB-212ENST00000482429 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.65■■■□□ 2.18
LTB-212ENST00000482429 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.64■■■□□ 2.18
LTB-212ENST00000482429 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.18
LTB-212ENST00000482429 SMIM5Q71RC9 77 aa28.63■■■□□ 2.17
LTB-212ENST00000482429 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
LTB-212ENST00000482429 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.62■■■□□ 2.17
LTB-212ENST00000482429 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.61■■■□□ 2.17
LTB-212ENST00000482429 KIF13BQ9NQT8 1826 aa28.6■■■□□ 2.17
LTB-212ENST00000482429 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.59■■■□□ 2.17
LTB-212ENST00000482429 WWC3Q9ULE0 1092 aa28.59■■■□□ 2.17
LTB-212ENST00000482429 KIF3CO14782 793 aa28.58■■■□□ 2.17
LTB-212ENST00000482429 GNPATO15228 680 aa28.58■■■□□ 2.17
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