RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, human

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME4-208	ENST00000481518	POLK	Q9UBT6	870 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PSME4-208	ENST00000481518	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PSME4-208	ENST00000481518	BTAF1	O14981	1849 aa		31.7	■■■□□ 2.67
PSME4-208	ENST00000481518	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
PSME4-208	ENST00000481518	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
PSME4-208	ENST00000481518	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
PSME4-208	ENST00000481518	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PSME4-208	ENST00000481518	TXNRD1	Q16881	649 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PSME4-208	ENST00000481518	NCAPD2	Q15021	1401 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PSME4-208	ENST00000481518	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PSME4-208	ENST00000481518	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PSME4-208	ENST00000481518	NSD2	O96028	1365 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PSME4-208	ENST00000481518	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
PSME4-208	ENST00000481518	EYA1	Q99502	592 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PSME4-208	ENST00000481518	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PSME4-208	ENST00000481518	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	31.58	■■■□□ 2.65
PSME4-208	ENST00000481518	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PSME4-208	ENST00000481518	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PSME4-208	ENST00000481518	PAPPA	Q13219	1627 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PSME4-208	ENST00000481518	CASZ1	Q86V15	1759 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PSME4-208	ENST00000481518	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
PSME4-208	ENST00000481518	MORC1	Q86VD1	984 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PSME4-208	ENST00000481518	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	31.56	■■■□□ 2.64
PSME4-208	ENST00000481518	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
PSME4-208	ENST00000481518	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		31.54	■■■□□ 2.64
PSME4-208	ENST00000481518	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		31.54	■■■□□ 2.64
PSME4-208	ENST00000481518	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	31.54	■■■□□ 2.64
PSME4-208	ENST00000481518	CYP27B1	O15528	508 aa		31.53	■■■□□ 2.64
PSME4-208	ENST00000481518	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PSME4-208	ENST00000481518	STK32B	Q9NY57	414 aa		31.51	■■■□□ 2.63
PSME4-208	ENST00000481518	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		31.5	■■■□□ 2.63
PSME4-208	ENST00000481518	SLC15A2	Q16348	729 aa		31.5	■■■□□ 2.63
PSME4-208	ENST00000481518	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63
PSME4-208	ENST00000481518	LY75	O60449	1722 aa		31.47	■■■□□ 2.63
PSME4-208	ENST00000481518	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		31.47	■■■□□ 2.63
PSME4-208	ENST00000481518	KCNQ4	P56696	695 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PSME4-208	ENST00000481518	ZNF827	Q17R98	1081 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PSME4-208	ENST00000481518	SPON1	Q9HCB6	807 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PSME4-208	ENST00000481518	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PSME4-208	ENST00000481518	SPG7	Q9UQ90	795 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PSME4-208	ENST00000481518	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	31.41	■■■□□ 2.62	8e-9	■■■□□ 15.5
PSME4-208	ENST00000481518	ZBTB7A	O95365	584 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PSME4-208	ENST00000481518	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
PSME4-208	ENST00000481518	ITGB4	P16144	1822 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PSME4-208	ENST00000481518	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	31.39	■■■□□ 2.62
PSME4-208	ENST00000481518	AKT1S1	Q96B36	256 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PSME4-208	ENST00000481518	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PSME4-208	ENST00000481518	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PSME4-208	ENST00000481518	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PSME4-208	ENST00000481518	PHKG2	P15735	406 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PSME4-208	ENST00000481518	IL13	P35225	146 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PSME4-208	ENST00000481518	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	31.34	■■■□□ 2.61
PSME4-208	ENST00000481518	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PSME4-208	ENST00000481518	MTHFS	P49914	203 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PSME4-208	ENST00000481518	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		31.32	■■■□□ 2.61
PSME4-208	ENST00000481518	PALLD	Q8WX93	1383 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PSME4-208	ENST00000481518	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PSME4-208	ENST00000481518	PTGER2	P43116	358 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PSME4-208	ENST00000481518	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PSME4-208	ENST00000481518	PIGB	Q92521	554 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PSME4-208	ENST00000481518	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
PSME4-208	ENST00000481518	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
PSME4-208	ENST00000481518	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
PSME4-208	ENST00000481518	KDR	P35968	1356 aa		31.29	■■■□□ 2.6
PSME4-208	ENST00000481518	C5	P01031	1676 aa		31.29	■■■□□ 2.6
PSME4-208	ENST00000481518	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PSME4-208	ENST00000481518	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PSME4-208	ENST00000481518	MTFR1L	Q9H019	292 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PSME4-208	ENST00000481518	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	31.25	■■■□□ 2.59
PSME4-208	ENST00000481518	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PSME4-208	ENST00000481518	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PSME4-208	ENST00000481518	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PSME4-208	ENST00000481518	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PSME4-208	ENST00000481518	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	31.23	■■■□□ 2.59
PSME4-208	ENST00000481518	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	31.23	■■■□□ 2.59
PSME4-208	ENST00000481518	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	31.23	■■■□□ 2.59
PSME4-208	ENST00000481518	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PSME4-208	ENST00000481518	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
PSME4-208	ENST00000481518	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PSME4-208	ENST00000481518	DCAF5	Q96JK2	942 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PSME4-208	ENST00000481518	C4B	P0C0L5	1744 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PSME4-208	ENST00000481518	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
PSME4-208	ENST00000481518	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
PSME4-208	ENST00000481518	HMOX1	P09601	288 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PSME4-208	ENST00000481518	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PSME4-208	ENST00000481518	ATG3	Q9NT62	314 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PSME4-208	ENST00000481518	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PSME4-208	ENST00000481518	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PSME4-208	ENST00000481518	SIK1	P57059	783 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PSME4-208	ENST00000481518	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PSME4-208	ENST00000481518	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	31.14	■■■□□ 2.58
PSME4-208	ENST00000481518	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PSME4-208	ENST00000481518	ITPK1	Q13572	414 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PSME4-208	ENST00000481518	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PSME4-208	ENST00000481518	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PSME4-208	ENST00000481518	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	31.11	■■■□□ 2.57
PSME4-208	ENST00000481518	ARX	Q96QS3	562 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PSME4-208	ENST00000481518	CABP4	P57796	275 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PSME4-208	ENST00000481518	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		31.08	■■■□□ 2.57
PSME4-208	ENST00000481518	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		31.08	■■■□□ 2.57

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