RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 PROM2Q8N271 834 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa11.15□□□□□ -0.62
CTPS1-209ENST00000480420 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 CASZ1Q86V15 1759 aa11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 NBPF6Q5VWK0 638 aa11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 NBPF4Q96M43 638 aa11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 CARD14Q9BXL6 1004 aa11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.14□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 DOT1LQ8TEK3 1739 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 DCAF8L1A6NGE4 600 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 TATP17735 454 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 KCNQ4P56696 695 aa11.13□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 CGNL1Q0VF96 1302 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 CHD4Q14839 1912 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 SLC15A2Q16348 729 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 KLHL34Q8N239 644 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 RTL1A6NKG5 1358 aa11.12□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 MEGF6O75095 1541 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 FLT4P35916 1363 aa11.11□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 BCL9O00512 1426 aa11.1□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 PANK3Q9H999 370 aa11.1□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 INSRP06213 1382 aa11.09□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa11.09□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa11.09□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 SHANK3Q9BYB0 1731 aa11.09□□□□□ -0.63
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF827Q17R98 1081 aa11.07□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 MORC1Q86VD1 984 aa11.07□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.07□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa11.07□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa11.07□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa11.06□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 MTFR1LQ9H019 292 aa11.06□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 SLC27A3Q5K4L6 730 aa11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 POLKQ9UBT6 870 aa11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 SPG7Q9UQ90 795 aa11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 ITGB4P16144 1822 aa11.05□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 EYA1Q99502 592 aa11.04□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.04□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 KIF24Q5T7B8 1368 aa11.03□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.03□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 CYP27B1O15528 508 aa11.03□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 POLD1P28340 1107 aa11.03□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 PTGER2P43116 358 aa11.03□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 ARXQ96QS3 562 aa11.03□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 LY75O60449 1722 aa11.03□□□□□ -0.64
CTPS1-209ENST00000480420 MSL1Q68DK7 614 aa11.02□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 C1QTNF8P60827 252 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 PAPPAQ13219 1627 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 NSD2O96028 1365 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 PALLDQ8WX93 1383 aa11.01□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 PHF14O94880 888 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 IFFO2Q5TF58 517 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 AKT1S1Q96B36 256 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 AK7Q96M32 723 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 SYT17Q9BSW7 474 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 C5P01031 1676 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 GPR162Q16538 588 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 IFNL2Q8IZJ0 200 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 PIGBQ92521 554 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 KIF7Q2M1P5 1343 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 TAF1LQ8IZX4 1826 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 SMIM5Q71RC9 77 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 PHKG2P15735 406 aa10.97□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 SULT6B1Q6IMI4 303 aa10.97□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 AEBP1Q8IUX7 1158 aa10.97□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 SLC16A10Q8TF71 515 aa10.97□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 SGIP1Q9BQI5 828 aa10.97□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.97□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 QSER1Q2KHR3 1735 aa10.97□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 CEP350Q5VT06 3117 aa10.96□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 ATP6V1AP38606 617 aa10.96□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 CABP4P57796 275 aa10.96□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 C1orf141Q5JVX7 400 aa10.96□□□□□ -0.65
CTPS1-209ENST00000480420 GNPATO15228 680 aa10.95□□□□□ -0.66
CTPS1-209ENST00000480420 HMOX1P09601 288 aa10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 5.9 ms