RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
SOBP-202ENST00000477448 KDRP35968 1356 aa34.27■■■■□ 3.08
SOBP-202ENST00000477448 SULT6B1Q6IMI4 303 aa34.26■■■■□ 3.08
SOBP-202ENST00000477448 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa34.25■■■■□ 3.07
SOBP-202ENST00000477448 AEBP1Q8IUX7 1158 aa34.25■■■■□ 3.07
SOBP-202ENST00000477448 CARD10Q9BWT7 1032 aa34.25■■■■□ 3.07
SOBP-202ENST00000477448 PRKAR2BP31323 418 aa34.25■■■■□ 3.07
SOBP-202ENST00000477448 CCDC125Q86Z20 511 aa34.25■■■■□ 3.07
SOBP-202ENST00000477448 ZBED9Q6R2W3 1325 aa34.24■■■■□ 3.07
SOBP-202ENST00000477448 NCAPD2Q15021 1401 aa34.23■■■■□ 3.07
SOBP-202ENST00000477448 APAF1O14727 1248 aa34.23■■■■□ 3.07
SOBP-202ENST00000477448 PDE3BQ13370 1112 aa34.23■■■■□ 3.07
SOBP-202ENST00000477448 NBPF6Q5VWK0 638 aa34.22■■■■□ 3.07
SOBP-202ENST00000477448 NBPF4Q96M43 638 aa34.22■■■■□ 3.07
SOBP-202ENST00000477448 NLRP2Q9NX02 1062 aa34.21■■■■□ 3.07
SOBP-202ENST00000477448 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa34.2■■■■□ 3.07
SOBP-202ENST00000477448 DEFB132Q7Z7B7 95 aa34.2■■■■□ 3.06
SOBP-202ENST00000477448 USHBP1Q8N6Y0 703 aa34.17■■■■□ 3.06
SOBP-202ENST00000477448 DLG5Q8TDM6 1919 aa34.17■■■■□ 3.06
SOBP-202ENST00000477448 DDB1Q16531 1140 aa34.15■■■■□ 3.06
SOBP-202ENST00000477448 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
SOBP-202ENST00000477448 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
SOBP-202ENST00000477448 NEFMP07197 916 aa34.14■■■■□ 3.06
SOBP-202ENST00000477448 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
SOBP-202ENST00000477448 FAM196AQ6ZSG2 479 aa34.14■■■■□ 3.06
SOBP-202ENST00000477448 PHACTR3Q96KR7 559 aa34.14■■■■□ 3.06
SOBP-202ENST00000477448 NGEFQ8N5V2 710 aa34.12■■■■□ 3.05
SOBP-202ENST00000477448 DISP2A7MBM2 1401 aa34.12■■■■□ 3.05
SOBP-202ENST00000477448 TRIM37O94972 964 aa34.11■■■■□ 3.05
SOBP-202ENST00000477448 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
SOBP-202ENST00000477448 LRRC37A3O60309 1634 aa34.1■■■■□ 3.05
SOBP-202ENST00000477448 TMPOP42166 694 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
SOBP-202ENST00000477448 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
SOBP-202ENST00000477448 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
SOBP-202ENST00000477448 WNK3Q9BYP7 1800 aa34.09■■■■□ 3.05
SOBP-202ENST00000477448 NEUROD2Q15784 382 aa34.07■■■■□ 3.04
SOBP-202ENST00000477448 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
SOBP-202ENST00000477448 NFE2L2Q16236 605 aa34.06■■■■□ 3.04
SOBP-202ENST00000477448 ZNF521Q96K83 1311 aa34.06■■■■□ 3.04
SOBP-202ENST00000477448 EXOC5O00471 708 aa34.05■■■■□ 3.04
SOBP-202ENST00000477448 IL2RBP14784 551 aa34.04■■■■□ 3.04
SOBP-202ENST00000477448 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
SOBP-202ENST00000477448 CCDC27Q2M243 656 aa34.04■■■■□ 3.04
SOBP-202ENST00000477448 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
SOBP-202ENST00000477448 RIPK4P57078 832 aa34.02■■■■□ 3.04
SOBP-202ENST00000477448 BAG6P46379 1132 aa34.01■■■■□ 3.04
SOBP-202ENST00000477448 WWC1Q8IX03 1113 aa34■■■■□ 3.03
SOBP-202ENST00000477448 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
SOBP-202ENST00000477448 TRIM35Q9UPQ4 493 aa33.99■■■■□ 3.03
SOBP-202ENST00000477448 MEGF6O75095 1541 aa33.99■■■■□ 3.03
SOBP-202ENST00000477448 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa33.98■■■■□ 3.03
SOBP-202ENST00000477448 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa33.97■■■■□ 3.03
SOBP-202ENST00000477448 APBA3O96018 575 aa33.97■■■■□ 3.03
SOBP-202ENST00000477448 PTF1AQ7RTS3 328 aa33.97■■■■□ 3.03
SOBP-202ENST00000477448 PKD1L3Q7Z443 1732 aa33.97■■■■□ 3.03
SOBP-202ENST00000477448 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
SOBP-202ENST00000477448 GAS2L2Q8NHY3 880 aa33.96■■■■□ 3.03
SOBP-202ENST00000477448 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa33.96■■■■□ 3.03
SOBP-202ENST00000477448 TNS2Q63HR2 1409 aa33.95■■■■□ 3.02
SOBP-202ENST00000477448 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
SOBP-202ENST00000477448 TATP17735 454 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
SOBP-202ENST00000477448 AMOTQ4VCS5 1084 aa33.92■■■■□ 3.02
SOBP-202ENST00000477448 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
SOBP-202ENST00000477448 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
SOBP-202ENST00000477448 GOLGA2Q08379 1002 aa33.91■■■■□ 3.02
SOBP-202ENST00000477448 LMOD3Q0VAK6 560 aa33.9■■■■□ 3.02
SOBP-202ENST00000477448 WDR63Q8IWG1 891 aa33.89■■■■□ 3.02
SOBP-202ENST00000477448 CDCA7LQ96GN5 454 aa33.89■■■■□ 3.02
SOBP-202ENST00000477448 CAMKK2Q96RR4 588 aa33.89■■■■□ 3.02
SOBP-202ENST00000477448 SBF2Q86WG5 1849 aa33.88■■■■□ 3.01
SOBP-202ENST00000477448 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
SOBP-202ENST00000477448 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP33.87■■■■□ 3.017e-8■□□□□ 10
SOBP-202ENST00000477448 SHANK3Q9BYB0 1731 aa33.86■■■■□ 3.01
SOBP-202ENST00000477448 MAP3K5Q99683 1374 aa33.86■■■■□ 3.01
SOBP-202ENST00000477448 KCNQ2O43526 872 aa33.85■■■■□ 3.01
SOBP-202ENST00000477448 ACSBG1Q96GR2 724 aa33.85■■■■□ 3.01
SOBP-202ENST00000477448 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
SOBP-202ENST00000477448 BCL9O00512 1426 aa33.84■■■■□ 3.01
SOBP-202ENST00000477448 GNAT3A8MTJ3 354 aa33.84■■■■□ 3.01
SOBP-202ENST00000477448 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
SOBP-202ENST00000477448 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
SOBP-202ENST00000477448 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
SOBP-202ENST00000477448 SLFN5Q08AF3 891 aa33.83■■■■□ 3.01
SOBP-202ENST00000477448 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
SOBP-202ENST00000477448 SPG7Q9UQ90 795 aa33.82■■■■□ 3
SOBP-202ENST00000477448 DCTN1Q14203 1278 aa33.81■■■■□ 3
SOBP-202ENST00000477448 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
SOBP-202ENST00000477448 IL16Q14005 1332 aa33.81■■■■□ 3
SOBP-202ENST00000477448 E9PSI1 815 aa33.8■■■■□ 3
SOBP-202ENST00000477448 AKAP4Q5JQC9 854 aa33.8■■■■□ 3
SOBP-202ENST00000477448 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
SOBP-202ENST00000477448 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa33.79■■■■□ 3
SOBP-202ENST00000477448 MCM10Q7L590 875 aa33.79■■■■□ 3
SOBP-202ENST00000477448 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
SOBP-202ENST00000477448 C1orf141Q5JVX7 400 aa33.78■■■■□ 3
SOBP-202ENST00000477448 SCN11AQ9UI33 1791 aa33.78■■■■□ 3
SOBP-202ENST00000477448 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
SOBP-202ENST00000477448 DUSP27Q5VZP5 1158 aa33.77■■■■□ 3
SOBP-202ENST00000477448 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
SOBP-202ENST00000477448 PHKG2P15735 406 aa33.74■■■□□ 2.99
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