RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476817.1

CTBP2-208, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 3

Gene CTBP2, Length 705 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-208	ENST00000476817	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CTBP2-208	ENST00000476817	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		28.77	■■■□□ 2.2
CTBP2-208	ENST00000476817	POLK	Q9UBT6	870 aa		28.77	■■■□□ 2.2
CTBP2-208	ENST00000476817	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
CTBP2-208	ENST00000476817	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
CTBP2-208	ENST00000476817	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
CTBP2-208	ENST00000476817	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		28.72	■■■□□ 2.19
CTBP2-208	ENST00000476817	BTAF1	O14981	1849 aa		28.72	■■■□□ 2.19
CTBP2-208	ENST00000476817	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		28.72	■■■□□ 2.19
CTBP2-208	ENST00000476817	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		28.72	■■■□□ 2.19
CTBP2-208	ENST00000476817	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
CTBP2-208	ENST00000476817	STK32B	Q9NY57	414 aa		28.71	■■■□□ 2.19
CTBP2-208	ENST00000476817	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
CTBP2-208	ENST00000476817	SLC15A2	Q16348	729 aa		28.7	■■■□□ 2.18
CTBP2-208	ENST00000476817	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		28.69	■■■□□ 2.18
CTBP2-208	ENST00000476817	NSD2	O96028	1365 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CTBP2-208	ENST00000476817	EYA1	Q99502	592 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CTBP2-208	ENST00000476817	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
CTBP2-208	ENST00000476817	SPON1	Q9HCB6	807 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CTBP2-208	ENST00000476817	NCAPD2	Q15021	1401 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CTBP2-208	ENST00000476817	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		28.67	■■■□□ 2.18
CTBP2-208	ENST00000476817	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		28.66	■■■□□ 2.18
CTBP2-208	ENST00000476817	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		28.66	■■■□□ 2.18
CTBP2-208	ENST00000476817	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		28.66	■■■□□ 2.18
CTBP2-208	ENST00000476817	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
CTBP2-208	ENST00000476817	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTBP2-208	ENST00000476817	CYP27B1	O15528	508 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTBP2-208	ENST00000476817	MORC1	Q86VD1	984 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTBP2-208	ENST00000476817	CASZ1	Q86V15	1759 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CTBP2-208	ENST00000476817	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CTBP2-208	ENST00000476817	PAPPA	Q13219	1627 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CTBP2-208	ENST00000476817	ZBTB7A	O95365	584 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CTBP2-208	ENST00000476817	ZNF827	Q17R98	1081 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CTBP2-208	ENST00000476817	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
CTBP2-208	ENST00000476817	SPG7	Q9UQ90	795 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CTBP2-208	ENST00000476817	KCNQ4	P56696	695 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CTBP2-208	ENST00000476817	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	28.57	■■■□□ 2.16
CTBP2-208	ENST00000476817	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CTBP2-208	ENST00000476817	AKT1S1	Q96B36	256 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CTBP2-208	ENST00000476817	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
CTBP2-208	ENST00000476817	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
CTBP2-208	ENST00000476817	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
CTBP2-208	ENST00000476817	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		28.54	■■■□□ 2.16
CTBP2-208	ENST00000476817	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
CTBP2-208	ENST00000476817	PTGER2	P43116	358 aa		28.53	■■■□□ 2.16
CTBP2-208	ENST00000476817	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		28.53	■■■□□ 2.16
CTBP2-208	ENST00000476817	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
CTBP2-208	ENST00000476817	MTFR1L	Q9H019	292 aa		28.51	■■■□□ 2.15
CTBP2-208	ENST00000476817	LY75	O60449	1722 aa		28.51	■■■□□ 2.15
CTBP2-208	ENST00000476817	PHKG2	P15735	406 aa		28.48	■■■□□ 2.15
CTBP2-208	ENST00000476817	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		28.48	■■■□□ 2.15
CTBP2-208	ENST00000476817	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		28.48	■■■□□ 2.15
CTBP2-208	ENST00000476817	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.47	■■■□□ 2.15
CTBP2-208	ENST00000476817	PIGB	Q92521	554 aa		28.47	■■■□□ 2.15
CTBP2-208	ENST00000476817	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		28.46	■■■□□ 2.15
CTBP2-208	ENST00000476817	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		28.46	■■■□□ 2.15
CTBP2-208	ENST00000476817	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		28.45	■■■□□ 2.15
CTBP2-208	ENST00000476817	PALLD	Q8WX93	1383 aa		28.45	■■■□□ 2.14
CTBP2-208	ENST00000476817	IL13	P35225	146 aa		28.44	■■■□□ 2.14
CTBP2-208	ENST00000476817	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14
CTBP2-208	ENST00000476817	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		28.43	■■■□□ 2.14
CTBP2-208	ENST00000476817	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	28.43	■■■□□ 2.14
CTBP2-208	ENST00000476817	MTHFS	P49914	203 aa		28.42	■■■□□ 2.14
CTBP2-208	ENST00000476817	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	28.42	■■■□□ 2.14
CTBP2-208	ENST00000476817	ITGB4	P16144	1822 aa		28.41	■■■□□ 2.14
CTBP2-208	ENST00000476817	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		28.41	■■■□□ 2.14
CTBP2-208	ENST00000476817	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		28.4	■■■□□ 2.14
CTBP2-208	ENST00000476817	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		28.39	■■■□□ 2.14
CTBP2-208	ENST00000476817	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		28.39	■■■□□ 2.14
CTBP2-208	ENST00000476817	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		28.38	■■■□□ 2.13
CTBP2-208	ENST00000476817	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		28.37	■■■□□ 2.13
CTBP2-208	ENST00000476817	KDR	P35968	1356 aa		28.37	■■■□□ 2.13
CTBP2-208	ENST00000476817	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
CTBP2-208	ENST00000476817	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	28.36	■■■□□ 2.13
CTBP2-208	ENST00000476817	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.36	■■■□□ 2.13
CTBP2-208	ENST00000476817	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		28.35	■■■□□ 2.13
CTBP2-208	ENST00000476817	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
CTBP2-208	ENST00000476817	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
CTBP2-208	ENST00000476817	ARX	Q96QS3	562 aa		28.35	■■■□□ 2.13
CTBP2-208	ENST00000476817	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
CTBP2-208	ENST00000476817	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		28.34	■■■□□ 2.13
CTBP2-208	ENST00000476817	DCAF5	Q96JK2	942 aa		28.34	■■■□□ 2.13
CTBP2-208	ENST00000476817	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		28.33	■■■□□ 2.13
CTBP2-208	ENST00000476817	SIK1	P57059	783 aa		28.33	■■■□□ 2.13
CTBP2-208	ENST00000476817	SYT17	Q9BSW7	474 aa		28.33	■■■□□ 2.13
CTBP2-208	ENST00000476817	C5	P01031	1676 aa		28.32	■■■□□ 2.12
CTBP2-208	ENST00000476817	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
CTBP2-208	ENST00000476817	ATG3	Q9NT62	314 aa		28.32	■■■□□ 2.12
CTBP2-208	ENST00000476817	MSH5	O43196	834 aa		28.3	■■■□□ 2.12
CTBP2-208	ENST00000476817	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
CTBP2-208	ENST00000476817	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
CTBP2-208	ENST00000476817	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		28.29	■■■□□ 2.12
CTBP2-208	ENST00000476817	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		28.29	■■■□□ 2.12
CTBP2-208	ENST00000476817	POLD1	P28340	1107 aa		28.28	■■■□□ 2.12
CTBP2-208	ENST00000476817	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		28.27	■■■□□ 2.12
CTBP2-208	ENST00000476817	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		28.27	■■■□□ 2.12
CTBP2-208	ENST00000476817	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		28.27	■■■□□ 2.12
CTBP2-208	ENST00000476817	HMOX1	P09601	288 aa		28.26	■■■□□ 2.11
CTBP2-208	ENST00000476817	ATP6V1A	P38606	617 aa		28.26	■■■□□ 2.11
CTBP2-208	ENST00000476817	CABP4	P57796	275 aa		28.26	■■■□□ 2.11

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