RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476612.1

UBE2Q1-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 301 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-204ENST00000476612 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
UBE2Q1-204ENST00000476612 IL13P35225 146 aa5.47□□□□□ -1.53
UBE2Q1-204ENST00000476612 AEBP1Q8IUX7 1158 aa5.47□□□□□ -1.53
UBE2Q1-204ENST00000476612 KNSTRNQ9Y448 316 aa5.47□□□□□ -1.53
UBE2Q1-204ENST00000476612 LTN1O94822 1766 aa5.47□□□□□ -1.53
UBE2Q1-204ENST00000476612 PARD3Q8TEW0 1356 aa5.46□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 TATP17735 454 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 MTHFSP49914 203 aa5.46□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF827Q17R98 1081 aa5.46□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa5.46□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 IGSF1Q8N6C5 1336 aa5.46□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 RGPD2P0DJD1 1756 aa5.45□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLC15A2Q16348 729 aa5.45□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 SMIM5Q71RC9 77 aa5.45□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 PIGBQ92521 554 aa5.45□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 AKT1S1Q96B36 256 aa5.45□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 RGPD1P0DJD0 1748 aa5.45□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 SBF2Q86WG5 1849 aa5.44□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 PHKG2P15735 406 aa5.44□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 PTGER2P43116 358 aa5.44□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 NBPF14Q5TI25 921 aa5.44□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 AMIGO3Q86WK7 504 aa5.44□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLC4A9Q96Q91 983 aa5.44□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 SGIP1Q9BQI5 828 aa5.44□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 WNK3Q9BYP7 1800 aa5.44□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa5.43□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZBTB7AO95365 584 aa5.43□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 SULT6B1Q6IMI4 303 aa5.43□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa5.43□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.43□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 SPG7Q9UQ90 795 aa5.43□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 KIF20BQ96Q89 1820 aa5.43□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 RREB1Q92766 1687 aa5.43□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa5.43□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa5.43□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 SHANK3Q9BYB0 1731 aa5.43□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 KDRP35968 1356 aa5.42□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 HMOX1P09601 288 aa5.42□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLC27A3Q5K4L6 730 aa5.42□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 IFNL2Q8IZJ0 200 aa5.42□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 LGR6Q9HBX8 967 aa5.42□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 ATG3Q9NT62 314 aa5.42□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 STK32BQ9NY57 414 aa5.42□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 NUP188Q5SRE5 1749 aa5.42□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa5.42□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa5.42□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 NHSQ6T4R5 1651 aa5.41□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 PPP2R1AP30153 589 aa5.41□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 ITPK1Q13572 414 aa5.41□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 SPON1Q9HCB6 807 aa5.41□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 BTAF1O14981 1849 aa5.4□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 ERVV-2B6SEH9 535 aa5.4□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 AMOTQ4VCS5 1084 aa5.4□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa5.4□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 LINC00116Q8NCU8 138 aa5.4□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 IL17REQ8NFR9 667 aa5.4□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 DCAF5Q96JK2 942 aa5.4□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 PHACTR3Q96KR7 559 aa5.4□□□□□ -1.54
UBE2Q1-204ENST00000476612 PAPPAQ13219 1627 aa5.4□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 PALLDQ8WX93 1383 aa5.4□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa5.39□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 SIK1P57059 783 aa5.39□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 MTFR1LQ9H019 292 aa5.39□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 RSPH6AQ9H0K4 717 aa5.39□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 TMOD3Q9NYL9 352 aa5.39□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa5.39□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 LRP5O75197 1615 aa5.38□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 PKD1L3Q7Z443 1732 aa5.38□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa5.38□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa5.38□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 CASZ1Q86V15 1759 aa5.38□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 RNMTO43148 476 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 CABP4P57796 275 aa5.38□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLC39A6Q13433 755 aa5.38□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 AKAP4Q5JQC9 854 aa5.38□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 SYT17Q9BSW7 474 aa5.38□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa5.38□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 DOT1LQ8TEK3 1739 aa5.37□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
UBE2Q1-204ENST00000476612 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms