RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475239.5

MEIS1-208, Transcript of Meis homeobox 1, humanhuman

TSL 3

Gene MEIS1, Length 573 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1-208ENST00000475239 IP6K1Q92551 441 aa9.5□□□□□ -0.89
MEIS1-208ENST00000475239 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
MEIS1-208ENST00000475239 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.5□□□□□ -0.89
MEIS1-208ENST00000475239 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
MEIS1-208ENST00000475239 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
MEIS1-208ENST00000475239 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
MEIS1-208ENST00000475239 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.49□□□□□ -0.89
MEIS1-208ENST00000475239 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.49□□□□□ -0.89
MEIS1-208ENST00000475239 AMPHP49418 695 aa9.48□□□□□ -0.89
MEIS1-208ENST00000475239 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.48□□□□□ -0.89
MEIS1-208ENST00000475239 CGNL1Q0VF96 1302 aa9.48□□□□□ -0.89
MEIS1-208ENST00000475239 WASHC2AQ641Q2 1341 aa9.48□□□□□ -0.89
MEIS1-208ENST00000475239 RTL1A6NKG5 1358 aa9.48□□□□□ -0.89
MEIS1-208ENST00000475239 CCDC7Q96M83 1385 aa9.48□□□□□ -0.89
MEIS1-208ENST00000475239 RGPD1P0DJD0 1748 aa9.48□□□□□ -0.89
MEIS1-208ENST00000475239 TNS2Q63HR2 1409 aa9.48□□□□□ -0.89
MEIS1-208ENST00000475239 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa9.47□□□□□ -0.89
MEIS1-208ENST00000475239 TRIM37O94972 964 aa9.46□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 PLCB2Q00722 1185 aa9.46□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 PDE3BQ13370 1112 aa9.46□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 DDB1Q16531 1140 aa9.46□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.46□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 USHBP1Q8N6Y0 703 aa9.46□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 FBXO3Q9UK99 471 aa9.46□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 MEGF6O75095 1541 aa9.46□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 SBF2Q86WG5 1849 aa9.45□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 CCDC125Q86Z20 511 aa9.45□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 FLT4P35916 1363 aa9.45□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.45□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.45□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 IL2RBP14784 551 aa9.44□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.44□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 FAM196AQ6ZSG2 479 aa9.44□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 NBPF4Q96M43 638 aa9.44□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 POLKQ9UBT6 870 aa9.44□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 INSRP06213 1382 aa9.44□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 NSD2O96028 1365 aa9.43□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.42□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.42□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 NCAPD2Q15021 1401 aa9.41□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 EXOC5O00471 708 aa9.41□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 APBA3O96018 575 aa9.41□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 BAG6P46379 1132 aa9.41□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 KNSTRNQ9Y448 316 aa9.41□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 RREB1Q92766 1687 aa9.41□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 BCL9O00512 1426 aa9.4□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 NUP188Q5SRE5 1749 aa9.4□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 NHSQ6T4R5 1651 aa9.4□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 KCNQ2O43526 872 aa9.4□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 MORC1Q86VD1 984 aa9.4□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 CAMKK2Q96RR4 588 aa9.4□□□□□ -0.9
MEIS1-208ENST00000475239 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 ACSBG1Q96GR2 724 aa9.39□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 DCBLD2Q96PD2 775 aa9.39□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 EYA1Q99502 592 aa9.39□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.39□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.38□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 PKD1L3Q7Z443 1732 aa9.38□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 BTAF1O14981 1849 aa9.38□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 PROM2Q8N271 834 aa9.37□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.37□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa9.36□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.36□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.36□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa9.36□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa9.36□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 CYP27B1O15528 508 aa9.35□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 MTHFSP49914 203 aa9.35□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.35□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 IL13P35225 146 aa9.34□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.34□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 CREBZFQ9NS37 354 aa9.34□□□□□ -0.91
MEIS1-208ENST00000475239 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa9.33□□□□□ -0.92
MEIS1-208ENST00000475239 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa9.33□□□□□ -0.92
MEIS1-208ENST00000475239 PLSCR1O15162 318 aa9.33□□□□□ -0.92
MEIS1-208ENST00000475239 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
MEIS1-208ENST00000475239 PAPPAQ13219 1627 aa9.32□□□□□ -0.92
MEIS1-208ENST00000475239 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms