RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475170.5

ITGB2-209, Transcript of integrin subunit beta 2, humanhuman

TSL 2

Gene ITGB2, Length 2,125 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2-209ENST00000475170 CRB1P82279 1406 aa21.62■■□□□ 1.05
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ITGB2-209ENST00000475170 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
ITGB2-209ENST00000475170 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.6■■□□□ 1.05
ITGB2-209ENST00000475170 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.59■■□□□ 1.05
ITGB2-209ENST00000475170 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.59■■□□□ 1.05
ITGB2-209ENST00000475170 CHL1O00533 1208 aa21.59■■□□□ 1.05
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ITGB2-209ENST00000475170 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.58■■□□□ 1.05
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ITGB2-209ENST00000475170 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
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ITGB2-209ENST00000475170 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ITGB2-209ENST00000475170 TOM1O60784 492 aa21.55■■□□□ 1.04
ITGB2-209ENST00000475170 CRBNQ96SW2 442 aa21.55■■□□□ 1.04
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ITGB2-209ENST00000475170 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.55■■□□□ 1.04
ITGB2-209ENST00000475170 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.55■■□□□ 1.04
ITGB2-209ENST00000475170 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
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ITGB2-209ENST00000475170 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.53■■□□□ 1.04
ITGB2-209ENST00000475170 LRRC37A3O60309 1634 aa21.53■■□□□ 1.04
ITGB2-209ENST00000475170 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.53■■□□□ 1.04
ITGB2-209ENST00000475170 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ITGB2-209ENST00000475170 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 LGR6Q9HBX8 967 aa21.52■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 MEGF6O75095 1541 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 KRT24Q2M2I5 525 aa21.51■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 TNNQ9UQP3 1299 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 PHLPP1O60346 1717 aa21.5■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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ITGB2-209ENST00000475170 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 PDE3AQ14432 1141 aa21.49■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.48■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 ZNF428Q96B54 188 aa21.48■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.47■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 RLBP1P12271 317 aa21.47■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.47■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 PANK1Q8TE04 598 aa21.47■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ITGB2-209ENST00000475170 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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ITGB2-209ENST00000475170 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.44■■□□□ 1.02
ITGB2-209ENST00000475170 STRN4Q9NRL3 753 aa21.44■■□□□ 1.02
ITGB2-209ENST00000475170 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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ITGB2-209ENST00000475170 BTG4Q9NY30 223 aa21.43■■□□□ 1.02
ITGB2-209ENST00000475170 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ITGB2-209ENST00000475170 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.43■■□□□ 1.02
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ITGB2-209ENST00000475170 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.42■■□□□ 1.02
ITGB2-209ENST00000475170 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.42■■□□□ 1.02
ITGB2-209ENST00000475170 TRIM27P14373 513 aa21.41■■□□□ 1.02
ITGB2-209ENST00000475170 EVA1CP58658 441 aa21.41■■□□□ 1.02
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ITGB2-209ENST00000475170 CYP27B1O15528 508 aa21.41■■□□□ 1.02
ITGB2-209ENST00000475170 PHKG2P15735 406 aa21.41■■□□□ 1.02
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ITGB2-209ENST00000475170 KCNQ3O43525 872 aa21.37■■□□□ 1.01
ITGB2-209ENST00000475170 ADAMTS2O95450 1211 aa21.37■■□□□ 1.01
ITGB2-209ENST00000475170 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
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ITGB2-209ENST00000475170 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ITGB2-209ENST00000475170 BTBD11A6QL63 1104 aa21.34■■□□□ 1.01
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