RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472004.5

GYS1-204, Transcript of glycogen synthase 1, human

TSL 3

Gene GYS1, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GYS1-204	ENST00000472004	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
GYS1-204	ENST00000472004	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
GYS1-204	ENST00000472004	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
GYS1-204	ENST00000472004	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
GYS1-204	ENST00000472004	NRAP	Q86VF7	1730 aa		18.77	■□□□□ 0.6
GYS1-204	ENST00000472004	VPS72	Q15906	364 aa		18.77	■□□□□ 0.6
GYS1-204	ENST00000472004	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
GYS1-204	ENST00000472004	NCAPD2	Q15021	1401 aa		18.76	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		18.76	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	GOLGA2	Q08379	1002 aa		18.76	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		18.75	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		18.75	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		18.75	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	PDE3B	Q13370	1112 aa		18.75	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	CCDC27	Q2M243	656 aa		18.75	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	WWC1	Q8IX03	1113 aa		18.75	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	MAP3K5	Q99683	1374 aa		18.75	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	MEGF6	O75095	1541 aa		18.74	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		18.74	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	18.74	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		18.74	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		18.74	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		18.73	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	EXOC5	O00471	708 aa		18.73	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	WDR63	Q8IWG1	891 aa		18.73	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		18.73	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		18.72	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		18.72	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	MCM10	Q7L590	875 aa		18.71	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		18.71	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		18.71	■□□□□ 0.59
GYS1-204	ENST00000472004	DCTN1	Q14203	1278 aa		18.7	■□□□□ 0.58
GYS1-204	ENST00000472004	DDB1	Q16531	1140 aa		18.7	■□□□□ 0.58
GYS1-204	ENST00000472004		E9PSI1	815 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GYS1-204	ENST00000472004	TEF	Q10587	303 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GYS1-204	ENST00000472004	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		18.69	■□□□□ 0.58
GYS1-204	ENST00000472004	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
GYS1-204	ENST00000472004	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
GYS1-204	ENST00000472004	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GYS1-204	ENST00000472004	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		18.68	■□□□□ 0.58
GYS1-204	ENST00000472004	PHKG2	P15735	406 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GYS1-204	ENST00000472004	GNAI1	P63096	354 aa		18.67	■□□□□ 0.58
GYS1-204	ENST00000472004	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GYS1-204	ENST00000472004	IL16	Q14005	1332 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GYS1-204	ENST00000472004	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GYS1-204	ENST00000472004	ATRN	O75882	1429 aa		18.66	■□□□□ 0.58
GYS1-204	ENST00000472004	DCAF5	Q96JK2	942 aa		18.65	■□□□□ 0.58
GYS1-204	ENST00000472004	ZNF521	Q96K83	1311 aa		18.65	■□□□□ 0.58
GYS1-204	ENST00000472004	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		18.65	■□□□□ 0.58
GYS1-204	ENST00000472004	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	18.64	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	DISP2	A7MBM2	1401 aa		18.64	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	CYP27B1	O15528	508 aa		18.63	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	CABP4	P57796	275 aa		18.63	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	SLFN5	Q08AF3	891 aa		18.63	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	IFT57	Q9NWB7	429 aa		18.63	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	TNS2	Q63HR2	1409 aa		18.63	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		18.62	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	LGR6	Q9HBX8	967 aa		18.62	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		18.62	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	CFAP44	Q96MT7	982 aa		18.61	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	BTBD11	A6QL63	1104 aa		18.59	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	RXRB	P28702	533 aa		18.59	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		18.59	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		18.58	■□□□□ 0.57
GYS1-204	ENST00000472004	LRRC37A3	O60309	1634 aa		18.58	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	GLI3	P10071	1580 aa		18.58	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		18.57	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		18.57	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		18.57	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		18.57	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		18.56	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		18.56	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		18.56	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	MBIP	Q9NS73	344 aa		18.56	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		18.55	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		18.55	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	CHL1	O00533	1208 aa		18.54	■□□□□ 0.56
GYS1-204	ENST00000472004	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56

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