RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468532.5

CHKB-205, Transcript of choline kinase beta, human

TSL 5

Gene CHKB, Length 1,052 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHKB-205	ENST00000468532	MORC1	Q86VD1	984 aa		42.6	■■■■■ 4.41
CHKB-205	ENST00000468532	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		42.6	■■■■■ 4.41
CHKB-205	ENST00000468532	PLSCR1	O15162	318 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CHKB-205	ENST00000468532	KCNQ2	O43526	872 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CHKB-205	ENST00000468532	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	42.59	■■■■■ 4.41
CHKB-205	ENST00000468532	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	42.55	■■■■■ 4.4
CHKB-205	ENST00000468532	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	42.55	■■■■■ 4.4
CHKB-205	ENST00000468532	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	42.53	■■■■■ 4.4
CHKB-205	ENST00000468532	NCAPD2	Q15021	1401 aa		42.5	■■■■■ 4.39
CHKB-205	ENST00000468532	BTAF1	O14981	1849 aa		42.5	■■■■■ 4.39
CHKB-205	ENST00000468532	NBPF14	Q5TI25	921 aa		42.48	■■■■■ 4.39
CHKB-205	ENST00000468532	EYA1	Q99502	592 aa		42.48	■■■■■ 4.39
CHKB-205	ENST00000468532	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		42.47	■■■■■ 4.39
CHKB-205	ENST00000468532	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	42.47	■■■■■ 4.39
CHKB-205	ENST00000468532	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CHKB-205	ENST00000468532	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
CHKB-205	ENST00000468532	PROM2	Q8N271	834 aa		42.43	■■■■■ 4.38
CHKB-205	ENST00000468532	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		42.41	■■■■■ 4.38
CHKB-205	ENST00000468532	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		42.41	■■■■■ 4.38
CHKB-205	ENST00000468532	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		42.41	■■■■■ 4.38
CHKB-205	ENST00000468532	TXNRD1	Q16881	649 aa		42.4	■■■■■ 4.38
CHKB-205	ENST00000468532	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	42.39	■■■■■ 4.38
CHKB-205	ENST00000468532	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
CHKB-205	ENST00000468532	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	42.36	■■■■■ 4.37
CHKB-205	ENST00000468532	LRP5	O75197	1615 aa		42.35	■■■■■ 4.37
CHKB-205	ENST00000468532	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	42.34	■■■■■ 4.37
CHKB-205	ENST00000468532	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		42.33	■■■■■ 4.37
CHKB-205	ENST00000468532	CYP27B1	O15528	508 aa		42.32	■■■■■ 4.37
CHKB-205	ENST00000468532	SPG7	Q9UQ90	795 aa		42.3	■■■■■ 4.36
CHKB-205	ENST00000468532	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		42.28	■■■■■ 4.36
CHKB-205	ENST00000468532	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	42.28	■■■■■ 4.36
CHKB-205	ENST00000468532	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	42.25	■■■■■ 4.35	3e-8	■□□□□ 11.2
CHKB-205	ENST00000468532	MTHFS	P49914	203 aa		42.24	■■■■■ 4.35
CHKB-205	ENST00000468532	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		42.23	■■■■■ 4.35
CHKB-205	ENST00000468532	STK32B	Q9NY57	414 aa		42.22	■■■■■ 4.35
CHKB-205	ENST00000468532	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CHKB-205	ENST00000468532	PAPPA	Q13219	1627 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CHKB-205	ENST00000468532	IL13	P35225	146 aa		42.19	■■■■■ 4.34
CHKB-205	ENST00000468532	LY75	O60449	1722 aa		42.18	■■■■■ 4.34
CHKB-205	ENST00000468532	ITGB4	P16144	1822 aa		42.18	■■■■■ 4.34
CHKB-205	ENST00000468532	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		42.17	■■■■■ 4.34
CHKB-205	ENST00000468532	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	42.16	■■■■■ 4.34
CHKB-205	ENST00000468532	SLC15A2	Q16348	729 aa		42.16	■■■■■ 4.34
CHKB-205	ENST00000468532	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		42.16	■■■■■ 4.34
CHKB-205	ENST00000468532	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		42.15	■■■■■ 4.34
CHKB-205	ENST00000468532	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		42.15	■■■■■ 4.34
CHKB-205	ENST00000468532	CASZ1	Q86V15	1759 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CHKB-205	ENST00000468532	PHKG2	P15735	406 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CHKB-205	ENST00000468532	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CHKB-205	ENST00000468532	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		42.13	■■■■■ 4.33
CHKB-205	ENST00000468532	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	42.1	■■■■■ 4.33
CHKB-205	ENST00000468532	KDR	P35968	1356 aa		42.09	■■■■■ 4.33
CHKB-205	ENST00000468532	KCNQ4	P56696	695 aa		42.08	■■■■■ 4.33
CHKB-205	ENST00000468532	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	42.08	■■■■■ 4.33
CHKB-205	ENST00000468532	ZNF827	Q17R98	1081 aa		42.06	■■■■■ 4.32
CHKB-205	ENST00000468532	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	42.05	■■■■■ 4.32
CHKB-205	ENST00000468532	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		42.05	■■■■■ 4.32
CHKB-205	ENST00000468532	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	42.05	■■■■■ 4.32
CHKB-205	ENST00000468532	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	42.04	■■■■■ 4.32
CHKB-205	ENST00000468532	SPON1	Q9HCB6	807 aa		42.04	■■■■■ 4.32
CHKB-205	ENST00000468532	PALLD	Q8WX93	1383 aa		42.03	■■■■■ 4.32
CHKB-205	ENST00000468532	PIGB	Q92521	554 aa		42.03	■■■■■ 4.32
CHKB-205	ENST00000468532	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	42.02	■■■■■ 4.32
CHKB-205	ENST00000468532	AKT1S1	Q96B36	256 aa		42	■■■■■ 4.31
CHKB-205	ENST00000468532	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		42	■■■■■ 4.31
CHKB-205	ENST00000468532	HMOX1	P09601	288 aa		41.98	■■■■■ 4.31
CHKB-205	ENST00000468532	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	41.98	■■■■■ 4.31
CHKB-205	ENST00000468532	ZBTB7A	O95365	584 aa		41.97	■■■■■ 4.31
CHKB-205	ENST00000468532	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	41.97	■■■■■ 4.31
CHKB-205	ENST00000468532	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		41.95	■■■■■ 4.31
CHKB-205	ENST00000468532	DCAF5	Q96JK2	942 aa		41.95	■■■■■ 4.31
CHKB-205	ENST00000468532	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		41.95	■■■■■ 4.31
CHKB-205	ENST00000468532	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		41.95	■■■■■ 4.31
CHKB-205	ENST00000468532	C5	P01031	1676 aa		41.93	■■■■■ 4.3
CHKB-205	ENST00000468532	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	41.92	■■■■■ 4.3
CHKB-205	ENST00000468532	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		41.9	■■■■■ 4.3
CHKB-205	ENST00000468532	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		41.9	■■■■■ 4.3
CHKB-205	ENST00000468532	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		41.9	■■■■■ 4.3
CHKB-205	ENST00000468532	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	41.89	■■■■■ 4.3
CHKB-205	ENST00000468532	PPP2R1A	P30153	589 aa		41.89	■■■■■ 4.3
CHKB-205	ENST00000468532	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	41.89	■■■■■ 4.3
CHKB-205	ENST00000468532	CFAP53	Q96M91	514 aa		41.88	■■■■■ 4.29
CHKB-205	ENST00000468532	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	41.88	■■■■■ 4.29
CHKB-205	ENST00000468532	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		41.87	■■■■■ 4.29
CHKB-205	ENST00000468532	MTFR1L	Q9H019	292 aa		41.86	■■■■■ 4.29
CHKB-205	ENST00000468532	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		41.86	■■■■■ 4.29
CHKB-205	ENST00000468532	ATG3	Q9NT62	314 aa		41.83	■■■■■ 4.29
CHKB-205	ENST00000468532	CABP4	P57796	275 aa		41.82	■■■■■ 4.29
CHKB-205	ENST00000468532	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		41.82	■■■■■ 4.29
CHKB-205	ENST00000468532	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		41.81	■■■■■ 4.28
CHKB-205	ENST00000468532	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	41.81	■■■■■ 4.28
CHKB-205	ENST00000468532	SIK1	P57059	783 aa		41.81	■■■■■ 4.28
CHKB-205	ENST00000468532	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		41.81	■■■■■ 4.28
CHKB-205	ENST00000468532	PTGER2	P43116	358 aa		41.8	■■■■■ 4.28
CHKB-205	ENST00000468532	C4B	P0C0L5	1744 aa		41.79	■■■■■ 4.28
CHKB-205	ENST00000468532	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	41.77	■■■■■ 4.28
CHKB-205	ENST00000468532	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	41.75	■■■■■ 4.27
CHKB-205	ENST00000468532	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		41.75	■■■■■ 4.27
CHKB-205	ENST00000468532	NUDC	Q9Y266	331 aa		41.74	■■■■■ 4.27
CHKB-205	ENST00000468532	ATP6V1A	P38606	617 aa		41.72	■■■■■ 4.27

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