RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468358.5

CLDN11-202, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 3

Gene CLDN11, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-202ENST00000468358 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.53■■□□□ 1.36
CLDN11-202ENST00000468358 NHSQ6T4R5 1651 aa23.52■■□□□ 1.36
CLDN11-202ENST00000468358 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.52■■□□□ 1.36
CLDN11-202ENST00000468358 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.52■■□□□ 1.36
CLDN11-202ENST00000468358 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.51■■□□□ 1.35
CLDN11-202ENST00000468358 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.51■■□□□ 1.35
CLDN11-202ENST00000468358 KCNQ2O43526 872 aa23.5■■□□□ 1.35
CLDN11-202ENST00000468358 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CLDN11-202ENST00000468358 MTHFSP49914 203 aa23.48■■□□□ 1.35
CLDN11-202ENST00000468358 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CLDN11-202ENST00000468358 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.48■■□□□ 1.35
CLDN11-202ENST00000468358 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.48■■□□□ 1.35
CLDN11-202ENST00000468358 NCAPD2Q15021 1401 aa23.48■■□□□ 1.35
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CLDN11-202ENST00000468358 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.47■■□□□ 1.35
CLDN11-202ENST00000468358 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CLDN11-202ENST00000468358 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.46■■□□□ 1.35
CLDN11-202ENST00000468358 BTAF1O14981 1849 aa23.45■■□□□ 1.34
CLDN11-202ENST00000468358 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.45■■□□□ 1.34
CLDN11-202ENST00000468358 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.45■■□□□ 1.34
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CLDN11-202ENST00000468358 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.45■■□□□ 1.34
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CLDN11-202ENST00000468358 NBPF14Q5TI25 921 aa23.41■■□□□ 1.34
CLDN11-202ENST00000468358 CYP27B1O15528 508 aa23.4■■□□□ 1.34
CLDN11-202ENST00000468358 IL13P35225 146 aa23.4■■□□□ 1.34
CLDN11-202ENST00000468358 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CLDN11-202ENST00000468358 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CLDN11-202ENST00000468358 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.39■■□□□ 1.33
CLDN11-202ENST00000468358 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.39■■□□□ 1.33
CLDN11-202ENST00000468358 TXNRD1Q16881 649 aa23.38■■□□□ 1.33
CLDN11-202ENST00000468358 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
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CLDN11-202ENST00000468358 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.35■■□□□ 1.33
CLDN11-202ENST00000468358 CFAP53Q96M91 514 aa23.35■■□□□ 1.33
CLDN11-202ENST00000468358 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CLDN11-202ENST00000468358 HMOX1P09601 288 aa23.34■■□□□ 1.33
CLDN11-202ENST00000468358 PROM2Q8N271 834 aa23.34■■□□□ 1.33
CLDN11-202ENST00000468358 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.33■■□□□ 1.33
CLDN11-202ENST00000468358 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.33■■□□□ 1.33
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CLDN11-202ENST00000468358 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.33■■□□□ 1.33
CLDN11-202ENST00000468358 KDRP35968 1356 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN11-202ENST00000468358 ITGB4P16144 1822 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN11-202ENST00000468358 PPP2R1AP30153 589 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN11-202ENST00000468358 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN11-202ENST00000468358 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CLDN11-202ENST00000468358 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CLDN11-202ENST00000468358 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CLDN11-202ENST00000468358 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN11-202ENST00000468358 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CLDN11-202ENST00000468358 STK32BQ9NY57 414 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN11-202ENST00000468358 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CLDN11-202ENST00000468358 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN11-202ENST00000468358 LY75O60449 1722 aa23.26■■□□□ 1.31
CLDN11-202ENST00000468358 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.25■■□□□ 1.31
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CLDN11-202ENST00000468358 KCNQ4P56696 695 aa23.24■■□□□ 1.31
CLDN11-202ENST00000468358 DCAF5Q96JK2 942 aa23.24■■□□□ 1.31
CLDN11-202ENST00000468358 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.24■■□□□ 1.31
CLDN11-202ENST00000468358 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CLDN11-202ENST00000468358 SLC15A2Q16348 729 aa23.23■■□□□ 1.31
CLDN11-202ENST00000468358 PIGBQ92521 554 aa23.23■■□□□ 1.31
CLDN11-202ENST00000468358 PALLDQ8WX93 1383 aa23.23■■□□□ 1.31
CLDN11-202ENST00000468358 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CLDN11-202ENST00000468358 PAPPAQ13219 1627 aa23.21■■□□□ 1.31
CLDN11-202ENST00000468358 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CLDN11-202ENST00000468358 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
CLDN11-202ENST00000468358 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CLDN11-202ENST00000468358 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.19■■□□□ 1.3
CLDN11-202ENST00000468358 CABP4P57796 275 aa23.19■■□□□ 1.3
CLDN11-202ENST00000468358 RALBP1Q15311 655 aa23.19■■□□□ 1.3
CLDN11-202ENST00000468358 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.19■■□□□ 1.3
CLDN11-202ENST00000468358 LRP5O75197 1615 aa23.19■■□□□ 1.3
CLDN11-202ENST00000468358 ZNF827Q17R98 1081 aa23.17■■□□□ 1.3
CLDN11-202ENST00000468358 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
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CLDN11-202ENST00000468358 C5P01031 1676 aa23.16■■□□□ 1.3
CLDN11-202ENST00000468358 PRKAR2BP31323 418 aa23.16■■□□□ 1.3
CLDN11-202ENST00000468358 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.16■■□□□ 1.3
CLDN11-202ENST00000468358 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CLDN11-202ENST00000468358 CASZ1Q86V15 1759 aa23.15■■□□□ 1.3
CLDN11-202ENST00000468358 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CLDN11-202ENST00000468358 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.14■■□□□ 1.29
CLDN11-202ENST00000468358 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.13■■□□□ 1.29
CLDN11-202ENST00000468358 AKT1S1Q96B36 256 aa23.13■■□□□ 1.29
CLDN11-202ENST00000468358 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.13■■□□□ 1.29
CLDN11-202ENST00000468358 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.12■■□□□ 1.29
CLDN11-202ENST00000468358 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CLDN11-202ENST00000468358 ZBTB7AO95365 584 aa23.12■■□□□ 1.29
CLDN11-202ENST00000468358 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CLDN11-202ENST00000468358 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.12■■□□□ 1.29
CLDN11-202ENST00000468358 SPON1Q9HCB6 807 aa23.12■■□□□ 1.29
CLDN11-202ENST00000468358 ATG3Q9NT62 314 aa23.12■■□□□ 1.29
CLDN11-202ENST00000468358 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.11■■□□□ 1.29
CLDN11-202ENST00000468358 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.11■■□□□ 1.29
CLDN11-202ENST00000468358 SIK1P57059 783 aa23.11■■□□□ 1.29
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