RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SHQ1-204ENST00000468347 MTMR2Q13614 643 aa6.22□□□□□ -1.41
SHQ1-204ENST00000468347 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.22□□□□□ -1.41
SHQ1-204ENST00000468347 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa6.22□□□□□ -1.41
SHQ1-204ENST00000468347 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.22□□□□□ -1.41
SHQ1-204ENST00000468347 SEMA3EO15041 775 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1-204ENST00000468347 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SHQ1-204ENST00000468347 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1-204ENST00000468347 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SHQ1-204ENST00000468347 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1-204ENST00000468347 ADH1AP07327 375 aa6.19□□□□□ -1.42
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SHQ1-204ENST00000468347 PTGIRP43119 386 aa6.19□□□□□ -1.42
SHQ1-204ENST00000468347 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SHQ1-204ENST00000468347 LCE4AQ5TA78 99 aa6.19□□□□□ -1.42
SHQ1-204ENST00000468347 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SHQ1-204ENST00000468347 EPXP11678 715 aa6.18□□□□□ -1.42
SHQ1-204ENST00000468347 JAG1P78504 1218 aa6.18□□□□□ -1.42
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SHQ1-204ENST00000468347 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
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SHQ1-204ENST00000468347 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.17□□□□□ -1.42
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SHQ1-204ENST00000468347 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.17□□□□□ -1.42
SHQ1-204ENST00000468347 TRIM11Q96F44 468 aa6.17□□□□□ -1.42
SHQ1-204ENST00000468347 RNF114Q9Y508 228 aa6.17□□□□□ -1.42
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SHQ1-204ENST00000468347 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SHQ1-204ENST00000468347 PLVAPQ9BX97 442 aa6.15□□□□□ -1.42
SHQ1-204ENST00000468347 CARD14Q9BXL6 1004 aa6.15□□□□□ -1.42
SHQ1-204ENST00000468347 PHF24Q9UPV7 400 aa6.15□□□□□ -1.42
SHQ1-204ENST00000468347 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.14□□□□□ -1.43
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SHQ1-204ENST00000468347 CFAP99D6REC4 459 aa6.13□□□□□ -1.43
SHQ1-204ENST00000468347 C2CD2LO14523 706 aa6.13□□□□□ -1.43
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SHQ1-204ENST00000468347 IRAK1P51617 712 aa6.13□□□□□ -1.43
SHQ1-204ENST00000468347 RNF135Q8IUD6 432 aa6.13□□□□□ -1.43
SHQ1-204ENST00000468347 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
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SHQ1-204ENST00000468347 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.12□□□□□ -1.43
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SHQ1-204ENST00000468347 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SHQ1-204ENST00000468347 POU4F2Q12837 409 aa6.11□□□□□ -1.43
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SHQ1-204ENST00000468347 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.11□□□□□ -1.43
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SHQ1-204ENST00000468347 F11P03951 625 aa6.1□□□□□ -1.43
SHQ1-204ENST00000468347 GPC1P35052 558 aa6.1□□□□□ -1.43
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SHQ1-204ENST00000468347 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
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SHQ1-204ENST00000468347 RNF112Q9ULX5 631 aa6.09□□□□□ -1.43
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SHQ1-204ENST00000468347 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.07□□□□□ -1.44
SHQ1-204ENST00000468347 ARAFP10398 606 aa6.07□□□□□ -1.44
SHQ1-204ENST00000468347 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.07□□□□□ -1.44
SHQ1-204ENST00000468347 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SHQ1-204ENST00000468347 NBPF15Q8N660 670 aa6.07□□□□□ -1.44
SHQ1-204ENST00000468347 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SHQ1-204ENST00000468347 CLCN1P35523 988 aa6.06□□□□□ -1.44
SHQ1-204ENST00000468347 MAP2K5Q13163 448 aa6.06□□□□□ -1.44
SHQ1-204ENST00000468347 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SHQ1-204ENST00000468347 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.06□□□□□ -1.44
SHQ1-204ENST00000468347 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-204ENST00000468347 CTBSQ01459 385 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-204ENST00000468347 WDR44Q5JSH3 913 aa6.05□□□□□ -1.44
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SHQ1-204ENST00000468347 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-204ENST00000468347 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-204ENST00000468347 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-204ENST00000468347 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-204ENST00000468347 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-204ENST00000468347 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-204ENST00000468347 IRF6O14896 467 aa6.03□□□□□ -1.44
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SHQ1-204ENST00000468347 MEN1O00255 615 aa6.02□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.02□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.02□□□□□ -1.45
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SHQ1-204ENST00000468347 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.01□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.01□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.01□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 GPAMQ9HCL2 828 aa6.01□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 HRCP23327 699 aa6□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 FAM229AH3BQW9 127 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 TAS1R3Q7RTX0 852 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 ZBTB3Q9H5J0 574 aa5.99□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 NDFIP2Q9NV92 336 aa5.99□□□□□ -1.45
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