RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SH3BP1-205ENST00000466097 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-205ENST00000466097 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-205ENST00000466097 NCAPD2Q15021 1401 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-205ENST00000466097 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-205ENST00000466097 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-205ENST00000466097 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-205ENST00000466097 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-205ENST00000466097 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-205ENST00000466097 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-205ENST00000466097 EYA1Q99502 592 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-205ENST00000466097 BTAF1O14981 1849 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-205ENST00000466097 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-205ENST00000466097 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-205ENST00000466097 LRP5O75197 1615 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-205ENST00000466097 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-205ENST00000466097 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-205ENST00000466097 PLSCR1O15162 318 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP1-205ENST00000466097 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SH3BP1-205ENST00000466097 IGSF1Q8N6C5 1336 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP1-205ENST00000466097 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNQ2O43526 872 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP1-205ENST00000466097 MTHFSP49914 203 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP1-205ENST00000466097 PTF1AQ7RTS3 328 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP1-205ENST00000466097 SPG7Q9UQ90 795 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1-205ENST00000466097 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-205ENST00000466097 ITGB4P16144 1822 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-205ENST00000466097 NBPF14Q5TI25 921 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-205ENST00000466097 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-205ENST00000466097 CYP27B1O15528 508 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1-205ENST00000466097 IL13P35225 146 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1-205ENST00000466097 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1-205ENST00000466097 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP1-205ENST00000466097 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
SH3BP1-205ENST00000466097 TXNRD1Q16881 649 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP1-205ENST00000466097 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1-205ENST00000466097 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1-205ENST00000466097 LY75O60449 1722 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1-205ENST00000466097 KDRP35968 1356 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 SULT6B1Q6IMI4 303 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 IFNL2Q8IZJ0 200 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 AMOTQ4VCS5 1084 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 AEBP1Q8IUX7 1158 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 CFAP53Q96M91 514 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 PROM2Q8N271 834 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 PHKG2P15735 406 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP2R1AP30153 589 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 HMOX1P09601 288 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC27A3Q5K4L6 730 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 STK32BQ9NY57 414 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1-205ENST00000466097 PAPPAQ13219 1627 aa19.83■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 C1orf141Q5JVX7 400 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 SCN11AQ9UI33 1791 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 DCAF5Q96JK2 942 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 TMOD3Q9NYL9 352 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 NUDCQ9Y266 331 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 TAF1LQ8IZX4 1826 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC15A2Q16348 729 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC4BQ9NT99 713 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 QSER1Q2KHR3 1735 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 PALLDQ8WX93 1383 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 C5P01031 1676 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 CASZ1Q86V15 1759 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 ERVV-2B6SEH9 535 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 PIGBQ92521 554 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-205ENST00000466097 RALBP1Q15311 655 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1-205ENST00000466097 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1-205ENST00000466097 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-205ENST00000466097 AKAP4Q5JQC9 854 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-205ENST00000466097 CABP4P57796 275 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNQ4P56696 695 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-205ENST00000466097 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-205ENST00000466097 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF827Q17R98 1081 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-205ENST00000466097 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-205ENST00000466097 PRKAR2BP31323 418 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-205ENST00000466097 GAS2L2Q8NHY3 880 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-205ENST00000466097 AKT1S1Q96B36 256 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-205ENST00000466097 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-205ENST00000466097 SPON1Q9HCB6 807 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-205ENST00000466097 ASAP1Q9ULH1 1129 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-205ENST00000466097 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF831Q5JPB2 1677 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-205ENST00000466097 C4BP0C0L5 1744 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-205ENST00000466097 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP1-205ENST00000466097 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-205ENST00000466097 FCHSD2O94868 740 aa19.68■□□□□ 0.74
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