RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462597.1

PDLIM4-204, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDLIM4, Length 767 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-204ENST00000462597 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.43■■□□□ 1.66
PDLIM4-204ENST00000462597 FLT4P35916 1363 aa25.43■■□□□ 1.66
PDLIM4-204ENST00000462597 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.42■■□□□ 1.66
PDLIM4-204ENST00000462597 INSRP06213 1382 aa25.42■■□□□ 1.66
PDLIM4-204ENST00000462597 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PDLIM4-204ENST00000462597 PAPPAQ13219 1627 aa25.4■■□□□ 1.66
PDLIM4-204ENST00000462597 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
PDLIM4-204ENST00000462597 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PDLIM4-204ENST00000462597 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.38■■□□□ 1.65
PDLIM4-204ENST00000462597 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.37■■□□□ 1.65
PDLIM4-204ENST00000462597 PANK3Q9H999 370 aa25.36■■□□□ 1.65
PDLIM4-204ENST00000462597 SPON1Q9HCB6 807 aa25.36■■□□□ 1.65
PDLIM4-204ENST00000462597 STK32BQ9NY57 414 aa25.36■■□□□ 1.65
PDLIM4-204ENST00000462597 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PDLIM4-204ENST00000462597 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.34■■□□□ 1.65
PDLIM4-204ENST00000462597 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PDLIM4-204ENST00000462597 NSD2O96028 1365 aa25.33■■□□□ 1.65
PDLIM4-204ENST00000462597 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PDLIM4-204ENST00000462597 SLC15A2Q16348 729 aa25.33■■□□□ 1.65
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PDLIM4-204ENST00000462597 ZBTB7AO95365 584 aa25.31■■□□□ 1.64
PDLIM4-204ENST00000462597 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PDLIM4-204ENST00000462597 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PDLIM4-204ENST00000462597 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.3■■□□□ 1.64
PDLIM4-204ENST00000462597 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PDLIM4-204ENST00000462597 LY75O60449 1722 aa25.29■■□□□ 1.64
PDLIM4-204ENST00000462597 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PDLIM4-204ENST00000462597 ZNF827Q17R98 1081 aa25.28■■□□□ 1.64
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PDLIM4-204ENST00000462597 NCAPD2Q15021 1401 aa25.28■■□□□ 1.64
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PDLIM4-204ENST00000462597 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.26■■□□□ 1.63
PDLIM4-204ENST00000462597 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
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PDLIM4-204ENST00000462597 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.25■■□□□ 1.63
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PDLIM4-204ENST00000462597 CYP27B1O15528 508 aa25.23■■□□□ 1.63
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PDLIM4-204ENST00000462597 ITGB4P16144 1822 aa25.22■■□□□ 1.63
PDLIM4-204ENST00000462597 PTGER2P43116 358 aa25.22■■□□□ 1.63
PDLIM4-204ENST00000462597 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.22■■□□□ 1.63
PDLIM4-204ENST00000462597 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.22■■□□□ 1.63
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PDLIM4-204ENST00000462597 AKT1S1Q96B36 256 aa25.2■■□□□ 1.62
PDLIM4-204ENST00000462597 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PDLIM4-204ENST00000462597 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PDLIM4-204ENST00000462597 MTFR1LQ9H019 292 aa25.18■■□□□ 1.62
PDLIM4-204ENST00000462597 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PDLIM4-204ENST00000462597 C5P01031 1676 aa25.17■■□□□ 1.62
PDLIM4-204ENST00000462597 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PDLIM4-204ENST00000462597 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.15■■□□□ 1.62
PDLIM4-204ENST00000462597 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.14■■□□□ 1.62
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PDLIM4-204ENST00000462597 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.14■■□□□ 1.62
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PDLIM4-204ENST00000462597 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PDLIM4-204ENST00000462597 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.13■■□□□ 1.61
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PDLIM4-204ENST00000462597 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.09■■□□□ 1.61
PDLIM4-204ENST00000462597 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.09■■□□□ 1.61
PDLIM4-204ENST00000462597 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PDLIM4-204ENST00000462597 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
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PDLIM4-204ENST00000462597 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
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PDLIM4-204ENST00000462597 C4BP0C0L5 1744 aa25.05■■□□□ 1.6
PDLIM4-204ENST00000462597 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.04■■□□□ 1.6
PDLIM4-204ENST00000462597 SYT17Q9BSW7 474 aa25.04■■□□□ 1.6
PDLIM4-204ENST00000462597 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.03■■□□□ 1.6
PDLIM4-204ENST00000462597 MSH5O43196 834 aa25.02■■□□□ 1.6
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PDLIM4-204ENST00000462597 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
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PDLIM4-204ENST00000462597 MAP3K5Q99683 1374 aa24.96■■□□□ 1.59
PDLIM4-204ENST00000462597 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.96■■□□□ 1.59
PDLIM4-204ENST00000462597 SIK1P57059 783 aa24.96■■□□□ 1.59
PDLIM4-204ENST00000462597 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PDLIM4-204ENST00000462597 SMIM5Q71RC9 77 aa24.96■■□□□ 1.59
PDLIM4-204ENST00000462597 YY1P25490 414 aa24.95■■□□□ 1.58
PDLIM4-204ENST00000462597 MTHFSP49914 203 aa24.95■■□□□ 1.58
PDLIM4-204ENST00000462597 KDRP35968 1356 aa24.94■■□□□ 1.58
PDLIM4-204ENST00000462597 UTRNP46939 3433 aa24.94■■□□□ 1.58
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