RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.6■■■□□ 2.17
SIKE1-204ENST00000462123 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
SIKE1-204ENST00000462123 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.6■■■□□ 2.17
SIKE1-204ENST00000462123 NHSQ6T4R5 1651 aa28.59■■■□□ 2.17
SIKE1-204ENST00000462123 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.59■■■□□ 2.17
SIKE1-204ENST00000462123 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.58■■■□□ 2.17
SIKE1-204ENST00000462123 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.57■■■□□ 2.16
SIKE1-204ENST00000462123 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.56■■■□□ 2.16
SIKE1-204ENST00000462123 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.56■■■□□ 2.16
SIKE1-204ENST00000462123 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
SIKE1-204ENST00000462123 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.56■■■□□ 2.163e-8■■■□□ 14.7
SIKE1-204ENST00000462123 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
SIKE1-204ENST00000462123 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.55■■■□□ 2.16
SIKE1-204ENST00000462123 STK32BQ9NY57 414 aa28.55■■■□□ 2.16
SIKE1-204ENST00000462123 SLC15A2Q16348 729 aa28.54■■■□□ 2.16
SIKE1-204ENST00000462123 MORC1Q86VD1 984 aa28.54■■■□□ 2.16
SIKE1-204ENST00000462123 EYA1Q99502 592 aa28.54■■■□□ 2.16
SIKE1-204ENST00000462123 SPON1Q9HCB6 807 aa28.53■■■□□ 2.16
SIKE1-204ENST00000462123 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.52■■■□□ 2.16
SIKE1-204ENST00000462123 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
SIKE1-204ENST00000462123 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
SIKE1-204ENST00000462123 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
SIKE1-204ENST00000462123 SPG7Q9UQ90 795 aa28.51■■■□□ 2.15
SIKE1-204ENST00000462123 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
SIKE1-204ENST00000462123 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
SIKE1-204ENST00000462123 CYP27B1O15528 508 aa28.48■■■□□ 2.15
SIKE1-204ENST00000462123 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
SIKE1-204ENST00000462123 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
SIKE1-204ENST00000462123 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.45■■■□□ 2.15
SIKE1-204ENST00000462123 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.45■■■□□ 2.14
SIKE1-204ENST00000462123 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.45■■■□□ 2.14
SIKE1-204ENST00000462123 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.41■■■□□ 2.14
SIKE1-204ENST00000462123 BTAF1O14981 1849 aa28.41■■■□□ 2.14
SIKE1-204ENST00000462123 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.4■■■□□ 2.14
SIKE1-204ENST00000462123 AKT1S1Q96B36 256 aa28.4■■■□□ 2.14
SIKE1-204ENST00000462123 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.4■■■□□ 2.14
SIKE1-204ENST00000462123 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
SIKE1-204ENST00000462123 MTFR1LQ9H019 292 aa28.38■■■□□ 2.13
SIKE1-204ENST00000462123 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SIKE1-204ENST00000462123 PAPPAQ13219 1627 aa28.36■■■□□ 2.13
SIKE1-204ENST00000462123 PHKG2P15735 406 aa28.36■■■□□ 2.13
SIKE1-204ENST00000462123 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.36■■■□□ 2.13
SIKE1-204ENST00000462123 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.36■■■□□ 2.13
SIKE1-204ENST00000462123 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF827Q17R98 1081 aa28.35■■■□□ 2.13
SIKE1-204ENST00000462123 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
SIKE1-204ENST00000462123 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
SIKE1-204ENST00000462123 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SIKE1-204ENST00000462123 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.34■■■□□ 2.13
SIKE1-204ENST00000462123 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.34■■■□□ 2.13
SIKE1-204ENST00000462123 ZBTB7AO95365 584 aa28.33■■■□□ 2.13
SIKE1-204ENST00000462123 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
SIKE1-204ENST00000462123 IL13P35225 146 aa28.33■■■□□ 2.13
SIKE1-204ENST00000462123 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.32■■■□□ 2.12
SIKE1-204ENST00000462123 CASZ1Q86V15 1759 aa28.32■■■□□ 2.12
SIKE1-204ENST00000462123 PTGER2P43116 358 aa28.32■■■□□ 2.12
SIKE1-204ENST00000462123 KDRP35968 1356 aa28.3■■■□□ 2.12
SIKE1-204ENST00000462123 PALLDQ8WX93 1383 aa28.3■■■□□ 2.12
SIKE1-204ENST00000462123 MTHFSP49914 203 aa28.3■■■□□ 2.12
SIKE1-204ENST00000462123 PIGBQ92521 554 aa28.3■■■□□ 2.12
SIKE1-204ENST00000462123 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.29■■■□□ 2.12
SIKE1-204ENST00000462123 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.28■■■□□ 2.12
SIKE1-204ENST00000462123 DCAF5Q96JK2 942 aa28.28■■■□□ 2.12
SIKE1-204ENST00000462123 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.28■■■□□ 2.12
SIKE1-204ENST00000462123 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.28■■■□□ 2.12
SIKE1-204ENST00000462123 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
SIKE1-204ENST00000462123 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
SIKE1-204ENST00000462123 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.26■■■□□ 2.11
SIKE1-204ENST00000462123 KCNQ4P56696 695 aa28.25■■■□□ 2.11
SIKE1-204ENST00000462123 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28.24■■■□□ 2.11
SIKE1-204ENST00000462123 LY75O60449 1722 aa28.24■■■□□ 2.11
SIKE1-204ENST00000462123 FLAD1Q8NFF5 587 aa28.24■■■□□ 2.11
SIKE1-204ENST00000462123 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.22■■■□□ 2.11
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
SIKE1-204ENST00000462123 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.22■■■□□ 2.11
SIKE1-204ENST00000462123 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
SIKE1-204ENST00000462123 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.2■■■□□ 2.1
SIKE1-204ENST00000462123 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.19■■■□□ 2.1
SIKE1-204ENST00000462123 SIK1P57059 783 aa28.19■■■□□ 2.1
SIKE1-204ENST00000462123 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.18■■■□□ 2.1
SIKE1-204ENST00000462123 ARXQ96QS3 562 aa28.18■■■□□ 2.1
SIKE1-204ENST00000462123 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.17■■■□□ 2.1
SIKE1-204ENST00000462123 MAP3K5Q99683 1374 aa28.16■■■□□ 2.1
SIKE1-204ENST00000462123 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.16■■■□□ 2.1
SIKE1-204ENST00000462123 POLD1P28340 1107 aa28.16■■■□□ 2.1
SIKE1-204ENST00000462123 ATG3Q9NT62 314 aa28.16■■■□□ 2.1
SIKE1-204ENST00000462123 QSER1Q2KHR3 1735 aa28.15■■■□□ 2.1
SIKE1-204ENST00000462123 CABP4P57796 275 aa28.14■■■□□ 2.1
SIKE1-204ENST00000462123 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.14■■■□□ 2.1
SIKE1-204ENST00000462123 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
SIKE1-204ENST00000462123 SYT17Q9BSW7 474 aa28.14■■■□□ 2.1
SIKE1-204ENST00000462123 AK7Q96M32 723 aa28.12■■■□□ 2.09
SIKE1-204ENST00000462123 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
SIKE1-204ENST00000462123 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
SIKE1-204ENST00000462123 ATP6V1AP38606 617 aa28.1■■■□□ 2.09
SIKE1-204ENST00000462123 SSFA2P28290 1259 aa28.09■■■□□ 2.09
SIKE1-204ENST00000462123 CFAP53Q96M91 514 aa28.09■■■□□ 2.09
SIKE1-204ENST00000462123 HMOX1P09601 288 aa28.08■■■□□ 2.09
SIKE1-204ENST00000462123 ITGB4P16144 1822 aa28.08■■■□□ 2.09
SIKE1-204ENST00000462123 MSH5O43196 834 aa28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms