RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 MAP3K5Q99683 1374 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-203ENST00000460759 RRP1P56182 461 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
NISCH-203ENST00000460759 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
NISCH-203ENST00000460759 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
NISCH-203ENST00000460759 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
NISCH-203ENST00000460759 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 FKBP8Q14318 412 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 CFAP44Q96MT7 982 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 WDR17Q8IZU2 1322 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 GNAT3A8MTJ3 354 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 ZNF853P0CG23 659 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 CHRNA2Q15822 529 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 ZNF428Q96B54 188 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 USHBP1Q8N6Y0 703 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 NLRP2Q9NX02 1062 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.26
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NISCH-203ENST00000460759 PKD1L3Q7Z443 1732 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 TATP17735 454 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 CRB1P82279 1406 aa16.66■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 AKAP4Q5JQC9 854 aa16.66■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 POTEAQ6S8J7 498 aa16.65■□□□□ 0.26
NISCH-203ENST00000460759 FAM83GA6ND36 823 aa16.64■□□□□ 0.25
NISCH-203ENST00000460759 C1orf141Q5JVX7 400 aa16.64■□□□□ 0.25
NISCH-203ENST00000460759 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
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NISCH-203ENST00000460759 JCADQ9P266 1359 aa16.64■□□□□ 0.25
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NISCH-203ENST00000460759 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
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NISCH-203ENST00000460759 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-203ENST00000460759 PLCH1Q4KWH8 1693 aa16.62■□□□□ 0.25
NISCH-203ENST00000460759 NWD2Q9ULI1 1742 aa16.62■□□□□ 0.25
NISCH-203ENST00000460759 MEGF6O75095 1541 aa16.62■□□□□ 0.25
NISCH-203ENST00000460759 CHL1O00533 1208 aa16.62■□□□□ 0.25
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NISCH-203ENST00000460759 MCM10Q7L590 875 aa16.62■□□□□ 0.25
NISCH-203ENST00000460759 MBIPQ9NS73 344 aa16.62■□□□□ 0.25
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NISCH-203ENST00000460759 EVA1CP58658 441 aa16.61■□□□□ 0.25
NISCH-203ENST00000460759 DCTN1Q14203 1278 aa16.61■□□□□ 0.25
NISCH-203ENST00000460759 ALDH1L2Q3SY69 923 aa16.61■□□□□ 0.25
NISCH-203ENST00000460759 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
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NISCH-203ENST00000460759 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
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NISCH-203ENST00000460759 BTG4Q9NY30 223 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 TSPYL4Q9UJ04 414 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 KIF16BQ96L93 1317 aa16.58■□□□□ 0.24
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NISCH-203ENST00000460759 KDM3BQ7LBC6 1761 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 PDE3AQ14432 1141 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 IFNL2Q8IZJ0 200 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 IL17REQ8NFR9 667 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 PPP4R2Q9NY27 417 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 WNK3Q9BYP7 1800 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 IL2RBP14784 551 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 CANXP27824 592 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 CHMP4AQ9BY43 222 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 STRN4Q9NRL3 753 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 MRC1P22897 1456 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 RNMTO43148 476 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 BCAR3O75815 825 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 TEFQ10587 303 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 SMC4Q9NTJ3 1288 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 VAMP4O75379 141 aa16.54■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 PHKG2P15735 406 aa16.54■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 SLIT2O94813 1529 aa16.54■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 LRP6O75581 1613 aa16.53■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 DCAF5Q96JK2 942 aa16.53■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 DISP2A7MBM2 1401 aa16.53■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 PLIN1O60240 522 aa16.52■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 AAMPQ13685 434 aa16.52■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa16.52■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
NISCH-203ENST00000460759 SSH1Q8WYL5 1049 aa16.52■□□□□ 0.24
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