RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 NBPF4Q96M43 638 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-204ENST00000459646 DOT1LQ8TEK3 1739 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-204ENST00000459646 MSH5O43196 834 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-204ENST00000459646 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-204ENST00000459646 MTFR1LQ9H019 292 aa11.87□□□□□ -0.51
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SH3BP1-204ENST00000459646 SLC27A3Q5K4L6 730 aa11.84□□□□□ -0.51
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SH3BP1-204ENST00000459646 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.84□□□□□ -0.51
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SH3BP1-204ENST00000459646 SYT17Q9BSW7 474 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP1-204ENST00000459646 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
SH3BP1-204ENST00000459646 SHANK3Q9BYB0 1731 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP1-204ENST00000459646 FLT4P35916 1363 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-204ENST00000459646 POLD1P28340 1107 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-204ENST00000459646 CGNL1Q0VF96 1302 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP1-204ENST00000459646 INSRP06213 1382 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP1-204ENST00000459646 LY75O60449 1722 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-204ENST00000459646 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.52
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SH3BP1-204ENST00000459646 ITGB4P16144 1822 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP1-204ENST00000459646 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.8□□□□□ -0.52
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SH3BP1-204ENST00000459646 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa11.8□□□□□ -0.52
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SH3BP1-204ENST00000459646 SPG7Q9UQ90 795 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-204ENST00000459646 CHD4Q14839 1912 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP1-204ENST00000459646 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa11.79□□□□□ -0.52
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SH3BP1-204ENST00000459646 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-204ENST00000459646 CLSPNQ9HAW4 1339 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP1-204ENST00000459646 QSER1Q2KHR3 1735 aa11.77□□□□□ -0.52
SH3BP1-204ENST00000459646 CYP27B1O15528 508 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-204ENST00000459646 MSL1Q68DK7 614 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-204ENST00000459646 SGIP1Q9BQI5 828 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-204ENST00000459646 KIF24Q5T7B8 1368 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP1-204ENST00000459646 C5P01031 1676 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-204ENST00000459646 EYA1Q99502 592 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-204ENST00000459646 PANK3Q9H999 370 aa11.76□□□□□ -0.53
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SH3BP1-204ENST00000459646 NSD2O96028 1365 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP1-204ENST00000459646 TAF1LQ8IZX4 1826 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP1-204ENST00000459646 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SH3BP1-204ENST00000459646 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SH3BP1-204ENST00000459646 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP1-204ENST00000459646 PHF14O94880 888 aa11.74□□□□□ -0.53
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SH3BP1-204ENST00000459646 MORC1Q86VD1 984 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP1-204ENST00000459646 AK7Q96M32 723 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP1-204ENST00000459646 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP1-204ENST00000459646 PALLDQ8WX93 1383 aa11.74□□□□□ -0.53
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SH3BP1-204ENST00000459646 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP1-204ENST00000459646 PIGBQ92521 554 aa11.73□□□□□ -0.53
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SH3BP1-204ENST00000459646 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP1-204ENST00000459646 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SH3BP1-204ENST00000459646 FLAD1Q8NFF5 587 aa11.72□□□□□ -0.53
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SH3BP1-204ENST00000459646 PHKG2P15735 406 aa11.7□□□□□ -0.54
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SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SH3BP1-204ENST00000459646 ASAP1Q9ULH1 1129 aa11.7□□□□□ -0.54
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SH3BP1-204ENST00000459646 COL24A1Q17RW2 1714 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP1-204ENST00000459646 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
SH3BP1-204ENST00000459646 GNPATO15228 680 aa11.68□□□□□ -0.54
SH3BP1-204ENST00000459646 CABP4P57796 275 aa11.68□□□□□ -0.54
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
SH3BP1-204ENST00000459646 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.68□□□□□ -0.54
SH3BP1-204ENST00000459646 UBR3Q6ZT12 1888 aa11.68□□□□□ -0.54
SH3BP1-204ENST00000459646 MAP3K5Q99683 1374 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP1-204ENST00000459646 C1orf141Q5JVX7 400 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP1-204ENST00000459646 UTRNP46939 3433 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP1-204ENST00000459646 GRIN3BO60391 1043 aa11.66□□□□□ -0.54
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