RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, human

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CB-208	ENST00000455580	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
PPP1CB-208	ENST00000455580	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PPP1CB-208	ENST00000455580	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PPP1CB-208	ENST00000455580	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
PPP1CB-208	ENST00000455580	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PPP1CB-208	ENST00000455580	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
PPP1CB-208	ENST00000455580	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
PPP1CB-208	ENST00000455580	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
PPP1CB-208	ENST00000455580	STK32B	Q9NY57	414 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PPP1CB-208	ENST00000455580	BTAF1	O14981	1849 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PPP1CB-208	ENST00000455580	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PPP1CB-208	ENST00000455580	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC15A2	Q16348	729 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PPP1CB-208	ENST00000455580	NSD2	O96028	1365 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PPP1CB-208	ENST00000455580	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
PPP1CB-208	ENST00000455580	EYA1	Q99502	592 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PPP1CB-208	ENST00000455580	SPON1	Q9HCB6	807 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PPP1CB-208	ENST00000455580	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		32.95	■■■□□ 2.86
PPP1CB-208	ENST00000455580	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PPP1CB-208	ENST00000455580	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PPP1CB-208	ENST00000455580	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
PPP1CB-208	ENST00000455580	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PPP1CB-208	ENST00000455580	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PPP1CB-208	ENST00000455580	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PPP1CB-208	ENST00000455580	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
PPP1CB-208	ENST00000455580	MORC1	Q86VD1	984 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PPP1CB-208	ENST00000455580	CYP27B1	O15528	508 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PPP1CB-208	ENST00000455580	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PPP1CB-208	ENST00000455580	CASZ1	Q86V15	1759 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PPP1CB-208	ENST00000455580	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
PPP1CB-208	ENST00000455580	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.84	■■■□□ 2.85	2e-8	■□□□□ 11
PPP1CB-208	ENST00000455580	SPG7	Q9UQ90	795 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PPP1CB-208	ENST00000455580	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZBTB7A	O95365	584 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZNF827	Q17R98	1081 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PPP1CB-208	ENST00000455580	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
PPP1CB-208	ENST00000455580	AKT1S1	Q96B36	256 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PPP1CB-208	ENST00000455580	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
PPP1CB-208	ENST00000455580	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
PPP1CB-208	ENST00000455580	KCNQ4	P56696	695 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PPP1CB-208	ENST00000455580	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PPP1CB-208	ENST00000455580	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PPP1CB-208	ENST00000455580	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
PPP1CB-208	ENST00000455580	PTGER2	P43116	358 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PPP1CB-208	ENST00000455580	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PPP1CB-208	ENST00000455580	MTFR1L	Q9H019	292 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PPP1CB-208	ENST00000455580	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
PPP1CB-208	ENST00000455580	LY75	O60449	1722 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PPP1CB-208	ENST00000455580	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PPP1CB-208	ENST00000455580	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PPP1CB-208	ENST00000455580	PHKG2	P15735	406 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PPP1CB-208	ENST00000455580	PIGB	Q92521	554 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PPP1CB-208	ENST00000455580	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PPP1CB-208	ENST00000455580	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PPP1CB-208	ENST00000455580	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
PPP1CB-208	ENST00000455580	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PPP1CB-208	ENST00000455580	IL13	P35225	146 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PPP1CB-208	ENST00000455580	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PPP1CB-208	ENST00000455580	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PPP1CB-208	ENST00000455580	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PPP1CB-208	ENST00000455580	MTHFS	P49914	203 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PPP1CB-208	ENST00000455580	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
PPP1CB-208	ENST00000455580	ITGB4	P16144	1822 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PPP1CB-208	ENST00000455580	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
PPP1CB-208	ENST00000455580	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PPP1CB-208	ENST00000455580	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PPP1CB-208	ENST00000455580	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PPP1CB-208	ENST00000455580	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PPP1CB-208	ENST00000455580	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PPP1CB-208	ENST00000455580	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PPP1CB-208	ENST00000455580	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
PPP1CB-208	ENST00000455580	KDR	P35968	1356 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PPP1CB-208	ENST00000455580	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
PPP1CB-208	ENST00000455580	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PPP1CB-208	ENST00000455580	ARX	Q96QS3	562 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PPP1CB-208	ENST00000455580	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PPP1CB-208	ENST00000455580	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
PPP1CB-208	ENST00000455580	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
PPP1CB-208	ENST00000455580	SYT17	Q9BSW7	474 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PPP1CB-208	ENST00000455580	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PPP1CB-208	ENST00000455580	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PPP1CB-208	ENST00000455580	SIK1	P57059	783 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PPP1CB-208	ENST00000455580	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PPP1CB-208	ENST00000455580	C5	P01031	1676 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PPP1CB-208	ENST00000455580	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
PPP1CB-208	ENST00000455580	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PPP1CB-208	ENST00000455580	MSH5	O43196	834 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PPP1CB-208	ENST00000455580	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
PPP1CB-208	ENST00000455580	POLD1	P28340	1107 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PPP1CB-208	ENST00000455580	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PPP1CB-208	ENST00000455580	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PPP1CB-208	ENST00000455580	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PPP1CB-208	ENST00000455580	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PPP1CB-208	ENST00000455580	AK7	Q96M32	723 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PPP1CB-208	ENST00000455580	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PPP1CB-208	ENST00000455580	HMOX1	P09601	288 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PPP1CB-208	ENST00000455580	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.46	■■■□□ 2.79

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