RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MEGF6O75095 1541 aa15.27■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MTHFSP49914 203 aa15.26■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IL13P35225 146 aa15.25■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RGPD1P0DJD0 1748 aa15.25■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRIM37O94972 964 aa15.24■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.24■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CAMKK2Q96RR4 588 aa15.24■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SBF2Q86WG5 1849 aa15.24■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KDRP35968 1356 aa15.24■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.24■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLSCR1O15162 318 aa15.23■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DEFB132Q7Z7B7 95 aa15.23■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 USHBP1Q8N6Y0 703 aa15.23■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BAG6P46379 1132 aa15.22■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SHANK3Q9BYB0 1731 aa15.21■□□□□ 0.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.2■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PKD1L3Q7Z443 1732 aa15.2■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYP27B1O15528 508 aa15.19■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 APBA3O96018 575 aa15.19■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP2R1AP30153 589 aa15.19■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa15.19■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCNQ2O43526 872 aa15.18■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.18■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NHSQ6T4R5 1651 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCNA4P22459 653 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPG7Q9UQ90 795 aa15.17■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PROM2Q8N271 834 aa15.16■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RALBP1Q15311 655 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AMOTQ4VCS5 1084 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.15■□□□□ 0.02
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PHKG2P15735 406 aa15.14■□□□□ 0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SULT6B1Q6IMI4 303 aa15.14■□□□□ 0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IFNL2Q8IZJ0 200 aa15.13■□□□□ 0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RREB1Q92766 1687 aa15.12■□□□□ 0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.11■□□□□ 0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CFAP53Q96M91 514 aa15.11■□□□□ 0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TXNRD1Q16881 649 aa15.1■□□□□ 0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERVV-2B6SEH9 535 aa15.09■□□□□ 0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DCAF5Q96JK2 942 aa15.09■□□□□ 0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BTAF1O14981 1849 aa15.08■□□□□ 0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NUDCQ9Y266 331 aa15.08■□□□□ 0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.07■□□□□ 0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FCHSD2O94868 740 aa15.07■□□□□ 0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.07■□□□□ 0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.07■□□□□ 0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.06■□□□□ 0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa15.06■□□□□ 0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HMOX1P09601 288 aa15.06■□□□□ 0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AKAP4Q5JQC9 854 aa15.06■□□□□ 0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PIGBQ92521 554 aa15.06■□□□□ 0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NBPF14Q5TI25 921 aa15.05■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.05■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.04■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LY75O60449 1722 aa15.04■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa15.04■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ITGB4P16144 1822 aa15.03■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa15.03■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PAPPAQ13219 1627 aa15.03■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DSG3P32926 999 aa15.02■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C1orf141Q5JVX7 400 aa15.02■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PHACTR3Q96KR7 559 aa15.02■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRKAR2BP31323 418 aa15□□□□□ -0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC15A2Q16348 729 aa15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms