RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 PLSCR1O15162 318 aa14.29□□□□□ -0.12
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RABGEF1-205ENST00000450873 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
RABGEF1-205ENST00000450873 CFAP53Q96M91 514 aa14.26□□□□□ -0.13
RABGEF1-205ENST00000450873 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
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RABGEF1-205ENST00000450873 ANP32CO43423 234 aa14.24□□□□□ -0.13
RABGEF1-205ENST00000450873 IL13P35225 146 aa14.24□□□□□ -0.13
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RABGEF1-205ENST00000450873 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-205ENST00000450873 CCER2I3L3R5 266 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-205ENST00000450873 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-205ENST00000450873 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-205ENST00000450873 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-205ENST00000450873 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.04□□□□□ -0.16
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