RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449319.2

FAM89B-202, Transcript of family with sequence similarity 89 member B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM89B, Length 1,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM89B-202ENST00000449319 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
FAM89B-202ENST00000449319 BCL9O00512 1426 aa40.43■■■■■ 4.06
FAM89B-202ENST00000449319 TATP17735 454 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
FAM89B-202ENST00000449319 SHANK3Q9BYB0 1731 aa40.33■■■■■ 4.05
FAM89B-202ENST00000449319 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
FAM89B-202ENST00000449319 NCAPD2Q15021 1401 aa40.3■■■■■ 4.04
FAM89B-202ENST00000449319 MTHFSP49914 203 aa40.3■■■■■ 4.04
FAM89B-202ENST00000449319 PLSCR1O15162 318 aa40.29■■■■■ 4.04
FAM89B-202ENST00000449319 PARD3Q8TEW0 1356 aa40.29■■■■■ 4.04
FAM89B-202ENST00000449319 NHSQ6T4R5 1651 aa40.27■■■■■ 4.04
FAM89B-202ENST00000449319 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa40.27■■■■■ 4.04
FAM89B-202ENST00000449319 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
FAM89B-202ENST00000449319 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
FAM89B-202ENST00000449319 PROM2Q8N271 834 aa40.24■■■■■ 4.03
FAM89B-202ENST00000449319 IGSF1Q8N6C5 1336 aa40.24■■■■■ 4.03
FAM89B-202ENST00000449319 RREB1Q92766 1687 aa40.24■■■■■ 4.03
FAM89B-202ENST00000449319 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
FAM89B-202ENST00000449319 CYP27B1O15528 508 aa40.23■■■■■ 4.03
FAM89B-202ENST00000449319 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa40.21■■■■■ 4.03
FAM89B-202ENST00000449319 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa40.21■■■■■ 4.03
FAM89B-202ENST00000449319 IL13P35225 146 aa40.21■■■■■ 4.03
FAM89B-202ENST00000449319 NUP188Q5SRE5 1749 aa40.21■■■■■ 4.03
FAM89B-202ENST00000449319 AEBP1Q8IUX7 1158 aa40.19■■■■■ 4.02
FAM89B-202ENST00000449319 BTAF1O14981 1849 aa40.19■■■■■ 4.02
FAM89B-202ENST00000449319 SPG7Q9UQ90 795 aa40.17■■■■■ 4.02
FAM89B-202ENST00000449319 DOT1LQ8TEK3 1739 aa40.17■■■■■ 4.02
FAM89B-202ENST00000449319 TXNRD1Q16881 649 aa40.16■■■■■ 4.02
FAM89B-202ENST00000449319 PKD1L3Q7Z443 1732 aa40.15■■■■■ 4.02
FAM89B-202ENST00000449319 NBPF14Q5TI25 921 aa40.15■■■■■ 4.02
FAM89B-202ENST00000449319 SULT6B1Q6IMI4 303 aa40.14■■■■■ 4.02
FAM89B-202ENST00000449319 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
FAM89B-202ENST00000449319 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa40.13■■■■■ 4.01
FAM89B-202ENST00000449319 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP40.1■■■■■ 4.01
FAM89B-202ENST00000449319 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP40.09■■■■■ 4.01
FAM89B-202ENST00000449319 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
FAM89B-202ENST00000449319 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4
FAM89B-202ENST00000449319 HMOX1P09601 288 aa40.05■■■■■ 4
FAM89B-202ENST00000449319 PHKG2P15735 406 aa40.05■■■■■ 4
FAM89B-202ENST00000449319 IFNL2Q8IZJ0 200 aa40.05■■■■■ 4
FAM89B-202ENST00000449319 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
FAM89B-202ENST00000449319 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
FAM89B-202ENST00000449319 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa40.04■■■■■ 4
FAM89B-202ENST00000449319 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
FAM89B-202ENST00000449319 PPP2R1AP30153 589 aa40.02■■■■■ 4
FAM89B-202ENST00000449319 KCNQ4P56696 695 aa40.01■■■■■ 4
FAM89B-202ENST00000449319 LRRC4BQ9NT99 713 aa40.01■■■■■ 4
FAM89B-202ENST00000449319 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa40.01■■■■■ 4
FAM89B-202ENST00000449319 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
FAM89B-202ENST00000449319 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
FAM89B-202ENST00000449319 KDRP35968 1356 aa39.98■■■■□ 3.99
FAM89B-202ENST00000449319 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
FAM89B-202ENST00000449319 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa39.97■■■■□ 3.99
FAM89B-202ENST00000449319 AMOTQ4VCS5 1084 aa39.95■■■■□ 3.99
FAM89B-202ENST00000449319 STK32BQ9NY57 414 aa39.95■■■■□ 3.99
FAM89B-202ENST00000449319 ITGB4P16144 1822 aa39.95■■■■□ 3.99
FAM89B-202ENST00000449319 PIGBQ92521 554 aa39.94■■■■□ 3.98
FAM89B-202ENST00000449319 CFAP53Q96M91 514 aa39.91■■■■□ 3.98
FAM89B-202ENST00000449319 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa39.91■■■■□ 3.98
FAM89B-202ENST00000449319 SLC15A2Q16348 729 aa39.91■■■■□ 3.98
FAM89B-202ENST00000449319 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
FAM89B-202ENST00000449319 SLC27A3Q5K4L6 730 aa39.89■■■■□ 3.98
FAM89B-202ENST00000449319 C1orf141Q5JVX7 400 aa39.88■■■■□ 3.97
FAM89B-202ENST00000449319 TMOD3Q9NYL9 352 aa39.88■■■■□ 3.97
FAM89B-202ENST00000449319 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
FAM89B-202ENST00000449319 ZNF827Q17R98 1081 aa39.87■■■■□ 3.97
FAM89B-202ENST00000449319 LY75O60449 1722 aa39.86■■■■□ 3.97
FAM89B-202ENST00000449319 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
FAM89B-202ENST00000449319 DCAF5Q96JK2 942 aa39.85■■■■□ 3.97
FAM89B-202ENST00000449319 PALLDQ8WX93 1383 aa39.84■■■■□ 3.97
FAM89B-202ENST00000449319 PAPPAQ13219 1627 aa39.83■■■■□ 3.97
FAM89B-202ENST00000449319 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
FAM89B-202ENST00000449319 ASAP1Q9ULH1 1129 aa39.82■■■■□ 3.96
FAM89B-202ENST00000449319 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
FAM89B-202ENST00000449319 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
FAM89B-202ENST00000449319 ERVV-2B6SEH9 535 aa39.79■■■■□ 3.96
FAM89B-202ENST00000449319 AKT1S1Q96B36 256 aa39.79■■■■□ 3.96
FAM89B-202ENST00000449319 NUDCQ9Y266 331 aa39.78■■■■□ 3.96
FAM89B-202ENST00000449319 CABP4P57796 275 aa39.76■■■■□ 3.96
FAM89B-202ENST00000449319 AKAP4Q5JQC9 854 aa39.76■■■■□ 3.96
FAM89B-202ENST00000449319 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
FAM89B-202ENST00000449319 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP39.75■■■■□ 3.95
FAM89B-202ENST00000449319 ATG3Q9NT62 314 aa39.75■■■■□ 3.95
FAM89B-202ENST00000449319 LRP5O75197 1615 aa39.74■■■■□ 3.95
FAM89B-202ENST00000449319 ZBTB7AO95365 584 aa39.74■■■■□ 3.95
FAM89B-202ENST00000449319 LGR6Q9HBX8 967 aa39.74■■■■□ 3.95
FAM89B-202ENST00000449319 CASZ1Q86V15 1759 aa39.72■■■■□ 3.95
FAM89B-202ENST00000449319 PRKAR2BP31323 418 aa39.71■■■■□ 3.95
FAM89B-202ENST00000449319 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa39.7■■■■□ 3.95
FAM89B-202ENST00000449319 RSPH6AQ9H0K4 717 aa39.7■■■■□ 3.95
FAM89B-202ENST00000449319 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa39.7■■■■□ 3.95
FAM89B-202ENST00000449319 RALBP1Q15311 655 aa39.69■■■■□ 3.94
FAM89B-202ENST00000449319 PHACTR3Q96KR7 559 aa39.69■■■■□ 3.94
FAM89B-202ENST00000449319 SPON1Q9HCB6 807 aa39.69■■■■□ 3.94
FAM89B-202ENST00000449319 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
FAM89B-202ENST00000449319 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa39.68■■■■□ 3.94
FAM89B-202ENST00000449319 SIK1P57059 783 aa39.68■■■■□ 3.94
FAM89B-202ENST00000449319 RNMTO43148 476 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
FAM89B-202ENST00000449319 SCN11AQ9UI33 1791 aa39.65■■■■□ 3.94
FAM89B-202ENST00000449319 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
FAM89B-202ENST00000449319 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa39.64■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.8 ms