RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PKD1L3Q7Z443 1732 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PAPPAQ13219 1627 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NCAPD2Q15021 1401 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KIF7Q2M1P5 1343 aa19.95■□□□□ 0.78
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TXNRD1Q16881 649 aa19.94■□□□□ 0.78
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NSD2O96028 1365 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ITGB4P16144 1822 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NBPF14Q5TI25 921 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WASHC2AQ641Q2 1341 aa19.92■□□□□ 0.78
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LRRC4BQ9NT99 713 aa19.87■□□□□ 0.77
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 QSER1Q2KHR3 1735 aa19.85■□□□□ 0.77
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KCNQ4P56696 695 aa19.83■□□□□ 0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF827Q17R98 1081 aa19.83■□□□□ 0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TAF1LQ8IZX4 1826 aa19.83■□□□□ 0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC15A2Q16348 729 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MORC1Q86VD1 984 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KNSTRNQ9Y448 316 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 STK32BQ9NY57 414 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C5P01031 1676 aa19.8■□□□□ 0.76
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZBTB7AO95365 584 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPON1Q9HCB6 807 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AKT1S1Q96B36 256 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COL24A1Q17RW2 1714 aa19.75■□□□□ 0.75
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UBR3Q6ZT12 1888 aa19.7■□□□□ 0.74
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SCN11AQ9UI33 1791 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IFNL2Q8IZJ0 200 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KDRP35968 1356 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MTFR1LQ9H019 292 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SULT6B1Q6IMI4 303 aa19.67■□□□□ 0.74
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMOD3Q9NYL9 352 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ASAP1Q9ULH1 1129 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AMIGO3Q86WK7 504 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HMOX1P09601 288 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMIM5Q71RC9 77 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATG3Q9NT62 314 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF831Q5JPB2 1677 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC00116Q8NCU8 138 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SIK1P57059 783 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ITPK1Q13572 414 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AMOTQ4VCS5 1084 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DCAF5Q96JK2 942 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TJP1Q07157 1748 aa19.58■□□□□ 0.72
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