RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440779.5

SPAG16-208, Transcript of sperm associated antigen 16, humanhuman

TSL 3

Gene SPAG16, Length 805 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG16-208ENST00000440779 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.24■■□□□ 1.95
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SPAG16-208ENST00000440779 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.24■■□□□ 1.95
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SPAG16-208ENST00000440779 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
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SPAG16-208ENST00000440779 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.99■■□□□ 1.91
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SPAG16-208ENST00000440779 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.84■■□□□ 1.89
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SPAG16-208ENST00000440779 CDCA8Q53HL2 280 aa26.75■■□□□ 1.87
SPAG16-208ENST00000440779 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.75■■□□□ 1.87
SPAG16-208ENST00000440779 GNPATO15228 680 aa26.74■■□□□ 1.87
SPAG16-208ENST00000440779 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.74■■□□□ 1.87
SPAG16-208ENST00000440779 EYA1Q99502 592 aa26.72■■□□□ 1.87
SPAG16-208ENST00000440779 ATP6V1AP38606 617 aa26.71■■□□□ 1.87
SPAG16-208ENST00000440779 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
SPAG16-208ENST00000440779 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.7■■□□□ 1.87
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