RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438607.2

TMA7-201, Transcript of translation machinery associated 7 homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMA7, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA7-201ENST00000438607 POLKQ9UBT6 870 aa25.59■■□□□ 1.69
TMA7-201ENST00000438607 PLSCR1O15162 318 aa25.58■■□□□ 1.69
TMA7-201ENST00000438607 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.57■■□□□ 1.68
TMA7-201ENST00000438607 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.56■■□□□ 1.68
TMA7-201ENST00000438607 LRP5O75197 1615 aa25.55■■□□□ 1.68
TMA7-201ENST00000438607 PROM2Q8N271 834 aa25.55■■□□□ 1.68
TMA7-201ENST00000438607 NSD2O96028 1365 aa25.55■■□□□ 1.68
TMA7-201ENST00000438607 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
TMA7-201ENST00000438607 NCAPD2Q15021 1401 aa25.53■■□□□ 1.68
TMA7-201ENST00000438607 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.51■■□□□ 1.67
TMA7-201ENST00000438607 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
TMA7-201ENST00000438607 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.51■■□□□ 1.67
TMA7-201ENST00000438607 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.51■■□□□ 1.67
TMA7-201ENST00000438607 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TMA7-201ENST00000438607 TXNRD1Q16881 649 aa25.49■■□□□ 1.67
TMA7-201ENST00000438607 NBPF14Q5TI25 921 aa25.49■■□□□ 1.67
TMA7-201ENST00000438607 MORC1Q86VD1 984 aa25.49■■□□□ 1.67
TMA7-201ENST00000438607 EYA1Q99502 592 aa25.49■■□□□ 1.67
TMA7-201ENST00000438607 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TMA7-201ENST00000438607 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TMA7-201ENST00000438607 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
TMA7-201ENST00000438607 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.45■■□□□ 1.66
TMA7-201ENST00000438607 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TMA7-201ENST00000438607 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TMA7-201ENST00000438607 PAPPAQ13219 1627 aa25.44■■□□□ 1.66
TMA7-201ENST00000438607 CASZ1Q86V15 1759 aa25.43■■□□□ 1.66
TMA7-201ENST00000438607 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.42■■□□□ 1.66
TMA7-201ENST00000438607 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.42■■□□□ 1.66
TMA7-201ENST00000438607 CYP27B1O15528 508 aa25.42■■□□□ 1.66
TMA7-201ENST00000438607 LY75O60449 1722 aa25.41■■□□□ 1.66
TMA7-201ENST00000438607 ITGB4P16144 1822 aa25.4■■□□□ 1.66
TMA7-201ENST00000438607 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.38■■□□□ 1.65
TMA7-201ENST00000438607 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
TMA7-201ENST00000438607 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
TMA7-201ENST00000438607 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.38■■□□□ 1.65
TMA7-201ENST00000438607 STK32BQ9NY57 414 aa25.35■■□□□ 1.65
TMA7-201ENST00000438607 KCNQ4P56696 695 aa25.34■■□□□ 1.65
TMA7-201ENST00000438607 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
TMA7-201ENST00000438607 SLC15A2Q16348 729 aa25.34■■□□□ 1.65
TMA7-201ENST00000438607 SPG7Q9UQ90 795 aa25.33■■□□□ 1.65
TMA7-201ENST00000438607 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.33■■□□□ 1.64
TMA7-201ENST00000438607 ZNF827Q17R98 1081 aa25.32■■□□□ 1.64
TMA7-201ENST00000438607 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.32■■□□□ 1.64
TMA7-201ENST00000438607 IL13P35225 146 aa25.3■■□□□ 1.64
TMA7-201ENST00000438607 MTHFSP49914 203 aa25.3■■□□□ 1.64
TMA7-201ENST00000438607 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.642e-7■□□□□ 9
TMA7-201ENST00000438607 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
TMA7-201ENST00000438607 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.29■■□□□ 1.64
TMA7-201ENST00000438607 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.29■■□□□ 1.64
TMA7-201ENST00000438607 PHKG2P15735 406 aa25.28■■□□□ 1.64
TMA7-201ENST00000438607 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.28■■□□□ 1.64
TMA7-201ENST00000438607 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.26■■□□□ 1.63
TMA7-201ENST00000438607 ZBTB7AO95365 584 aa25.26■■□□□ 1.63
TMA7-201ENST00000438607 AKT1S1Q96B36 256 aa25.26■■□□□ 1.63
TMA7-201ENST00000438607 SPON1Q9HCB6 807 aa25.26■■□□□ 1.63
TMA7-201ENST00000438607 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.26■■□□□ 1.63
TMA7-201ENST00000438607 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.25■■□□□ 1.63
TMA7-201ENST00000438607 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TMA7-201ENST00000438607 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.25■■□□□ 1.63
TMA7-201ENST00000438607 C5P01031 1676 aa25.25■■□□□ 1.63
TMA7-201ENST00000438607 KDRP35968 1356 aa25.24■■□□□ 1.63
TMA7-201ENST00000438607 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.24■■□□□ 1.63
TMA7-201ENST00000438607 PIGBQ92521 554 aa25.24■■□□□ 1.63
TMA7-201ENST00000438607 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TMA7-201ENST00000438607 PALLDQ8WX93 1383 aa25.23■■□□□ 1.63
TMA7-201ENST00000438607 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TMA7-201ENST00000438607 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TMA7-201ENST00000438607 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TMA7-201ENST00000438607 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TMA7-201ENST00000438607 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.18■■□□□ 1.62
TMA7-201ENST00000438607 PTGER2P43116 358 aa25.18■■□□□ 1.62
TMA7-201ENST00000438607 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.18■■□□□ 1.62
TMA7-201ENST00000438607 HMOX1P09601 288 aa25.17■■□□□ 1.62
TMA7-201ENST00000438607 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.17■■□□□ 1.62
TMA7-201ENST00000438607 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TMA7-201ENST00000438607 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TMA7-201ENST00000438607 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TMA7-201ENST00000438607 MTFR1LQ9H019 292 aa25.15■■□□□ 1.62
TMA7-201ENST00000438607 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.15■■□□□ 1.62
TMA7-201ENST00000438607 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.15■■□□□ 1.62
TMA7-201ENST00000438607 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.15■■□□□ 1.62
TMA7-201ENST00000438607 C4BP0C0L5 1744 aa25.15■■□□□ 1.62
TMA7-201ENST00000438607 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
TMA7-201ENST00000438607 DCAF5Q96JK2 942 aa25.13■■□□□ 1.61
TMA7-201ENST00000438607 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.13■■□□□ 1.61
TMA7-201ENST00000438607 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.12■■□□□ 1.61
TMA7-201ENST00000438607 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TMA7-201ENST00000438607 ATG3Q9NT62 314 aa25.11■■□□□ 1.61
TMA7-201ENST00000438607 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.11■■□□□ 1.61
TMA7-201ENST00000438607 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.1■■□□□ 1.61
TMA7-201ENST00000438607 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.1■■□□□ 1.61
TMA7-201ENST00000438607 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.09■■□□□ 1.61
TMA7-201ENST00000438607 SIK1P57059 783 aa25.09■■□□□ 1.61
TMA7-201ENST00000438607 PPP2R1AP30153 589 aa25.08■■□□□ 1.61
TMA7-201ENST00000438607 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TMA7-201ENST00000438607 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TMA7-201ENST00000438607 ITPK1Q13572 414 aa25.07■■□□□ 1.6
TMA7-201ENST00000438607 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.07■■□□□ 1.6
TMA7-201ENST00000438607 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.07■■□□□ 1.6
TMA7-201ENST00000438607 CABP4P57796 275 aa25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms