RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 SPATA32Q96LK8 384 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 DAPK1P53355 1430 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 DEF6Q9H4E7 631 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 USP5P45974 858 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 SKAP1Q86WV1 359 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 METTL24Q5JXM2 366 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 AIDAQ96BJ3 306 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 SLFN5Q08AF3 891 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 STIM1Q13586 685 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRF-209ENST00000438120 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 NME9Q86XW9 330 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 MYD88Q99836 296 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 FERMT3Q86UX7 667 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 F6X3S4 739 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 MYO6Q9UM54 1294 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 CCP110O43303 1012 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 STARD3NLO95772 234 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 CDKL5O76039 1030 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 DACH1Q9UI36 760 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 CAMK4Q16566 473 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF76P36508 570 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 H0YHG0 523 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 WDR97A6NE52 1622 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 IFT140Q96RY7 1462 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 HECW1Q76N89 1606 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 MX1P20591 662 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC181Q5TID7 509 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 ADAMTS2O95450 1211 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRF-209ENST00000438120 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 NEFHP12036 1026 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 IL27Q8NEV9 243 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 CFAP45Q9UL16 551 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.828e-7■■■■■ 28.7
PTPRF-209ENST00000438120 MAP7D2Q96T17 732 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 KRT32Q14532 448 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 FOXO3O43524 673 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 ARHGEF11O15085 1522 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 TOPBP1Q92547 1522 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 GUCY1B3Q02153 619 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 CENPHQ9H3R5 247 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 TIAM1Q13009 1591 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 SYCE3A1L190 88 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 ZPR1O75312 459 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRF-209ENST00000438120 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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