RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436673.5

UPP1-208, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene UPP1, Length 918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-208ENST00000436673 SLC27A3Q5K4L6 730 aa36.82■■■■□ 3.48
UPP1-208ENST00000436673 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
UPP1-208ENST00000436673 SGIP1Q9BQI5 828 aa36.82■■■■□ 3.48
UPP1-208ENST00000436673 SHANK3Q9BYB0 1731 aa36.82■■■■□ 3.48
UPP1-208ENST00000436673 INSRP06213 1382 aa36.81■■■■□ 3.48
UPP1-208ENST00000436673 KIF20BQ96Q89 1820 aa36.81■■■■□ 3.48
UPP1-208ENST00000436673 USHBP1Q8N6Y0 703 aa36.81■■■■□ 3.48
UPP1-208ENST00000436673 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.81■■■■□ 3.48
UPP1-208ENST00000436673 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa36.8■■■■□ 3.48
UPP1-208ENST00000436673 CGNL1Q0VF96 1302 aa36.8■■■■□ 3.48
UPP1-208ENST00000436673 NSD2O96028 1365 aa36.79■■■■□ 3.48
UPP1-208ENST00000436673 KIF24Q5T7B8 1368 aa36.79■■■■□ 3.48
UPP1-208ENST00000436673 AKT1S1Q96B36 256 aa36.79■■■■□ 3.48
UPP1-208ENST00000436673 FLT4P35916 1363 aa36.78■■■■□ 3.48
UPP1-208ENST00000436673 NSD3Q9BZ95 1437 aa36.78■■■■□ 3.48
UPP1-208ENST00000436673 YY1P25490 414 aa36.78■■■■□ 3.48
UPP1-208ENST00000436673 DOT1LQ8TEK3 1739 aa36.78■■■■□ 3.48
UPP1-208ENST00000436673 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa36.77■■■■□ 3.48
UPP1-208ENST00000436673 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.75■■■■□ 3.47
UPP1-208ENST00000436673 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
UPP1-208ENST00000436673 TATP17735 454 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
UPP1-208ENST00000436673 SYT17Q9BSW7 474 aa36.72■■■■□ 3.47
UPP1-208ENST00000436673 KCNQ4P56696 695 aa36.71■■■■□ 3.47
UPP1-208ENST00000436673 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa36.7■■■■□ 3.47
UPP1-208ENST00000436673 ARXQ96QS3 562 aa36.69■■■■□ 3.46
UPP1-208ENST00000436673 LY75O60449 1722 aa36.67■■■■□ 3.46
UPP1-208ENST00000436673 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa36.66■■■■□ 3.46
UPP1-208ENST00000436673 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa36.65■■■■□ 3.46
UPP1-208ENST00000436673 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa36.65■■■■□ 3.46
UPP1-208ENST00000436673 SLC16A10Q8TF71 515 aa36.65■■■■□ 3.46
UPP1-208ENST00000436673 QSER1Q2KHR3 1735 aa36.65■■■■□ 3.46
UPP1-208ENST00000436673 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa36.64■■■■□ 3.46
UPP1-208ENST00000436673 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
UPP1-208ENST00000436673 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
UPP1-208ENST00000436673 MAP3K5Q99683 1374 aa36.61■■■■□ 3.45
UPP1-208ENST00000436673 UTRNP46939 3433 aa36.6■■■■□ 3.45
UPP1-208ENST00000436673 NCAPD2Q15021 1401 aa36.59■■■■□ 3.45
UPP1-208ENST00000436673 CYP27B1O15528 508 aa36.59■■■■□ 3.45
UPP1-208ENST00000436673 WASHC2AQ641Q2 1341 aa36.59■■■■□ 3.45
UPP1-208ENST00000436673 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa36.58■■■■□ 3.45
UPP1-208ENST00000436673 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa36.57■■■■□ 3.44
UPP1-208ENST00000436673 POLR3GLQ9BT43 218 aa36.56■■■■□ 3.44
UPP1-208ENST00000436673 POLD1P28340 1107 aa36.54■■■■□ 3.44
UPP1-208ENST00000436673 POLKQ9UBT6 870 aa36.54■■■■□ 3.44
UPP1-208ENST00000436673 COL24A1Q17RW2 1714 aa36.53■■■■□ 3.44
UPP1-208ENST00000436673 PKD1L3Q7Z443 1732 aa36.52■■■■□ 3.44
UPP1-208ENST00000436673 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa36.52■■■■□ 3.44
UPP1-208ENST00000436673 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP36.51■■■■□ 3.44
UPP1-208ENST00000436673 EYA1Q99502 592 aa36.51■■■■□ 3.44
UPP1-208ENST00000436673 PALLDQ8WX93 1383 aa36.5■■■■□ 3.43
UPP1-208ENST00000436673 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
UPP1-208ENST00000436673 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
UPP1-208ENST00000436673 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
UPP1-208ENST00000436673 SPG7Q9UQ90 795 aa36.48■■■■□ 3.43
UPP1-208ENST00000436673 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
UPP1-208ENST00000436673 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa36.47■■■■□ 3.43
UPP1-208ENST00000436673 MSH5O43196 834 aa36.44■■■■□ 3.42
UPP1-208ENST00000436673 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
UPP1-208ENST00000436673 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP36.44■■■■□ 3.42
UPP1-208ENST00000436673 C5P01031 1676 aa36.43■■■■□ 3.42
UPP1-208ENST00000436673 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
UPP1-208ENST00000436673 KLHL34Q8N239 644 aa36.43■■■■□ 3.42
UPP1-208ENST00000436673 PIGBQ92521 554 aa36.43■■■■□ 3.42
UPP1-208ENST00000436673 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
UPP1-208ENST00000436673 PANK3Q9H999 370 aa36.42■■■■□ 3.42
UPP1-208ENST00000436673 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
UPP1-208ENST00000436673 ITGB4P16144 1822 aa36.41■■■■□ 3.42
UPP1-208ENST00000436673 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
UPP1-208ENST00000436673 GPR162Q16538 588 aa36.36■■■■□ 3.41
UPP1-208ENST00000436673 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
UPP1-208ENST00000436673 TAF1LQ8IZX4 1826 aa36.36■■■■□ 3.41
UPP1-208ENST00000436673 PHKG2P15735 406 aa36.35■■■■□ 3.41
UPP1-208ENST00000436673 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
UPP1-208ENST00000436673 FLAD1Q8NFF5 587 aa36.35■■■■□ 3.41
UPP1-208ENST00000436673 MSL1Q68DK7 614 aa36.34■■■■□ 3.41
UPP1-208ENST00000436673 IFNL2Q8IZJ0 200 aa36.34■■■■□ 3.41
UPP1-208ENST00000436673 NLGN2Q8NFZ4 835 aa36.34■■■■□ 3.41
UPP1-208ENST00000436673 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa36.32■■■■□ 3.4
UPP1-208ENST00000436673 C4BP0C0L5 1744 aa36.32■■■■□ 3.4
UPP1-208ENST00000436673 TMOD3Q9NYL9 352 aa36.32■■■■□ 3.4
UPP1-208ENST00000436673 IGSF1Q8N6C5 1336 aa36.32■■■■□ 3.4
UPP1-208ENST00000436673 AK7Q96M32 723 aa36.3■■■■□ 3.4
UPP1-208ENST00000436673 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa36.29■■■■□ 3.4
UPP1-208ENST00000436673 SIK1P57059 783 aa36.29■■■■□ 3.4
UPP1-208ENST00000436673 AMIGO3Q86WK7 504 aa36.29■■■■□ 3.4
UPP1-208ENST00000436673 CHD4Q14839 1912 aa36.29■■■■□ 3.4
UPP1-208ENST00000436673 ASAP1Q9ULH1 1129 aa36.28■■■■□ 3.4
UPP1-208ENST00000436673 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
UPP1-208ENST00000436673 MORC1Q86VD1 984 aa36.24■■■■□ 3.39
UPP1-208ENST00000436673 LINC00116Q8NCU8 138 aa36.24■■■■□ 3.39
UPP1-208ENST00000436673 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
UPP1-208ENST00000436673 SMIM5Q71RC9 77 aa36.22■■■■□ 3.39
UPP1-208ENST00000436673 ATG3Q9NT62 314 aa36.22■■■■□ 3.39
UPP1-208ENST00000436673 PHF14O94880 888 aa36.21■■■■□ 3.39
UPP1-208ENST00000436673 UBR3Q6ZT12 1888 aa36.2■■■■□ 3.39
UPP1-208ENST00000436673 ITPK1Q13572 414 aa36.2■■■■□ 3.39
UPP1-208ENST00000436673 SSFA2P28290 1259 aa36.19■■■■□ 3.38
UPP1-208ENST00000436673 CD2APQ9Y5K6 639 aa36.19■■■■□ 3.38
UPP1-208ENST00000436673 ATP6V1AP38606 617 aa36.18■■■■□ 3.38
UPP1-208ENST00000436673 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms