RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434561.1

TP53BP1-208, Transcript of tumor protein p53 binding protein 1, human

TSL 3

Gene TP53BP1, Length 613 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53BP1-208	ENST00000434561	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TP53BP1-208	ENST00000434561	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
TP53BP1-208	ENST00000434561	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TP53BP1-208	ENST00000434561	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
TP53BP1-208	ENST00000434561	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TP53BP1-208	ENST00000434561	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TP53BP1-208	ENST00000434561	KLHL34	Q8N239	644 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TP53BP1-208	ENST00000434561	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TP53BP1-208	ENST00000434561	IP6K1	Q92551	441 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TP53BP1-208	ENST00000434561	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
TP53BP1-208	ENST00000434561	SYT17	Q9BSW7	474 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TP53BP1-208	ENST00000434561	MEGF6	O75095	1541 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TP53BP1-208	ENST00000434561	HOXC9	P31274	260 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TP53BP1-208	ENST00000434561	AMPH	P49418	695 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TP53BP1-208	ENST00000434561	COG3	Q96JB2	828 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TP53BP1-208	ENST00000434561	MTFR1L	Q9H019	292 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TP53BP1-208	ENST00000434561	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TP53BP1-208	ENST00000434561	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TP53BP1-208	ENST00000434561	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
TP53BP1-208	ENST00000434561	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TP53BP1-208	ENST00000434561	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TP53BP1-208	ENST00000434561	C5	P01031	1676 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TP53BP1-208	ENST00000434561	ARX	Q96QS3	562 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TP53BP1-208	ENST00000434561	NSD2	O96028	1365 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TP53BP1-208	ENST00000434561	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TP53BP1-208	ENST00000434561	AKT1S1	Q96B36	256 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TP53BP1-208	ENST00000434561	NBPF4	Q96M43	638 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TP53BP1-208	ENST00000434561	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TP53BP1-208	ENST00000434561	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TP53BP1-208	ENST00000434561	FYB1	O15117	783 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TP53BP1-208	ENST00000434561	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TP53BP1-208	ENST00000434561	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	MSH5	O43196	834 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	MSL1	Q68DK7	614 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	GPR162	Q16538	588 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	SMIM5	Q71RC9	77 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	RTL1	A6NKG5	1358 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	C4B	P0C0L5	1744 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	POLD1	P28340	1107 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TP53BP1-208	ENST00000434561	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	CYP27B1	O15528	508 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	PANK3	Q9H999	370 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	INSR	P06213	1382 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	FLT4	P35916	1363 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	MAP3K5	Q99683	1374 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	12.75	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	PALLD	Q8WX93	1383 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	UTRN	P46939	3433 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	PHF14	O94880	888 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	PIGB	Q92521	554 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	EYA1	Q99502	592 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TP53BP1-208	ENST00000434561	C1QTNF8	P60827	252 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	AK7	Q96M32	723 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	ITPK1	Q13572	414 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	POLK	Q9UBT6	870 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	NCAPD2	Q15021	1401 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	C4A	P0C0L4	1744 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	SPG7	Q9UQ90	795 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms