RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428946.5

LRRC23-204, Transcript of leucine rich repeat containing 23, humanhuman

TSL 3

Gene LRRC23, Length 969 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23-204ENST00000428946 PANK3Q9H999 370 aa25.21■■□□□ 1.63
LRRC23-204ENST00000428946 STK32BQ9NY57 414 aa25.21■■□□□ 1.63
LRRC23-204ENST00000428946 FLT4P35916 1363 aa25.2■■□□□ 1.63
LRRC23-204ENST00000428946 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
LRRC23-204ENST00000428946 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC23-204ENST00000428946 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC23-204ENST00000428946 INSRP06213 1382 aa25.18■■□□□ 1.62
LRRC23-204ENST00000428946 ZBTB7AO95365 584 aa25.18■■□□□ 1.62
LRRC23-204ENST00000428946 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
LRRC23-204ENST00000428946 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
LRRC23-204ENST00000428946 SLC15A2Q16348 729 aa25.17■■□□□ 1.62
LRRC23-204ENST00000428946 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
LRRC23-204ENST00000428946 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.15■■□□□ 1.62
LRRC23-204ENST00000428946 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.15■■□□□ 1.62
LRRC23-204ENST00000428946 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
LRRC23-204ENST00000428946 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
LRRC23-204ENST00000428946 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.14■■□□□ 1.62
LRRC23-204ENST00000428946 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC23-204ENST00000428946 NSD2O96028 1365 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC23-204ENST00000428946 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC23-204ENST00000428946 LY75O60449 1722 aa25.12■■□□□ 1.61
LRRC23-204ENST00000428946 ZNF827Q17R98 1081 aa25.12■■□□□ 1.61
LRRC23-204ENST00000428946 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
LRRC23-204ENST00000428946 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
LRRC23-204ENST00000428946 KCNQ4P56696 695 aa25.11■■□□□ 1.61
LRRC23-204ENST00000428946 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.11■■□□□ 1.61
LRRC23-204ENST00000428946 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.09■■□□□ 1.61
LRRC23-204ENST00000428946 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
LRRC23-204ENST00000428946 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.08■■□□□ 1.61
LRRC23-204ENST00000428946 PTGER2P43116 358 aa25.07■■□□□ 1.6
LRRC23-204ENST00000428946 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.06■■□□□ 1.6
LRRC23-204ENST00000428946 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.05■■□□□ 1.6
LRRC23-204ENST00000428946 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.05■■□□□ 1.6
LRRC23-204ENST00000428946 POLKQ9UBT6 870 aa25.04■■□□□ 1.6
LRRC23-204ENST00000428946 ITGB4P16144 1822 aa25.04■■□□□ 1.6
LRRC23-204ENST00000428946 NCAPD2Q15021 1401 aa25.03■■□□□ 1.6
LRRC23-204ENST00000428946 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.03■■□□□ 1.6
LRRC23-204ENST00000428946 AKT1S1Q96B36 256 aa25.03■■□□□ 1.6
LRRC23-204ENST00000428946 MTFR1LQ9H019 292 aa25.03■■□□□ 1.6
LRRC23-204ENST00000428946 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.03■■□□□ 1.6
LRRC23-204ENST00000428946 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.03■■□□□ 1.6
LRRC23-204ENST00000428946 CYP27B1O15528 508 aa25.01■■□□□ 1.59
LRRC23-204ENST00000428946 EYA1Q99502 592 aa25■■□□□ 1.59
LRRC23-204ENST00000428946 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
LRRC23-204ENST00000428946 C5P01031 1676 aa24.99■■□□□ 1.59
LRRC23-204ENST00000428946 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.98■■□□□ 1.59
LRRC23-204ENST00000428946 MORC1Q86VD1 984 aa24.98■■□□□ 1.59
LRRC23-204ENST00000428946 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.98■■□□□ 1.59
LRRC23-204ENST00000428946 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
LRRC23-204ENST00000428946 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
LRRC23-204ENST00000428946 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
LRRC23-204ENST00000428946 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.96■■□□□ 1.59
LRRC23-204ENST00000428946 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
LRRC23-204ENST00000428946 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.96■■□□□ 1.59
LRRC23-204ENST00000428946 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.96■■□□□ 1.59
LRRC23-204ENST00000428946 PALLDQ8WX93 1383 aa24.93■■□□□ 1.58
LRRC23-204ENST00000428946 SPG7Q9UQ90 795 aa24.93■■□□□ 1.58
LRRC23-204ENST00000428946 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.92■■□□□ 1.58
LRRC23-204ENST00000428946 ARXQ96QS3 562 aa24.91■■□□□ 1.58
LRRC23-204ENST00000428946 SYT17Q9BSW7 474 aa24.91■■□□□ 1.58
LRRC23-204ENST00000428946 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.9■■□□□ 1.58
LRRC23-204ENST00000428946 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
LRRC23-204ENST00000428946 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
LRRC23-204ENST00000428946 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.87■■□□□ 1.57
LRRC23-204ENST00000428946 C4BP0C0L5 1744 aa24.87■■□□□ 1.57
LRRC23-204ENST00000428946 MSH5O43196 834 aa24.87■■□□□ 1.57
LRRC23-204ENST00000428946 YY1P25490 414 aa24.87■■□□□ 1.57
LRRC23-204ENST00000428946 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
LRRC23-204ENST00000428946 KLHL34Q8N239 644 aa24.87■■□□□ 1.57
LRRC23-204ENST00000428946 PIGBQ92521 554 aa24.87■■□□□ 1.57
LRRC23-204ENST00000428946 PHKG2P15735 406 aa24.86■■□□□ 1.57
LRRC23-204ENST00000428946 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.86■■□□□ 1.57
LRRC23-204ENST00000428946 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
LRRC23-204ENST00000428946 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
LRRC23-204ENST00000428946 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.84■■□□□ 1.57
LRRC23-204ENST00000428946 POLD1P28340 1107 aa24.83■■□□□ 1.57
LRRC23-204ENST00000428946 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.83■■□□□ 1.57
LRRC23-204ENST00000428946 MSL1Q68DK7 614 aa24.82■■□□□ 1.56
LRRC23-204ENST00000428946 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.82■■□□□ 1.56
LRRC23-204ENST00000428946 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.82■■□□□ 1.56
LRRC23-204ENST00000428946 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
LRRC23-204ENST00000428946 MAP3K5Q99683 1374 aa24.8■■□□□ 1.56
LRRC23-204ENST00000428946 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.8■■□□□ 1.56
LRRC23-204ENST00000428946 MTHFSP49914 203 aa24.79■■□□□ 1.56
LRRC23-204ENST00000428946 SMIM5Q71RC9 77 aa24.79■■□□□ 1.56
LRRC23-204ENST00000428946 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.79■■□□□ 1.56
LRRC23-204ENST00000428946 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.77■■□□□ 1.56
LRRC23-204ENST00000428946 SIK1P57059 783 aa24.77■■□□□ 1.56
LRRC23-204ENST00000428946 AK7Q96M32 723 aa24.77■■□□□ 1.56
LRRC23-204ENST00000428946 PHF14O94880 888 aa24.76■■□□□ 1.55
LRRC23-204ENST00000428946 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
LRRC23-204ENST00000428946 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.76■■□□□ 1.55
LRRC23-204ENST00000428946 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.76■■□□□ 1.55
LRRC23-204ENST00000428946 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.76■■□□□ 1.55
LRRC23-204ENST00000428946 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
LRRC23-204ENST00000428946 CHD4Q14839 1912 aa24.75■■□□□ 1.55
LRRC23-204ENST00000428946 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
LRRC23-204ENST00000428946 IL13P35225 146 aa24.74■■□□□ 1.55
LRRC23-204ENST00000428946 ITPK1Q13572 414 aa24.74■■□□□ 1.55
LRRC23-204ENST00000428946 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.74■■□□□ 1.55
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