RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 BCL9O00512 1426 aa33.97■■■■□ 3.03
HTATSF1-202ENST00000425695 CAMKK2Q96RR4 588 aa33.97■■■■□ 3.03
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNQ2O43526 872 aa33.96■■■■□ 3.03
HTATSF1-202ENST00000425695 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
HTATSF1-202ENST00000425695 MTHFSP49914 203 aa33.95■■■■□ 3.03
HTATSF1-202ENST00000425695 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa33.95■■■■□ 3.02
HTATSF1-202ENST00000425695 NCAPD2Q15021 1401 aa33.89■■■■□ 3.02
HTATSF1-202ENST00000425695 SHANK3Q9BYB0 1731 aa33.89■■■■□ 3.02
HTATSF1-202ENST00000425695 IGSF1Q8N6C5 1336 aa33.85■■■■□ 3.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PARD3Q8TEW0 1356 aa33.85■■■■□ 3.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PLSCR1O15162 318 aa33.84■■■■□ 3.01
HTATSF1-202ENST00000425695 IL13P35225 146 aa33.84■■■■□ 3.01
HTATSF1-202ENST00000425695 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
HTATSF1-202ENST00000425695 NHSQ6T4R5 1651 aa33.84■■■■□ 3.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa33.83■■■■□ 3.01
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa33.83■■■■□ 3.01
HTATSF1-202ENST00000425695 CYP27B1O15528 508 aa33.82■■■■□ 3
HTATSF1-202ENST00000425695 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
HTATSF1-202ENST00000425695 SPG7Q9UQ90 795 aa33.82■■■■□ 3
HTATSF1-202ENST00000425695 AEBP1Q8IUX7 1158 aa33.81■■■■□ 3
HTATSF1-202ENST00000425695 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
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HTATSF1-202ENST00000425695 SULT6B1Q6IMI4 303 aa33.79■■■■□ 3
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HTATSF1-202ENST00000425695 PROM2Q8N271 834 aa33.77■■■■□ 3
HTATSF1-202ENST00000425695 PKD1L3Q7Z443 1732 aa33.76■■■■□ 3
HTATSF1-202ENST00000425695 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP33.76■■■□□ 2.993e-17■■■■■ 72.3
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HTATSF1-202ENST00000425695 BTAF1O14981 1849 aa33.76■■■□□ 2.99
HTATSF1-202ENST00000425695 DOT1LQ8TEK3 1739 aa33.76■■■□□ 2.99
HTATSF1-202ENST00000425695 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
HTATSF1-202ENST00000425695 TXNRD1Q16881 649 aa33.74■■■□□ 2.99
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP2R1AP30153 589 aa33.73■■■□□ 2.99
HTATSF1-202ENST00000425695 NUP188Q5SRE5 1749 aa33.73■■■□□ 2.99
HTATSF1-202ENST00000425695 NBPF14Q5TI25 921 aa33.72■■■□□ 2.99
HTATSF1-202ENST00000425695 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
HTATSF1-202ENST00000425695 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa33.71■■■□□ 2.99
HTATSF1-202ENST00000425695 HMOX1P09601 288 aa33.71■■■□□ 2.99
HTATSF1-202ENST00000425695 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
HTATSF1-202ENST00000425695 IFNL2Q8IZJ0 200 aa33.7■■■□□ 2.99
HTATSF1-202ENST00000425695 PHKG2P15735 406 aa33.69■■■□□ 2.98
HTATSF1-202ENST00000425695 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
HTATSF1-202ENST00000425695 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
HTATSF1-202ENST00000425695 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa33.67■■■□□ 2.98
HTATSF1-202ENST00000425695 CFAP53Q96M91 514 aa33.67■■■□□ 2.98
HTATSF1-202ENST00000425695 KDRP35968 1356 aa33.66■■■□□ 2.98
HTATSF1-202ENST00000425695 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
HTATSF1-202ENST00000425695 AMOTQ4VCS5 1084 aa33.65■■■□□ 2.98
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
HTATSF1-202ENST00000425695 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
HTATSF1-202ENST00000425695 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa33.61■■■□□ 2.97
HTATSF1-202ENST00000425695 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa33.61■■■□□ 2.97
HTATSF1-202ENST00000425695 ITGB4P16144 1822 aa33.59■■■□□ 2.97
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNQ4P56696 695 aa33.59■■■□□ 2.97
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC4BQ9NT99 713 aa33.59■■■□□ 2.97
HTATSF1-202ENST00000425695 C1orf141Q5JVX7 400 aa33.57■■■□□ 2.96
HTATSF1-202ENST00000425695 PIGBQ92521 554 aa33.57■■■□□ 2.96
HTATSF1-202ENST00000425695 STK32BQ9NY57 414 aa33.56■■■□□ 2.96
HTATSF1-202ENST00000425695 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
HTATSF1-202ENST00000425695 TMOD3Q9NYL9 352 aa33.55■■■□□ 2.96
HTATSF1-202ENST00000425695 NUDCQ9Y266 331 aa33.54■■■□□ 2.96
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC27A3Q5K4L6 730 aa33.53■■■□□ 2.96
HTATSF1-202ENST00000425695 DCAF5Q96JK2 942 aa33.53■■■□□ 2.96
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC15A2Q16348 729 aa33.51■■■□□ 2.95
HTATSF1-202ENST00000425695 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.95
HTATSF1-202ENST00000425695 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
HTATSF1-202ENST00000425695 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP33.5■■■□□ 2.95
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HTATSF1-202ENST00000425695 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
HTATSF1-202ENST00000425695 LY75O60449 1722 aa33.5■■■□□ 2.95
HTATSF1-202ENST00000425695 ERVV-2B6SEH9 535 aa33.49■■■□□ 2.95
HTATSF1-202ENST00000425695 PALLDQ8WX93 1383 aa33.48■■■□□ 2.95
HTATSF1-202ENST00000425695 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
HTATSF1-202ENST00000425695 AKAP4Q5JQC9 854 aa33.48■■■□□ 2.95
HTATSF1-202ENST00000425695 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
HTATSF1-202ENST00000425695 CABP4P57796 275 aa33.47■■■□□ 2.95
HTATSF1-202ENST00000425695 ASAP1Q9ULH1 1129 aa33.47■■■□□ 2.95
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF827Q17R98 1081 aa33.46■■■□□ 2.95
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HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
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HTATSF1-202ENST00000425695 RSPH6AQ9H0K4 717 aa33.44■■■□□ 2.94
HTATSF1-202ENST00000425695 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa33.43■■■□□ 2.94
HTATSF1-202ENST00000425695 LGR6Q9HBX8 967 aa33.43■■■□□ 2.94
HTATSF1-202ENST00000425695 PAPPAQ13219 1627 aa33.42■■■□□ 2.94
HTATSF1-202ENST00000425695 ATG3Q9NT62 314 aa33.42■■■□□ 2.94
HTATSF1-202ENST00000425695 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa33.41■■■□□ 2.94
HTATSF1-202ENST00000425695 AKT1S1Q96B36 256 aa33.41■■■□□ 2.94
HTATSF1-202ENST00000425695 PHACTR3Q96KR7 559 aa33.41■■■□□ 2.94
HTATSF1-202ENST00000425695 RNMTO43148 476 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
HTATSF1-202ENST00000425695 FCHSD2O94868 740 aa33.37■■■□□ 2.93
HTATSF1-202ENST00000425695 GAS2L2Q8NHY3 880 aa33.37■■■□□ 2.93
HTATSF1-202ENST00000425695 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa33.37■■■□□ 2.93
HTATSF1-202ENST00000425695 SCN11AQ9UI33 1791 aa33.37■■■□□ 2.93
HTATSF1-202ENST00000425695 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa33.36■■■□□ 2.93
HTATSF1-202ENST00000425695 SIK1P57059 783 aa33.36■■■□□ 2.93
HTATSF1-202ENST00000425695 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBTB7AO95365 584 aa33.35■■■□□ 2.93
HTATSF1-202ENST00000425695 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
HTATSF1-202ENST00000425695 CASZ1Q86V15 1759 aa33.32■■■□□ 2.92
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