RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 VPS72Q15906 364 aa22.25■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 WWC1Q8IX03 1113 aa22.25■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF521Q96K83 1311 aa22.24■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDE3BQ13370 1112 aa22.24■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPG7Q9UQ90 795 aa22.24■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.24■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.24■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.24■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 NRAPQ86VF7 1730 aa22.23■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.23■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 MEGF6O75095 1541 aa22.23■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP35Q9P2H5 1018 aa22.23■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.23■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 AFF2P51816 1311 aa22.22■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR63Q8IWG1 891 aa22.21■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.2■■□□□ 1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.19■■□□□ 1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLGA2Q08379 1002 aa22.19■■□□□ 1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.19■■□□□ 1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 BARGINQ6ZT62 677 aa22.19■■□□□ 1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 DISP2A7MBM2 1401 aa22.19■■□□□ 1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP3K5Q99683 1374 aa22.18■■□□□ 1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.18■■□□□ 1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL16Q14005 1332 aa22.16■■□□□ 1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.16■■□□□ 1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.16■■□□□ 1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.15■■□□□ 1.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATRNO75882 1429 aa22.14■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 E9PSI1 815 aa22.13■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHKG2P15735 406 aa22.12■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 EXOC5O00471 708 aa22.12■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 MCM10Q7L590 875 aa22.12■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYP27B1O15528 508 aa22.11■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLFN5Q08AF3 891 aa22.11■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.11■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCTN1Q14203 1278 aa22.1■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.1■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.1■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.09■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL17REQ8NFR9 667 aa22.09■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCAF5Q96JK2 942 aa22.09■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNS2Q63HR2 1409 aa22.09■■□□□ 1.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 GNAI1P63096 354 aa22.08■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDB1Q16531 1140 aa22.08■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFT57Q9NWB7 429 aa22.08■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.07■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 CFAP44Q96MT7 982 aa22.07■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.06■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF853P0CG23 659 aa22.05■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 LGR6Q9HBX8 967 aa22.05■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 TEFQ10587 303 aa22.04■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.04■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLI3P10071 1580 aa22.02■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHL1O00533 1208 aa22.02■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.01■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC37A3O60309 1634 aa22.01■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.01■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0G2JS52 829 aa22■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERVV-2B6SEH9 535 aa22■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYT1Q01538 1121 aa22■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.99■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 MBIPQ9NS73 344 aa21.99■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.99■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.99■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.98■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.98■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRC1P22897 1456 aa21.97■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 CABP4P57796 275 aa21.97■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.97■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.96■■□□□ 1.11
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