RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417058.6

CD27-AS1-202, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 1,497 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-202ENST00000417058 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.32
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CD27-AS1-202ENST00000417058 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-202ENST00000417058 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa13.07□□□□□ -0.32
CD27-AS1-202ENST00000417058 MEGF6O75095 1541 aa13.07□□□□□ -0.32
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CD27-AS1-202ENST00000417058 AMOTQ4VCS5 1084 aa13.04□□□□□ -0.32
CD27-AS1-202ENST00000417058 GAS2L2Q8NHY3 880 aa13.04□□□□□ -0.32
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CD27-AS1-202ENST00000417058 PKD1L3Q7Z443 1732 aa13.03□□□□□ -0.32
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CD27-AS1-202ENST00000417058 ZNF521Q96K83 1311 aa13.02□□□□□ -0.33
CD27-AS1-202ENST00000417058 DLG5Q8TDM6 1919 aa13.01□□□□□ -0.33
CD27-AS1-202ENST00000417058 NEUROD2Q15784 382 aa13.01□□□□□ -0.33
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CD27-AS1-202ENST00000417058 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa12.98□□□□□ -0.33
CD27-AS1-202ENST00000417058 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa12.98□□□□□ -0.33
CD27-AS1-202ENST00000417058 CYP27B1O15528 508 aa12.97□□□□□ -0.33
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CD27-AS1-202ENST00000417058 TNS2Q63HR2 1409 aa12.97□□□□□ -0.33
CD27-AS1-202ENST00000417058 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa12.97□□□□□ -0.33
CD27-AS1-202ENST00000417058 EXOC5O00471 708 aa12.97□□□□□ -0.33
CD27-AS1-202ENST00000417058 C1orf141Q5JVX7 400 aa12.97□□□□□ -0.33
CD27-AS1-202ENST00000417058 WDR63Q8IWG1 891 aa12.97□□□□□ -0.33
CD27-AS1-202ENST00000417058 IFNL2Q8IZJ0 200 aa12.97□□□□□ -0.33
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CD27-AS1-202ENST00000417058 DCTN1Q14203 1278 aa12.95□□□□□ -0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 MCM10Q7L590 875 aa12.95□□□□□ -0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 IL17REQ8NFR9 667 aa12.95□□□□□ -0.34
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CD27-AS1-202ENST00000417058 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 IL16Q14005 1332 aa12.93□□□□□ -0.34
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CD27-AS1-202ENST00000417058 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa12.93□□□□□ -0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 DCAF5Q96JK2 942 aa12.93□□□□□ -0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 LGR6Q9HBX8 967 aa12.93□□□□□ -0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 RNMTO43148 476 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 CDCA7LQ96GN5 454 aa12.92□□□□□ -0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 SCN11AQ9UI33 1791 aa12.92□□□□□ -0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 ZNF853P0CG23 659 aa12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 SLFN5Q08AF3 891 aa12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-202ENST00000417058 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
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