RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 SULT6B1Q6IMI4 303 aa36.85■■■■□ 3.49
FAAP20-204ENST00000400919 SPG7Q9UQ90 795 aa36.85■■■■□ 3.49
FAAP20-204ENST00000400919 BCL9O00512 1426 aa36.85■■■■□ 3.49
FAAP20-204ENST00000400919 TRIM37O94972 964 aa36.85■■■■□ 3.49
FAAP20-204ENST00000400919 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP36.85■■■■□ 3.49
FAAP20-204ENST00000400919 NUDCQ9Y266 331 aa36.84■■■■□ 3.49
FAAP20-204ENST00000400919 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa36.83■■■■□ 3.49
FAAP20-204ENST00000400919 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa36.82■■■■□ 3.49
FAAP20-204ENST00000400919 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa36.82■■■■□ 3.49
FAAP20-204ENST00000400919 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
FAAP20-204ENST00000400919 AEBP1Q8IUX7 1158 aa36.8■■■■□ 3.48
FAAP20-204ENST00000400919 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
FAAP20-204ENST00000400919 KDRP35968 1356 aa36.8■■■■□ 3.48
FAAP20-204ENST00000400919 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
FAAP20-204ENST00000400919 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
FAAP20-204ENST00000400919 AMOTQ4VCS5 1084 aa36.76■■■■□ 3.48
FAAP20-204ENST00000400919 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
FAAP20-204ENST00000400919 HMOX1P09601 288 aa36.76■■■■□ 3.47
FAAP20-204ENST00000400919 BAG6P46379 1132 aa36.76■■■■□ 3.47
FAAP20-204ENST00000400919 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.47
FAAP20-204ENST00000400919 RGPD1P0DJD0 1748 aa36.73■■■■□ 3.47
FAAP20-204ENST00000400919 CYP27B1O15528 508 aa36.72■■■■□ 3.47
FAAP20-204ENST00000400919 APBA3O96018 575 aa36.72■■■■□ 3.47
FAAP20-204ENST00000400919 ACSBG1Q96GR2 724 aa36.7■■■■□ 3.47
FAAP20-204ENST00000400919 IFNL2Q8IZJ0 200 aa36.69■■■■□ 3.46
FAAP20-204ENST00000400919 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
FAAP20-204ENST00000400919 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP36.68■■■■□ 3.46
FAAP20-204ENST00000400919 DEFB132Q7Z7B7 95 aa36.68■■■■□ 3.46
FAAP20-204ENST00000400919 PKD1L3Q7Z443 1732 aa36.65■■■■□ 3.46
FAAP20-204ENST00000400919 KCNQ2O43526 872 aa36.65■■■■□ 3.46
FAAP20-204ENST00000400919 PHKG2P15735 406 aa36.65■■■■□ 3.46
FAAP20-204ENST00000400919 ANP32CO43423 234 aa36.64■■■■□ 3.46
FAAP20-204ENST00000400919 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
FAAP20-204ENST00000400919 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
FAAP20-204ENST00000400919 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
FAAP20-204ENST00000400919 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
FAAP20-204ENST00000400919 C1orf141Q5JVX7 400 aa36.63■■■■□ 3.45
FAAP20-204ENST00000400919 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
FAAP20-204ENST00000400919 SHANK3Q9BYB0 1731 aa36.62■■■■□ 3.45
FAAP20-204ENST00000400919 FCHSD2O94868 740 aa36.61■■■■□ 3.45
FAAP20-204ENST00000400919 PTF1AQ7RTS3 328 aa36.6■■■■□ 3.45
FAAP20-204ENST00000400919 PLSCR1O15162 318 aa36.59■■■■□ 3.45
FAAP20-204ENST00000400919 RSPH6AQ9H0K4 717 aa36.58■■■■□ 3.45
FAAP20-204ENST00000400919 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.45
FAAP20-204ENST00000400919 PRKAR2BP31323 418 aa36.57■■■■□ 3.44
FAAP20-204ENST00000400919 SBF2Q86WG5 1849 aa36.57■■■■□ 3.44
FAAP20-204ENST00000400919 DCAF5Q96JK2 942 aa36.56■■■■□ 3.44
FAAP20-204ENST00000400919 CAMKK2Q96RR4 588 aa36.56■■■■□ 3.44
FAAP20-204ENST00000400919 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
FAAP20-204ENST00000400919 NHSQ6T4R5 1651 aa36.54■■■■□ 3.44
FAAP20-204ENST00000400919 NEFMP07197 916 aa36.53■■■■□ 3.44
FAAP20-204ENST00000400919 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
FAAP20-204ENST00000400919 AKAP4Q5JQC9 854 aa36.53■■■■□ 3.44
FAAP20-204ENST00000400919 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
FAAP20-204ENST00000400919 GAS2L2Q8NHY3 880 aa36.52■■■■□ 3.44
FAAP20-204ENST00000400919 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa36.51■■■■□ 3.43
FAAP20-204ENST00000400919 KAT6BQ8WYB5 2073 aa36.5■■■■□ 3.43
FAAP20-204ENST00000400919 ERVV-2B6SEH9 535 aa36.48■■■■□ 3.43
FAAP20-204ENST00000400919 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP36.48■■■■□ 3.43
FAAP20-204ENST00000400919 TMOD3Q9NYL9 352 aa36.47■■■■□ 3.43
FAAP20-204ENST00000400919 PHACTR3Q96KR7 559 aa36.46■■■■□ 3.43
FAAP20-204ENST00000400919 DOT1LQ8TEK3 1739 aa36.46■■■■□ 3.43
FAAP20-204ENST00000400919 CABP4P57796 275 aa36.42■■■■□ 3.42
FAAP20-204ENST00000400919 PIGBQ92521 554 aa36.42■■■■□ 3.42
FAAP20-204ENST00000400919 GNAT3A8MTJ3 354 aa36.41■■■■□ 3.42
FAAP20-204ENST00000400919 TXNRD1Q16881 649 aa36.41■■■■□ 3.42
FAAP20-204ENST00000400919 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
FAAP20-204ENST00000400919 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa36.39■■■■□ 3.42
FAAP20-204ENST00000400919 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
FAAP20-204ENST00000400919 MAP3K5Q99683 1374 aa36.38■■■■□ 3.41
FAAP20-204ENST00000400919 BTAF1O14981 1849 aa36.38■■■■□ 3.41
FAAP20-204ENST00000400919 PROM2Q8N271 834 aa36.37■■■■□ 3.41
FAAP20-204ENST00000400919 PLEKHF1Q96S99 279 aa36.37■■■■□ 3.41
FAAP20-204ENST00000400919 RNMTO43148 476 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
FAAP20-204ENST00000400919 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
FAAP20-204ENST00000400919 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa36.36■■■■□ 3.41
FAAP20-204ENST00000400919 SLC27A3Q5K4L6 730 aa36.35■■■■□ 3.41
FAAP20-204ENST00000400919 NBPF14Q5TI25 921 aa36.35■■■■□ 3.41
FAAP20-204ENST00000400919 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa36.35■■■■□ 3.41
FAAP20-204ENST00000400919 LGR6Q9HBX8 967 aa36.34■■■■□ 3.41
FAAP20-204ENST00000400919 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa36.34■■■■□ 3.41
FAAP20-204ENST00000400919 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
FAAP20-204ENST00000400919 ADAMTS8Q9UP79 889 aa36.33■■■■□ 3.41
FAAP20-204ENST00000400919 PALLDQ8WX93 1383 aa36.32■■■■□ 3.41
FAAP20-204ENST00000400919 MRS2Q9HD23 443 aa36.32■■■■□ 3.4
FAAP20-204ENST00000400919 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
FAAP20-204ENST00000400919 SLC52A2Q9HAB3 445 aa36.31■■■■□ 3.4
FAAP20-204ENST00000400919 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
FAAP20-204ENST00000400919 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
FAAP20-204ENST00000400919 ASAP1Q9ULH1 1129 aa36.28■■■■□ 3.4
FAAP20-204ENST00000400919 NFE2L2Q16236 605 aa36.27■■■■□ 3.4
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC184Q52MB2 194 aa36.27■■■■□ 3.4
FAAP20-204ENST00000400919 IL17REQ8NFR9 667 aa36.27■■■■□ 3.4
FAAP20-204ENST00000400919 ITGB4P16144 1822 aa36.27■■■■□ 3.4
FAAP20-204ENST00000400919 TEFQ10587 303 aa36.26■■■■□ 3.4
FAAP20-204ENST00000400919 ATG3Q9NT62 314 aa36.26■■■■□ 3.4
FAAP20-204ENST00000400919 RUNDC1Q96C34 613 aa36.25■■■■□ 3.39
FAAP20-204ENST00000400919 RREB1Q92766 1687 aa36.25■■■■□ 3.39
FAAP20-204ENST00000400919 LRRC4BQ9NT99 713 aa36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms