RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 AMPHP49418 695 aa18.71■□□□□ 0.59
CNGA3-202ENST00000393503 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa18.71■□□□□ 0.59
CNGA3-202ENST00000393503 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
CNGA3-202ENST00000393503 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa18.7■□□□□ 0.58
CNGA3-202ENST00000393503 RTL1A6NKG5 1358 aa18.69■□□□□ 0.58
CNGA3-202ENST00000393503 LY75O60449 1722 aa18.69■□□□□ 0.58
CNGA3-202ENST00000393503 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa18.68■□□□□ 0.58
CNGA3-202ENST00000393503 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CNGA3-202ENST00000393503 ARXQ96QS3 562 aa18.68■□□□□ 0.58
CNGA3-202ENST00000393503 CARD14Q9BXL6 1004 aa18.68■□□□□ 0.58
CNGA3-202ENST00000393503 COL24A1Q17RW2 1714 aa18.67■□□□□ 0.58
CNGA3-202ENST00000393503 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
CNGA3-202ENST00000393503 QSER1Q2KHR3 1735 aa18.66■□□□□ 0.58
CNGA3-202ENST00000393503 SLC27A3Q5K4L6 730 aa18.66■□□□□ 0.58
CNGA3-202ENST00000393503 MAP3K5Q99683 1374 aa18.66■□□□□ 0.58
CNGA3-202ENST00000393503 TMF1P82094 1093 aa18.65■□□□□ 0.58
CNGA3-202ENST00000393503 KIF20BQ96Q89 1820 aa18.63■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa18.63■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 INSRP06213 1382 aa18.63■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa18.61■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 DCAF8L1A6NGE4 600 aa18.61■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 SLC24A1O60721 1099 aa18.61■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 NSD3Q9BZ95 1437 aa18.6■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 FLT4P35916 1363 aa18.6■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 CYP27B1O15528 508 aa18.6■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 NLGN2Q8NFZ4 835 aa18.6■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa18.6■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 NCAPD2Q15021 1401 aa18.59■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 AMIGO3Q86WK7 504 aa18.59■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 SLC16A10Q8TF71 515 aa18.59■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 CGNL1Q0VF96 1302 aa18.58■□□□□ 0.57
CNGA3-202ENST00000393503 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa18.57■□□□□ 0.56
CNGA3-202ENST00000393503 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CNGA3-202ENST00000393503 KIF24Q5T7B8 1368 aa18.56■□□□□ 0.56
CNGA3-202ENST00000393503 TATP17735 454 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CNGA3-202ENST00000393503 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa18.56■□□□□ 0.56
CNGA3-202ENST00000393503 PKD1L3Q7Z443 1732 aa18.55■□□□□ 0.56
CNGA3-202ENST00000393503 SMIM5Q71RC9 77 aa18.55■□□□□ 0.56
CNGA3-202ENST00000393503 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa18.54■□□□□ 0.56
CNGA3-202ENST00000393503 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa18.54■□□□□ 0.56
CNGA3-202ENST00000393503 C5P01031 1676 aa18.54■□□□□ 0.56
CNGA3-202ENST00000393503 MSL1Q68DK7 614 aa18.54■□□□□ 0.56
CNGA3-202ENST00000393503 KLHL34Q8N239 644 aa18.54■□□□□ 0.56
CNGA3-202ENST00000393503 PALLDQ8WX93 1383 aa18.54■□□□□ 0.56
CNGA3-202ENST00000393503 CHD4Q14839 1912 aa18.53■□□□□ 0.56
CNGA3-202ENST00000393503 TAF1LQ8IZX4 1826 aa18.52■□□□□ 0.56
CNGA3-202ENST00000393503 POLD1P28340 1107 aa18.52■□□□□ 0.56
CNGA3-202ENST00000393503 CDCA8Q53HL2 280 aa18.52■□□□□ 0.56
CNGA3-202ENST00000393503 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa18.52■□□□□ 0.56
CNGA3-202ENST00000393503 ITGB4P16144 1822 aa18.51■□□□□ 0.55
CNGA3-202ENST00000393503 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
CNGA3-202ENST00000393503 PIGBQ92521 554 aa18.51■□□□□ 0.55
CNGA3-202ENST00000393503 EYA1Q99502 592 aa18.51■□□□□ 0.55
CNGA3-202ENST00000393503 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.5■□□□□ 0.55
CNGA3-202ENST00000393503 GPR162Q16538 588 aa18.5■□□□□ 0.55
CNGA3-202ENST00000393503 POLKQ9UBT6 870 aa18.5■□□□□ 0.55
CNGA3-202ENST00000393503 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CNGA3-202ENST00000393503 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CNGA3-202ENST00000393503 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CNGA3-202ENST00000393503 C4BP0C0L5 1744 aa18.49■□□□□ 0.55
CNGA3-202ENST00000393503 MSH5O43196 834 aa18.48■□□□□ 0.55
CNGA3-202ENST00000393503 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CNGA3-202ENST00000393503 LINC00116Q8NCU8 138 aa18.46■□□□□ 0.55
CNGA3-202ENST00000393503 UBR3Q6ZT12 1888 aa18.46■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 ITPK1Q13572 414 aa18.44■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 ASAP1Q9ULH1 1129 aa18.44■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.44■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 PHKG2P15735 406 aa18.43■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa18.41■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 SIK1P57059 783 aa18.41■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 SLC4A9Q96Q91 983 aa18.41■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.41■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 PCGF6Q9BYE7 350 aa18.41■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 SPG7Q9UQ90 795 aa18.41■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 PHF14O94880 888 aa18.4■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 C1QTNF8P60827 252 aa18.4■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 ATG3Q9NT62 314 aa18.4■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 CEP350Q5VT06 3117 aa18.4■□□□□ 0.54
CNGA3-202ENST00000393503 AK7Q96M32 723 aa18.39■□□□□ 0.53
CNGA3-202ENST00000393503 IGSF1Q8N6C5 1336 aa18.39■□□□□ 0.53
CNGA3-202ENST00000393503 CLSPNQ9HAW4 1339 aa18.39■□□□□ 0.53
CNGA3-202ENST00000393503 KDRP35968 1356 aa18.39■□□□□ 0.53
CNGA3-202ENST00000393503 FLAD1Q8NFF5 587 aa18.38■□□□□ 0.53
CNGA3-202ENST00000393503 PANK3Q9H999 370 aa18.38■□□□□ 0.53
CNGA3-202ENST00000393503 TMOD3Q9NYL9 352 aa18.38■□□□□ 0.53
CNGA3-202ENST00000393503 CD2APQ9Y5K6 639 aa18.38■□□□□ 0.53
CNGA3-202ENST00000393503 IFNL2Q8IZJ0 200 aa18.37■□□□□ 0.53
CNGA3-202ENST00000393503 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CNGA3-202ENST00000393503 AEBP1Q8IUX7 1158 aa18.36■□□□□ 0.53
CNGA3-202ENST00000393503 WWC3Q9ULE0 1092 aa18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms