RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381558.6

TNNT3-204, Transcript of troponin T3, fast skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNNT3, Length 1,258 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3-204ENST00000381558 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.24■■□□□ 1.15
TNNT3-204ENST00000381558 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TNNT3-204ENST00000381558 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.23■■□□□ 1.15
TNNT3-204ENST00000381558 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.22■■□□□ 1.15
TNNT3-204ENST00000381558 POLKQ9UBT6 870 aa22.22■■□□□ 1.15
TNNT3-204ENST00000381558 BTAF1O14981 1849 aa22.22■■□□□ 1.15
TNNT3-204ENST00000381558 TXNRD1Q16881 649 aa22.21■■□□□ 1.15
TNNT3-204ENST00000381558 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.21■■□□□ 1.15
TNNT3-204ENST00000381558 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.21■■□□□ 1.15
TNNT3-204ENST00000381558 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.21■■□□□ 1.15
TNNT3-204ENST00000381558 PROM2Q8N271 834 aa22.2■■□□□ 1.14
TNNT3-204ENST00000381558 NCAPD2Q15021 1401 aa22.2■■□□□ 1.14
TNNT3-204ENST00000381558 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.18■■□□□ 1.14
TNNT3-204ENST00000381558 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TNNT3-204ENST00000381558 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.17■■□□□ 1.14
TNNT3-204ENST00000381558 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.17■■□□□ 1.14
TNNT3-204ENST00000381558 MORC1Q86VD1 984 aa22.17■■□□□ 1.14
TNNT3-204ENST00000381558 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TNNT3-204ENST00000381558 STK32BQ9NY57 414 aa22.15■■□□□ 1.14
TNNT3-204ENST00000381558 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.14■■□□□ 1.14
TNNT3-204ENST00000381558 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TNNT3-204ENST00000381558 EYA1Q99502 592 aa22.14■■□□□ 1.13
TNNT3-204ENST00000381558 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.13■■□□□ 1.13
TNNT3-204ENST00000381558 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TNNT3-204ENST00000381558 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TNNT3-204ENST00000381558 SLC15A2Q16348 729 aa22.11■■□□□ 1.13
TNNT3-204ENST00000381558 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.11■■□□□ 1.13
TNNT3-204ENST00000381558 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
TNNT3-204ENST00000381558 SPG7Q9UQ90 795 aa22.11■■□□□ 1.13
TNNT3-204ENST00000381558 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TNNT3-204ENST00000381558 SPON1Q9HCB6 807 aa22.1■■□□□ 1.13
TNNT3-204ENST00000381558 CASZ1Q86V15 1759 aa22.1■■□□□ 1.13
TNNT3-204ENST00000381558 PAPPAQ13219 1627 aa22.09■■□□□ 1.13
TNNT3-204ENST00000381558 CYP27B1O15528 508 aa22.08■■□□□ 1.13
TNNT3-204ENST00000381558 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.07■■□□□ 1.12
TNNT3-204ENST00000381558 LY75O60449 1722 aa22.07■■□□□ 1.12
TNNT3-204ENST00000381558 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TNNT3-204ENST00000381558 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TNNT3-204ENST00000381558 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TNNT3-204ENST00000381558 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.05■■□□□ 1.12
TNNT3-204ENST00000381558 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.03■■□□□ 1.12
TNNT3-204ENST00000381558 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.03■■□□□ 1.12
TNNT3-204ENST00000381558 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TNNT3-204ENST00000381558 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.02■■□□□ 1.12
TNNT3-204ENST00000381558 ITGB4P16144 1822 aa22.01■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 QSER1Q2KHR3 1735 aa22■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 PHKG2P15735 406 aa22■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 ZNF827Q17R98 1081 aa21.99■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 AKT1S1Q96B36 256 aa21.99■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 ZBTB7AO95365 584 aa21.98■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.98■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 MTFR1LQ9H019 292 aa21.98■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 IL13P35225 146 aa21.97■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 PALLDQ8WX93 1383 aa21.97■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 MTHFSP49914 203 aa21.96■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 KDRP35968 1356 aa21.96■■□□□ 1.11
TNNT3-204ENST00000381558 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.95■■□□□ 1.1
TNNT3-204ENST00000381558 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.94■■□□□ 1.1
TNNT3-204ENST00000381558 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.94■■□□□ 1.1
TNNT3-204ENST00000381558 PIGBQ92521 554 aa21.94■■□□□ 1.1
TNNT3-204ENST00000381558 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.94■■□□□ 1.1
TNNT3-204ENST00000381558 C5P01031 1676 aa21.94■■□□□ 1.1
TNNT3-204ENST00000381558 KCNQ4P56696 695 aa21.93■■□□□ 1.1
TNNT3-204ENST00000381558 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.93■■□□□ 1.1
TNNT3-204ENST00000381558 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TNNT3-204ENST00000381558 PTGER2P43116 358 aa21.92■■□□□ 1.1
TNNT3-204ENST00000381558 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
TNNT3-204ENST00000381558 DCAF5Q96JK2 942 aa21.92■■□□□ 1.1
TNNT3-204ENST00000381558 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.92■■□□□ 1.1
TNNT3-204ENST00000381558 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.91■■□□□ 1.1
TNNT3-204ENST00000381558 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.91■■□□□ 1.1
TNNT3-204ENST00000381558 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.9■■□□□ 1.1
TNNT3-204ENST00000381558 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TNNT3-204ENST00000381558 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.9■■□□□ 1.1
TNNT3-204ENST00000381558 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.88■■□□□ 1.09
TNNT3-204ENST00000381558 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.87■■□□□ 1.09
TNNT3-204ENST00000381558 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TNNT3-204ENST00000381558 C4BP0C0L5 1744 aa21.86■■□□□ 1.09
TNNT3-204ENST00000381558 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.86■■□□□ 1.09
TNNT3-204ENST00000381558 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.85■■□□□ 1.09
TNNT3-204ENST00000381558 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.85■■□□□ 1.09
TNNT3-204ENST00000381558 SIK1P57059 783 aa21.85■■□□□ 1.09
TNNT3-204ENST00000381558 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.85■■□□□ 1.09
TNNT3-204ENST00000381558 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TNNT3-204ENST00000381558 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TNNT3-204ENST00000381558 POLD1P28340 1107 aa21.84■■□□□ 1.09
TNNT3-204ENST00000381558 CABP4P57796 275 aa21.84■■□□□ 1.09
TNNT3-204ENST00000381558 ARXQ96QS3 562 aa21.84■■□□□ 1.09
TNNT3-204ENST00000381558 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.83■■□□□ 1.09
TNNT3-204ENST00000381558 AK7Q96M32 723 aa21.83■■□□□ 1.09
TNNT3-204ENST00000381558 ATG3Q9NT62 314 aa21.83■■□□□ 1.09
TNNT3-204ENST00000381558 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.82■■□□□ 1.08
TNNT3-204ENST00000381558 MSH5O43196 834 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms