RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 SART3Q15020 963 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 E2F5Q15329 346 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 LONRF3Q496Y0 759 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 STRCQ7RTU9 1775 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM210AQ96ND0 272 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 MED4Q9NPJ6 270 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 DYNC1I1O14576 645 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 CTAGE5O15320 804 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 KIF3AQ9Y496 699 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 OATP04181 439 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP9Q49MG5 647 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 KDM5DQ9BY66 1539 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 C16orf87Q6PH81 154 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 NPATQ14207 1427 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 TSC1Q92574 1164 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 RPAINQ86UA6 219 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 DEPDC5O75140 1603 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 C22orf23Q9BZE7 217 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 CLEC4GQ6UXB4 293 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 TSPYL1Q9H0U9 437 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 DMRT2Q9Y5R5 561 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 FSD2A1L4K1 749 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 CD151P48509 253 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 TAF4BQ92750 862 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 MS4A1P11836 297 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 PKD2Q13563 968 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM74Q86UV6 250 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM73Q86UV7 250 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 SPATA32Q96LK8 384 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC66A2RUB6 948 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 SKAP1Q86WV1 359 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 DRC1Q96MC2 740 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 GOPCQ9HD26 462 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP7AQ04656 1500 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 H0YHG0 523 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC26A8Q96RN1 970 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 MBD5Q9P267 1494 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 BDNFP23560 247 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 GABBR1Q9UBS5 961 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 SLFN14P0C7P3 912 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 ADRA2BP18089 450 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 PMM1Q92871 262 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.27□□□□□ -1.08
RABGEF1-202ENST00000380828 CREB3O43889 395 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 SH3BP5O60239 455 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 MYO3AQ8NEV4 1616 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD62A6NC57 917 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 RGL2O15211 777 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 PDE4AP27815 886 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 ABL2P42684 1182 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 ZSCAN26Q16670 478 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.091e-6■■■□□ 15.1
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 PLA2R1Q13018 1463 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 GPATCH3Q96I76 525 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC27Q9C0I9 530 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 SUN2Q9UH99 717 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-202ENST00000380828 GIMAP6Q6P9H5 292 aa8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.3 ms