RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373257.7

LPIN3-201, Transcript of lipin 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene LPIN3, Length 4,363 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3-201ENST00000373257 EYA1Q99502 592 aa14.64□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.64□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.64□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 CPLX1O14810 134 aa14.64□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.64□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.64□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 MYD88Q99836 296 aa14.64□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 NEO1Q92859 1461 aa14.63□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.63□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.63□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 KDM4AO75164 1064 aa14.63□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.63□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 KLHL34Q8N239 644 aa14.63□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.63□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 GCP02774 474 aa14.62□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 RLBP1P12271 317 aa14.62□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.62□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.62□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.62□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 GSE1Q14687 1217 aa14.62□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.62□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.62□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.62□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.61□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.61□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.61□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 NGLY1Q96IV0 654 aa14.61□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 MSH6P52701 1360 aa14.61□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.6□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.6□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 MEIS3Q99687 375 aa14.6□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.6□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.6□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.6□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 STARD3NLO95772 234 aa14.59□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 MTMR7Q9Y216 660 aa14.59□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.59□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 PIK3C2GO75747 1445 aa14.59□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.59□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 IL16Q14005 1332 aa14.59□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.59□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.59□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 PTPRTO14522 1441 aa14.58□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 GPTP24298 496 aa14.58□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.58□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.58□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.58□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.58□□□□□ -0.07
LPIN3-201ENST00000373257 NRDCO43847 1150 aa14.58□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.58□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 FLT4P35916 1363 aa14.58□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.58□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 EXOC5O00471 708 aa14.57□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.57□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.57□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 A0A087WZG4 1122 aa14.57□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.57□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 MX1P20591 662 aa14.57□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 VAMP4O75379 141 aa14.57□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 PLA2R1Q13018 1463 aa14.57□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 NUCB2P80303 420 aa14.56□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.56□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.56□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 HOXC9P31274 260 aa14.56□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 RABEP1Q15276 862 aa14.56□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.56□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 TSPOAP1O95153 1857 aa14.56□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.56□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.55□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 STK3Q13188 491 aa14.55□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.55□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 PTPRCP08575 1304 aa14.55□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 IL13P35225 146 aa14.54□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 BICD2Q8TD16 824 aa14.54□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 HYPKQ9NX55 129 aa14.54□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 METP08581 1390 aa14.54□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 VPS53Q5VIR6 699 aa14.54□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.54□□□□□ -0.08
LPIN3-201ENST00000373257 PREX2Q70Z35 1606 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 138.3 ms