RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHD4Q14839 1912 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC3-204ENST00000373166 HOXC9P31274 260 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC3-204ENST00000373166 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC3-204ENST00000373166 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC3-204ENST00000373166 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC24A1O60721 1099 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 NSD2O96028 1365 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 MSH5O43196 834 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 FBLN1P23142 703 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP47Q96K76 1375 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 GRIN3BO60391 1043 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 TESK2Q96S53 571 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 MEGF6O75095 1541 aa26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3-204ENST00000373166 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 NBPF4Q96M43 638 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 RTL1A6NKG5 1358 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.889e-6■■■□□ 18.1
TRAPPC3-204ENST00000373166 LY75O60449 1722 aa26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3-204ENST00000373166 MSL1Q68DK7 614 aa26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC3-204ENST00000373166 FYB1O15117 783 aa26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC3-204ENST00000373166 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC3-204ENST00000373166 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC3-204ENST00000373166 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3-204ENST00000373166 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3-204ENST00000373166 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3-204ENST00000373166 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3-204ENST00000373166 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3-204ENST00000373166 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 INSRP06213 1382 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 PALLDQ8WX93 1383 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMF1P82094 1093 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 FLT4P35916 1363 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 CEP350Q5VT06 3117 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP27B1O15528 508 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 AK7Q96M32 723 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATP10DQ9P241 1426 aa26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 C5P01031 1676 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 CDCA8Q53HL2 280 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 PIGBQ92521 554 aa26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 PHF14O94880 888 aa26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPG7Q9UQ90 795 aa26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 IFFO2Q5TF58 517 aa26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 SSFA2P28290 1259 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 SIK1P57059 783 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 C4BP0C0L5 1744 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMIM5Q71RC9 77 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADCY9O60503 1353 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 HSPA6P17066 643 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 NCAPD2Q15021 1401 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 GNPATO15228 680 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATP6V1AP38606 617 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 EYA1Q99502 592 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.45■■□□□ 1.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 ITPK1Q13572 414 aa26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3-204ENST00000373166 PHKG2P15735 406 aa26.44■■□□□ 1.82
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