RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.21□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.21□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 RFC5P40937 340 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 AAMPQ13685 434 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.21□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 CRBNQ96SW2 442 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 MYO3AQ8NEV4 1616 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 PADI6Q6TGC4 694 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 TBC1D2Q9BYX2 928 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 PHF14O94880 888 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 IRF5Q13568 498 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 CDCA8Q53HL2 280 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 SLAIN1Q8ND83 568 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRB1O14514 1584 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 SLIT1O75093 1534 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 TMF1P82094 1093 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 ALKQ9UM73 1620 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 EID1Q9Y6B2 187 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 POM121CA8CG34 1229 aa9.16□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 C8orf34Q49A92 452 aa9.16□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP23Q9P227 1491 aa9.16□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 SEC24BO95487 1268 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 IER5LQ5T953 404 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 TESK2Q96S53 571 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 EPAS1Q99814 870 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-201ENST00000372616 PTPRMP28827 1452 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 CGNL1Q0VF96 1302 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 ABL2P42684 1182 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9.13□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 DIP2AQ14689 1571 aa9.13□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 DLC1Q96QB1 1528 aa9.13□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa9.13□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 OATP04181 439 aa9.13□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF428Q96B54 188 aa9.13□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.13□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa9.13□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 HAX1O00165 279 aa9.12□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.12□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 MTMR7Q9Y216 660 aa9.12□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa9.12□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 CARNS1A5YM72 827 aa9.12□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 PDE3AQ14432 1141 aa9.12□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.12□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.12□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.12□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.12□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.12□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.12□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.12□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF521Q96K83 1311 aa9.11□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 PLIN1O60240 522 aa9.11□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 QPCTQ16769 361 aa9.11□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 ABCC11Q96J66 1382 aa9.11□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.1□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 SPIRE2Q8WWL2 714 aa9.1□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 SIRT1Q96EB6 747 aa9.1□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 DISP3Q9P2K9 1392 aa9.1□□□□□ -0.95
CTPS1-201ENST00000372616 POTEFA5A3E0 1075 aa9.1□□□□□ -0.95
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