RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372339.3

IPO13-201, Transcript of importin 13, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene IPO13, Length 1,201 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO13-201ENST00000372339 ZNF827Q17R98 1081 aa28.15■■■□□ 2.1
IPO13-201ENST00000372339 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
IPO13-201ENST00000372339 INSRP06213 1382 aa28.14■■■□□ 2.1
IPO13-201ENST00000372339 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.14■■■□□ 2.1
IPO13-201ENST00000372339 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.14■■■□□ 2.1
IPO13-201ENST00000372339 MTFR1LQ9H019 292 aa28.14■■■□□ 2.1
IPO13-201ENST00000372339 PAPPAQ13219 1627 aa28.14■■■□□ 2.09
IPO13-201ENST00000372339 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.12■■■□□ 2.09
IPO13-201ENST00000372339 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.12■■■□□ 2.09
IPO13-201ENST00000372339 MYOM1P52179 1685 aa28.12■■■□□ 2.09
IPO13-201ENST00000372339 FLT4P35916 1363 aa28.11■■■□□ 2.09
IPO13-201ENST00000372339 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
IPO13-201ENST00000372339 KCNQ4P56696 695 aa28.11■■■□□ 2.09
IPO13-201ENST00000372339 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.11■■■□□ 2.09
IPO13-201ENST00000372339 AKT1S1Q96B36 256 aa28.1■■■□□ 2.09
IPO13-201ENST00000372339 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.1■■■□□ 2.09
IPO13-201ENST00000372339 NSD2O96028 1365 aa28.1■■■□□ 2.09
IPO13-201ENST00000372339 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.09■■■□□ 2.09
IPO13-201ENST00000372339 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.09■■■□□ 2.09
IPO13-201ENST00000372339 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.09■■■□□ 2.09
IPO13-201ENST00000372339 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.09■■■□□ 2.09
IPO13-201ENST00000372339 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.08■■■□□ 2.09
IPO13-201ENST00000372339 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
IPO13-201ENST00000372339 YY1P25490 414 aa28.07■■■□□ 2.08
IPO13-201ENST00000372339 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
IPO13-201ENST00000372339 SYT17Q9BSW7 474 aa28.04■■■□□ 2.08
IPO13-201ENST00000372339 ARXQ96QS3 562 aa28.03■■■□□ 2.08
IPO13-201ENST00000372339 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.02■■■□□ 2.08
IPO13-201ENST00000372339 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.02■■■□□ 2.08
IPO13-201ENST00000372339 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.02■■■□□ 2.08
IPO13-201ENST00000372339 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
IPO13-201ENST00000372339 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28■■■□□ 2.07
IPO13-201ENST00000372339 CYP27B1O15528 508 aa27.99■■■□□ 2.07
IPO13-201ENST00000372339 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
IPO13-201ENST00000372339 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.99■■■□□ 2.07
IPO13-201ENST00000372339 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.98■■■□□ 2.07
IPO13-201ENST00000372339 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
IPO13-201ENST00000372339 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.98■■■□□ 2.07
IPO13-201ENST00000372339 LY75O60449 1722 aa27.98■■■□□ 2.07
IPO13-201ENST00000372339 POLKQ9UBT6 870 aa27.97■■■□□ 2.07
IPO13-201ENST00000372339 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
IPO13-201ENST00000372339 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.95■■■□□ 2.06
IPO13-201ENST00000372339 EYA1Q99502 592 aa27.95■■■□□ 2.06
IPO13-201ENST00000372339 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.93■■■□□ 2.06
IPO13-201ENST00000372339 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
IPO13-201ENST00000372339 NCAPD2Q15021 1401 aa27.92■■■□□ 2.06
IPO13-201ENST00000372339 POLD1P28340 1107 aa27.92■■■□□ 2.06
IPO13-201ENST00000372339 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.92■■■□□ 2.06
IPO13-201ENST00000372339 UTRNP46939 3433 aa27.92■■■□□ 2.06
IPO13-201ENST00000372339 PANK3Q9H999 370 aa27.91■■■□□ 2.06
IPO13-201ENST00000372339 SPG7Q9UQ90 795 aa27.91■■■□□ 2.06
IPO13-201ENST00000372339 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.91■■■□□ 2.06
IPO13-201ENST00000372339 MSH5O43196 834 aa27.9■■■□□ 2.06
IPO13-201ENST00000372339 PALLDQ8WX93 1383 aa27.89■■■□□ 2.06
IPO13-201ENST00000372339 MAP3K5Q99683 1374 aa27.89■■■□□ 2.06
IPO13-201ENST00000372339 KLHL34Q8N239 644 aa27.89■■■□□ 2.06
IPO13-201ENST00000372339 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
IPO13-201ENST00000372339 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.87■■■□□ 2.05
IPO13-201ENST00000372339 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
IPO13-201ENST00000372339 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
IPO13-201ENST00000372339 PIGBQ92521 554 aa27.87■■■□□ 2.05
IPO13-201ENST00000372339 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.85■■■□□ 2.05
IPO13-201ENST00000372339 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
IPO13-201ENST00000372339 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.85■■■□□ 2.05
IPO13-201ENST00000372339 ITGB4P16144 1822 aa27.83■■■□□ 2.05
IPO13-201ENST00000372339 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.82■■■□□ 2.04
IPO13-201ENST00000372339 MSL1Q68DK7 614 aa27.81■■■□□ 2.04
IPO13-201ENST00000372339 C5P01031 1676 aa27.81■■■□□ 2.04
IPO13-201ENST00000372339 PHKG2P15735 406 aa27.8■■■□□ 2.04
IPO13-201ENST00000372339 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
IPO13-201ENST00000372339 GPR162Q16538 588 aa27.8■■■□□ 2.04
IPO13-201ENST00000372339 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.8■■■□□ 2.04
IPO13-201ENST00000372339 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.79■■■□□ 2.04
IPO13-201ENST00000372339 MORC1Q86VD1 984 aa27.78■■■□□ 2.04
IPO13-201ENST00000372339 NLGN2Q8NFZ4 835 aa27.78■■■□□ 2.04
IPO13-201ENST00000372339 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.77■■■□□ 2.04
IPO13-201ENST00000372339 AK7Q96M32 723 aa27.77■■■□□ 2.04
IPO13-201ENST00000372339 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.76■■■□□ 2.04
IPO13-201ENST00000372339 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.76■■■□□ 2.03
IPO13-201ENST00000372339 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
IPO13-201ENST00000372339 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.76■■■□□ 2.03
IPO13-201ENST00000372339 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.75■■■□□ 2.03
IPO13-201ENST00000372339 SIK1P57059 783 aa27.75■■■□□ 2.03
IPO13-201ENST00000372339 AMIGO3Q86WK7 504 aa27.75■■■□□ 2.03
IPO13-201ENST00000372339 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
IPO13-201ENST00000372339 SMIM5Q71RC9 77 aa27.74■■■□□ 2.03
IPO13-201ENST00000372339 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
IPO13-201ENST00000372339 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.73■■■□□ 2.03
IPO13-201ENST00000372339 C4BP0C0L5 1744 aa27.72■■■□□ 2.03
IPO13-201ENST00000372339 PHF14O94880 888 aa27.72■■■□□ 2.03
IPO13-201ENST00000372339 LINC00116Q8NCU8 138 aa27.72■■■□□ 2.03
IPO13-201ENST00000372339 ATG3Q9NT62 314 aa27.71■■■□□ 2.03
IPO13-201ENST00000372339 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
IPO13-201ENST00000372339 CHD4Q14839 1912 aa27.69■■■□□ 2.02
IPO13-201ENST00000372339 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
IPO13-201ENST00000372339 ITPK1Q13572 414 aa27.69■■■□□ 2.02
IPO13-201ENST00000372339 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.69■■■□□ 2.02
IPO13-201ENST00000372339 ATP6V1AP38606 617 aa27.68■■■□□ 2.02
IPO13-201ENST00000372339 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
IPO13-201ENST00000372339 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms